EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000016880 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5038 bases
Position: chrPEQF01099470.1:648572-653609
Accession: 111647442
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000021608	RRM_1	PF00076.22	2.5e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000022319	-	3462	XM_023397043	ENSSLDP00000021608	449 (aa)	XP_023252811	UPI000C6F9BCF

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.465	ENSG00000102241	HTATSF1	100	55.466	Homo_sapiens
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	84.735	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	84.071	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	56.164	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	53	56.912	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	80.617	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	82.599	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	83.224	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	83.224	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	83.991	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	83.553	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	85.167	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	85.167	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	92	62.381	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.381	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000016880	htatsf1	78	63.429	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.000	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000016880	htatsf1	86	57.772	ENSANAG00000025458	-	52	58.047	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	80.837	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	81.057	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	69.348	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	69.197	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	94	58.891	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	51	61.298	Bos_taurus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	94	58.237	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	55	58.237	Bos_taurus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	94	58.891	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	51	61.298	Bos_taurus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	77	40.171	WBGene00022025	Y65B4A.1	75	39.316	Caenorhabditis_elegans
ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	59.294	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	54	59.294	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	97	57.303	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	54	58.716	Canis_familiaris
ENSSLDG00000016880	htatsf1	97	57.303	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	53	58.716	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000016880	htatsf1	94	59.122	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	53	61.538	Capra_hircus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	95	59.039	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	54	59.767	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000016880	htatsf1	85	62.148	ENSCCAG00000025329	-	59	58.685	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	60.187	ENSCCAG00000022701	-	54	60.187	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.072	ENSCATG00000029963	HTATSF1	54	58.770	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000016880	htatsf1	91	58.473	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	58.234	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.072	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	54	58.770	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	61.404	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	61.184	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000016880	htatsf1	88	56.250	ENSCING00000005914	-	89	43.478	Ciona_intestinalis
ENSSLDG00000016880	htatsf1	86	40.089	ENSCSAVG00000000371	-	90	40.947	Ciona_savignyi
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.239	ENSCANG00000028495	HTATSF1	54	58.945	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	59.907	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	51	61.005	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	80.624	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	82.183	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	67.982	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	67.544	Danio_rerio
ENSSLDG00000016880	htatsf1	97	58.691	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	53	59.397	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	84	44.241	FBgn0037081	barc	65	43.316	Drosophila_melanogaster
ENSSLDG00000016880	htatsf1	87	55.446	ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.446	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000016880	htatsf1	95	59.039	ENSEASG00005003440	HTATSF1	52	59.767	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	95	59.039	ENSECAG00000009156	HTATSF1	52	59.767	Equus_caballus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	64.363	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	66.379	Esox_lucius
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	57.631	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	54	58.333	Felis_catus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	59.002	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	59.002	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	58.469	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	59.112	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	81.153	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	79.956	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	81	76.923	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	76.923	Gadus_morhua
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	59.170	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	58.952	Gallus_gallus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	79.733	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	79.733	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	80.444	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	80.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.465	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	54	58.851	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	80.837	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	81.057	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.108	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	54	58.851	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	69.351	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	70.000	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	64.693	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	65.466	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	59.091	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	56	59.584	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	81.514	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	81.514	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	80.921	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	80.921	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	61.283	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.283	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	46.723	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	45.912	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	94	60.000	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	61	57.931	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.072	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	54	58.770	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.072	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	54	58.770	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.072	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	60	58.770	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.072	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	54	58.770	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	84.598	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	84.598	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	81.057	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	81.278	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	61.449	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	97	61.449	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	59.629	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	54	59.629	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.371	ENSMICG00000009348	HTATSF1	55	59.080	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	58.411	ENSMOCG00000022370	-	52	59.233	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	59.813	ENSMOCG00000023007	-	52	60.911	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	81.960	ENSMMOG00000011013	htatsf1	100	81.737	Mola_mola
ENSSLDG00000016880	htatsf1	55	59.924	ENSMODG00000000199	-	89	57.676	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	60.131	ENSMODG00000014087	-	98	60.044	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	83.742	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	83.742	Monopterus_albus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.447	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	51	63.131	Mus_caroli
ENSSLDG00000016880	htatsf1	86	63.131	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	50	63.131	Mus_musculus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.447	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	50	63.131	Mus_spretus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	57.991	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	53	58.756	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000016880	htatsf1	95	58.219	ENSMLUG00000028418	-	52	59.670	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	95	55.658	ENSMLUG00000009234	-	55	57.381	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.124	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	55	59.112	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	80.617	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	80.837	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	57.906	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	54	58.597	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000016880	htatsf1	88	64.109	ENSMEUG00000004133	-	93	64.109	Notamacropus_eugenii
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	80.837	ENSONIG00000008638	htatsf1	100	81.057	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	91	60.287	ENSOANG00000011674	-	98	60.287	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	94	58.796	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	54	58.796	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	77.753	ENSORLG00000002356	htatsf1	100	76.872	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	77.412	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	77.412	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	77.533	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	77.533	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	79.691	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.470	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000016880	htatsf1	94	57.143	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	53	58.314	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	58.156	ENSOARG00000000481	-	52	58.156	Ovis_aries
ENSSLDG00000016880	htatsf1	94	59.353	ENSOARG00000011215	-	51	61.779	Ovis_aries
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.465	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	54	58.851	Pan_paniscus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	57.859	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	54	58.565	Panthera_pardus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	96	58.465	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	54	58.851	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	66.164	ENSPKIG00000024852	htatsf1	99	65.443	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000016880	htatsf1	73	67.463	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	95	67.164	Pelodiscus_sinensis
ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	75.442	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	75.442	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	86	62.785	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	62.785	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000016880	htatsf1	98	56.637	ENSPCIG00000018896	-	98	56.637	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	89	63.017	ENSPCIG00000030173	-	90	63.017	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	81.514	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	81.514	Poecilia_formosa
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ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	81.514	ENSPREG00000007811	htatsf1	100	81.514	Poecilia_reticulata
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ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	54.118	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	56	53.882	Procavia_capensis
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