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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000017407 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo1a (1 of many)
Alias: im:7151655
Full Name: exportin 1 (CRM1 homolog%2C yeast) a
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7990 bases
Position: chrPEQF01098958.1:165364-173353
Accession: ZDB-GENE-050309-201
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000022307	CRM1_C	PF08767.11	5.5e-132	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000023029	-	1743	-	ENSSLDP00000022307	580 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.727	ENSSLDG00000019530	-	59	92.727

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.909	ENSG00000082898	XPO1	51	90.909	Homo_sapiens
ENSSLDG00000017407	xpo1a	93	99.814	ENSAPOG00000002354	xpo1a	59	99.814	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.727	ENSAPOG00000004984	-	54	92.727	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSAMEG00000003460	XPO1	51	91.636	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.909	ENSACIG00000010818	-	59	92.909	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.727	ENSACIG00000010259	xpo1a	59	98.727	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	99.636	ENSAOCG00000018914	xpo1a	52	99.636	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.909	ENSAOCG00000010121	-	59	92.909	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.909	ENSAPEG00000007038	-	59	92.909	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	99.636	ENSAPEG00000006583	xpo1a	57	99.636	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.909	ENSATEG00000008816	-	54	92.909	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	99.091	ENSATEG00000020750	xpo1a	59	99.091	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.818	ENSAPLG00000004008	XPO1	51	91.818	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.818	ENSACAG00000002501	XPO1	51	91.818	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.909	ENSANAG00000020802	XPO1	52	90.909	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.909	ENSACLG00000015192	-	54	92.909	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.545	ENSACLG00000015669	xpo1a	59	98.545	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	95.091	ENSAMXG00000003069	xpo1a	58	95.091	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	93.273	ENSAMXG00000012704	xpo1b	59	93.273	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSBTAG00000013254	XPO1	51	91.636	Bos_taurus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	94	53.176	WBGene00002078	xpo-1	91	52.632	Caenorhabditis_elegans
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.909	ENSCJAG00000008877	XPO1	51	90.909	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSCAFG00000003050	XPO1	51	91.636	Canis_familiaris
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSCAFG00020026910	XPO1	55	91.636	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSCHIG00000018132	XPO1	51	91.636	Capra_hircus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSTSYG00000004330	XPO1	51	91.636	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	87.636	ENSCAPG00000006454	-	97	87.636	Cavia_aperea
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSCPOG00000034053	XPO1	52	91.636	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.909	ENSCATG00000032674	XPO1	59	90.909	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSCLAG00000012953	XPO1	51	91.636	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.909	ENSCSAG00000014606	XPO1	51	90.909	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.818	ENSCPBG00000026239	XPO1	55	91.818	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	82.182	ENSCING00000024562	-	51	82.182	Ciona_intestinalis
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	80.727	ENSCSAVG00000005965	-	54	80.727	Ciona_savignyi
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.909	ENSCANG00000028883	XPO1	98	90.909	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSCGRG00001000263	Xpo1	51	91.636	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSCGRG00000001520	Xpo1	51	91.636	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSCSEG00000001693	XPO1	58	91.636	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.545	ENSCVAG00000016788	-	51	92.545	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	97.818	ENSCVAG00000016558	xpo1a	52	97.818	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	93.455	ENSDARG00000078041	xpo1a	51	93.455	Danio_rerio
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	93.091	ENSDARG00000063229	xpo1b	51	93.091	Danio_rerio
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSDNOG00000005805	XPO1	51	91.636	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	70.236	FBgn0020497	emb	52	70.236	Drosophila_melanogaster
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	87.114	ENSEBUG00000012580	-	71	87.114	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSEASG00005007223	XPO1	51	91.636	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSECAG00000024920	XPO1	56	91.636	Equus_caballus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.000	ENSELUG00000014306	-	57	90.000	Esox_lucius
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	95.636	ENSELUG00000012707	xpo1a	58	95.636	Esox_lucius
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSFCAG00000002702	XPO1	51	91.636	Felis_catus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSFALG00000010989	XPO1	51	91.636	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSFDAG00000014716	XPO1	52	91.636	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000017407	xpo1a	87	94.355	ENSFHEG00000018974	-	97	94.355	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	97.455	ENSFHEG00000002412	xpo1a	52	97.455	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.727	ENSGMOG00000019063	-	51	92.727	Gadus_morhua
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	94.182	ENSGMOG00000004441	xpo1a	52	94.182	Gadus_morhua
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.818	ENSGALG00000029476	XPO1	51	91.818	Gallus_gallus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	97.273	ENSGAFG00000004408	xpo1a	59	97.273	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.727	ENSGAFG00000003355	-	56	92.727	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.727	ENSGACG00000019736	xpo1a	52	98.727	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.727	ENSGACG00000002743	-	51	92.727	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSGAGG00000017558	XPO1	51	91.636	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.909	ENSGGOG00000034878	XPO1	51	90.909	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	93.091	ENSHBUG00000020037	-	54	93.091	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.545	ENSHBUG00000007128	xpo1a	52	98.545	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSHGLG00000003115	XPO1	51	91.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSHGLG00100012227	XPO1	51	91.636	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.727	ENSHCOG00000006949	XPO1	59	92.727	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	94.000	ENSIPUG00000024394	XPO1	51	94.000	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	93.636	ENSIPUG00000012891	Xpo1	51	93.636	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.455	ENSSTOG00000016122	XPO1	52	91.455	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSJJAG00000020468	Xpo1	51	91.636	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.727	ENSKMAG00000016218	-	56	92.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.000	ENSKMAG00000004830	xpo1a	52	98.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	97.834	ENSLBEG00000002104	xpo1a	60	97.834	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.909	ENSLBEG00000005740	-	52	92.909	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000017407	xpo1a	96	68.319	ENSLACG00000018213	XPO1	51	69.120	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	93.636	ENSLOCG00000016095	xpo1b	51	93.636	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.091	ENSLAFG00000014553	XPO1	51	91.091	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.909	ENSMFAG00000038679	XPO1	51	90.909	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.909	ENSMMUG00000006941	XPO1	53	90.110	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.909	ENSMNEG00000030909	XPO1	51	90.909	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	90.909	ENSMLEG00000032004	XPO1	51	90.909	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.727	ENSMAMG00000023037	xpo1a	55	98.727	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.727	ENSMAMG00000010568	-	58	92.727	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.545	ENSMZEG00005005105	xpo1a	52	98.545	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.909	ENSMZEG00005018158	-	56	92.909	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.818	ENSMGAG00000001496	-	76	91.818	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSMAUG00000006769	Xpo1	54	91.636	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSMICG00000027770	XPO1	51	91.636	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.455	ENSMOCG00000012169	Xpo1	51	91.455	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	93.273	ENSMMOG00000008001	-	59	93.273	Mola_mola
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.545	ENSMMOG00000018767	xpo1a	59	98.545	Mola_mola
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	89.818	ENSMODG00000002831	XPO1	51	89.818	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.727	ENSMALG00000008617	xpo1a	58	98.727	Monopterus_albus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	93.091	ENSMALG00000007085	-	56	93.091	Monopterus_albus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.455	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	88	79.200	Mus_caroli
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.455	ENSMUSG00000020290	Xpo1	88	79.200	Mus_musculus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.273	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	88	79.200	Mus_pahari
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.455	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	88	79.200	Mus_spretus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSMPUG00000005560	XPO1	51	91.636	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSMLUG00000010670	XPO1	51	91.636	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSNGAG00000022158	Xpo1	51	91.636	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.545	ENSNBRG00000003776	xpo1a	52	98.545	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	93.091	ENSNBRG00000012229	-	59	93.091	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	89.091	ENSNLEG00000009680	XPO1	50	89.091	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	ENSOPRG00000012615	XPO1	51	91.636	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.818	ENSODEG00000012632	XPO1	51	91.818	Octodon_degus
ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.364	ENSONIG00000000019	xpo1a	54	98.364	Oreochromis_niloticus
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