EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000017884 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5790 bases
Position: chrPEQF01098412.1:107786-113575
Accession: 111652243
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000022919	eRF1_2	PF03464.15	1.3e-31	1	1
ENSSLDP00000022919	eRF1_3	PF03465.15	1.6e-15	1	1
ENSSLDP00000022919	eRF1_1	PF03463.15	2.1e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000023655	-	1116	XM_023402456	ENSSLDP00000022919	371 (aa)	XP_023258224	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSG00000152684	PELO	100	76.883	Homo_sapiens
ENSSLDG00000017884	pelo	100	91.948	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000017884	pelo	67	95.547	ENSAPOG00000000616	pelo	90	95.547	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000017884	pelo	67	95.547	ENSAPOG00000023700	-	90	95.547	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.623	ENSAMEG00000007734	PELO	100	76.623	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000017884	pelo	91	93.452	ENSACIG00000014386	pelo	99	87.568	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	95.957	ENSAOCG00000023717	pelo	100	95.957	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000017884	pelo	100	92.208	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.208	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000017884	pelo	100	91.169	ENSATEG00000019550	pelo	100	91.169	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000017884	pelo	77	67.450	ENSAPLG00000013265	PELO	100	67.450	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000017884	pelo	97	77.067	ENSACAG00000004352	PELO	100	76.623	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.623	ENSANAG00000014096	PELO	100	76.623	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.052	ENSACLG00000010305	pelo	100	88.052	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000017884	pelo	97	89.757	ENSAMXG00000020299	pelo	100	89.323	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.623	ENSBTAG00000003268	PELO	99	76.623	Bos_taurus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	56.623	WBGene00011280	pelo-1	100	56.623	Caenorhabditis_elegans
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSCJAG00000035190	PELO	100	76.883	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSCAFG00020023234	PELO	100	76.883	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.364	ENSCHIG00000016410	PELO	99	76.364	Capra_hircus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.143	ENSTSYG00000005203	PELO	100	77.143	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.143	ENSCPOG00000027406	PELO	100	77.143	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSCCAG00000035600	PELO	100	76.883	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSCATG00000011829	PELO	100	76.883	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.623	ENSCLAG00000005043	PELO	100	76.623	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSCSAG00000016692	PELO	100	76.883	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSCHOG00000000523	PELO	100	76.883	Choloepus_hoffmanni
ENSSLDG00000017884	pelo	97	77.333	ENSCPBG00000007544	PELO	100	76.883	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000017884	pelo	97	61.126	ENSCING00000001979	-	100	61.299	Ciona_intestinalis
ENSSLDG00000017884	pelo	100	62.597	ENSCSAVG00000006158	-	100	62.597	Ciona_savignyi
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSCANG00000023382	PELO	100	76.883	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000017884	pelo	97	76.944	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	77.143	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000017884	pelo	97	77.748	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	77.922	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000017884	pelo	100	89.610	ENSCSEG00000008807	pelo	100	89.610	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.571	ENSCVAG00000016082	pelo	100	88.571	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	84.935	ENSDARG00000055477	pelo	100	84.935	Danio_rerio
ENSSLDG00000017884	pelo	100	73.834	ENSDNOG00000036721	PELO	100	73.834	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.403	ENSDORG00000016689	Pelo	100	77.403	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000017884	pelo	96	65.405	FBgn0011207	pelo	97	64.230	Drosophila_melanogaster
ENSSLDG00000017884	pelo	70	78.363	ENSEBUG00000004955	pelo	99	78.363	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.364	ENSEASG00005013348	PELO	100	76.364	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.052	ENSELUG00000023229	pelo	100	88.052	Esox_lucius
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.623	ENSFCAG00000032341	PELO	100	76.623	Felis_catus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.403	ENSFALG00000004559	PELO	100	77.403	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000017884	pelo	77	81.690	ENSFDAG00000002076	PELO	88	81.690	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.052	ENSFHEG00000009769	pelo	100	88.052	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000017884	pelo	98	87.003	ENSGMOG00000005849	pelo	100	87.013	Gadus_morhua
ENSSLDG00000017884	pelo	100	87.013	ENSGAFG00000019350	pelo	100	87.013	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000017884	pelo	100	91.688	ENSGACG00000007245	pelo	97	96.154	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000017884	pelo	97	77.333	ENSGAGG00000004018	PELO	100	76.883	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSGGOG00000012635	PELO	100	76.883	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.052	ENSHBUG00000005866	pelo	100	88.052	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.143	ENSHGLG00000005932	PELO	100	77.143	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000017884	pelo	100	75.065	ENSHGLG00100017627	PELO	100	75.065	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000017884	pelo	100	87.792	ENSHCOG00000016782	pelo	100	87.792	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000017884	pelo	100	85.974	ENSIPUG00000020627	pelo	100	85.974	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.143	ENSSTOG00000027378	PELO	100	77.143	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	75.065	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	75.065	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	89.091	ENSKMAG00000021305	pelo	100	89.091	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	90.649	ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.649	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.623	ENSLAFG00000020551	PELO	100	76.623	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSMFAG00000000651	PELO	100	76.883	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSMMUG00000039101	PELO	100	76.883	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSMNEG00000035538	PELO	100	76.883	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSMLEG00000039113	PELO	100	76.883	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000017884	pelo	97	91.421	ENSMAMG00000013260	pelo	100	90.909	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.083	ENSMZEG00005014258	pelo	100	88.083	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.143	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	77.143	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSMICG00000044040	PELO	100	76.883	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.403	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	77.403	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000017884	pelo	100	89.870	ENSMMOG00000001324	pelo	100	89.870	Mola_mola
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ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	76.883	Mus_musculus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.143	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	77.143	Mus_pahari
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	76.883	Mus_spretus
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ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.403	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	77.403	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.052	ENSNBRG00000011799	pelo	100	88.052	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSNLEG00000035970	PELO	100	76.883	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.364	ENSMEUG00000005468	PELO	100	76.364	Notamacropus_eugenii
ENSSLDG00000017884	pelo	98	75.989	ENSOPRG00000018793	PELO	100	75.989	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.403	ENSODEG00000017579	PELO	100	77.403	Octodon_degus
ENSSLDG00000017884	pelo	96	88.949	ENSONIG00000011511	pelo	100	88.831	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSOCUG00000023902	PELO	100	76.883	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.312	ENSORLG00000005827	pelo	100	88.312	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.571	ENSORLG00020016456	pelo	100	88.571	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.571	ENSORLG00015014447	pelo	100	88.611	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000017884	pelo	100	93.011	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.011	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.403	ENSOGAG00000027940	PELO	100	77.403	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.623	ENSOARG00000008324	PELO	99	76.623	Ovis_aries
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSPPAG00000038951	PELO	100	76.883	Pan_paniscus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.623	ENSPPRG00000018800	PELO	100	76.623	Panthera_pardus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.623	ENSPTIG00000019988	PELO	100	76.623	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.623	ENSPTRG00000034409	PELO	100	76.623	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSPANG00000010902	PELO	100	76.883	Papio_anubis
ENSSLDG00000017884	pelo	100	85.974	ENSPKIG00000015190	pelo	100	85.974	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000017884	pelo	97	77.600	ENSPSIG00000004971	PELO	100	77.143	Pelodiscus_sinensis
ENSSLDG00000017884	pelo	68	93.307	ENSPMGG00000014561	pelo	94	93.307	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.403	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	77.403	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSPCIG00000004880	PELO	100	76.883	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000017884	pelo	100	87.792	ENSPFOG00000007277	pelo	100	87.792	Poecilia_formosa
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ENSSLDG00000017884	pelo	100	76.883	ENSRROG00000035507	PELO	100	76.883	Rhinopithecus_roxellana
ENSSLDG00000017884	pelo	97	31.948	YNL001W	-	99	31.948	Saccharomyces_cerevisiae
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