EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000019141 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srp9
Alias: zgc:56668
Full Name: signal recognition particle 9
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1422 bases
Position: chrPEQF01099023.1:1055609-1057030
Accession: 111661397
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000024620	SRP9-21	PF05486.12	3.5e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000025397	-	240	XM_023414945	ENSSLDP00000024620	79 (aa)	XP_023270713	-

Gene Model

Click here to download ENSSLDG00000019141's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSLDG00000019141's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSG00000143742	SRP9	87	82.667	Homo_sapiens
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSAPOG00000006089	srp9	87	97.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSAMEG00000014744	SRP9	87	81.333	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000019141	srp9	95	68.000	ENSACIG00000022298	srp9	83	68.000	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSAOCG00000014643	srp9	87	97.333	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSAPEG00000004398	srp9	87	97.333	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000019141	srp9	95	98.667	ENSATEG00000014339	srp9	87	98.667	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000019141	srp9	75	83.051	ENSAPLG00000015368	SRP9	84	83.051	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSACAG00000005788	SRP9	87	82.667	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000019141	srp9	95	84.000	ENSANAG00000022626	SRP9	87	84.000	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000019141	srp9	95	98.667	ENSACLG00000018392	srp9	87	98.667	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSAMXG00000010366	srp9	87	97.333	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSBTAG00000033322	SRP9	87	81.333	Bos_taurus
ENSSLDG00000019141	srp9	94	54.054	WBGene00013984	ZK512.4	97	54.054	Caenorhabditis_elegans
ENSSLDG00000019141	srp9	95	84.000	ENSCJAG00000040095	SRP9	87	84.000	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSCAFG00000016162	SRP9	87	81.333	Canis_familiaris
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSCAFG00020003285	SRP9	87	81.333	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSCHIG00000006407	SRP9	87	81.333	Capra_hircus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	84.000	ENSTSYG00000026832	SRP9	87	84.000	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSCPOG00000033454	SRP9	87	82.667	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSCCAG00000034464	SRP9	87	82.667	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSCATG00000041813	SRP9	87	81.333	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000019141	srp9	95	70.667	ENSCLAG00000017687	-	87	70.667	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSCLAG00000001368	-	87	81.333	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSCHOG00000006096	-	87	81.333	Choloepus_hoffmanni
ENSSLDG00000019141	srp9	59	82.979	ENSCHOG00000012912	-	55	82.979	Choloepus_hoffmanni
ENSSLDG00000019141	srp9	95	85.333	ENSCPBG00000011999	SRP9	87	85.333	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000019141	srp9	95	80.000	ENSCANG00000012015	-	87	80.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSCANG00000030765	-	87	81.333	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSCGRG00001008910	Srp9	87	82.667	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000019141	srp9	68	77.778	ENSCGRG00000009651	Srp9	71	77.778	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000019141	srp9	95	94.667	ENSCSEG00000018438	srp9	87	94.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSCVAG00000001083	srp9	87	97.333	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	94.667	ENSDARG00000042851	srp9	87	94.667	Danio_rerio
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSDNOG00000013412	-	87	81.333	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	37.333	FBgn0035827	Srp9	97	37.333	Drosophila_melanogaster
ENSSLDG00000019141	srp9	95	70.667	ENSETEG00000012291	SRP9	87	70.667	Echinops_telfairi
ENSSLDG00000019141	srp9	95	73.333	ENSEBUG00000009080	srp9	89	73.333	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSECAG00000033839	SRP9	87	81.333	Equus_caballus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	74.667	ENSEEUG00000001344	SRP9	87	74.667	Erinaceus_europaeus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSELUG00000001506	srp9	89	97.333	Esox_lucius
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSFCAG00000010275	SRP9	54	82.432	Felis_catus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSFALG00000011689	SRP9	87	81.333	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000019141	srp9	95	84.000	ENSFDAG00000020469	SRP9	87	84.000	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSFHEG00000011666	srp9	87	97.333	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	92.000	ENSGMOG00000003565	srp9	87	92.000	Gadus_morhua
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSGALG00000026009	SRP9	87	82.667	Gallus_gallus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSGAFG00000009506	srp9	87	97.333	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000019141	srp9	95	96.000	ENSGACG00000004110	srp9	87	96.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	85.333	ENSGAGG00000017129	SRP9	87	85.333	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSGGOG00000011555	SRP9	87	82.667	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000019141	srp9	95	98.667	ENSHBUG00000021430	srp9	87	98.667	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000019141	srp9	95	77.333	ENSHGLG00000006535	-	88	77.333	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSHGLG00000002329	SRP9	87	81.333	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000019141	srp9	87	82.609	ENSHGLG00000020925	-	86	82.609	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000019141	srp9	89	78.571	ENSHGLG00000019830	-	100	78.571	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000019141	srp9	97	74.026	ENSHGLG00000020168	-	90	74.026	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000019141	srp9	95	77.333	ENSHGLG00100009760	-	88	77.333	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSHGLG00100019986	-	87	82.667	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000019141	srp9	90	78.873	ENSHGLG00100016521	-	87	78.873	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000019141	srp9	86	76.471	ENSHGLG00100011806	-	87	76.471	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000019141	srp9	97	74.026	ENSHGLG00100020800	-	90	74.026	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000019141	srp9	95	66.667	ENSHCOG00000006978	srp9	83	66.667	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSIPUG00000020674	srp9	88	97.333	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSSTOG00000026827	SRP9	87	81.333	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	84.000	ENSJJAG00000016583	Srp9	87	84.000	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	96.000	ENSKMAG00000014117	srp9	87	96.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSLBEG00000020620	srp9	87	97.333	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000019141	srp9	95	86.667	ENSLACG00000007546	SRP9	87	86.667	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000019141	srp9	95	93.333	ENSLOCG00000015903	srp9	87	93.333	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	80.000	ENSLAFG00000004081	SRP9	87	80.000	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSMFAG00000002641	SRP9	87	81.333	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSMMUG00000000134	SRP9	87	81.333	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSMNEG00000043512	SRP9	87	81.333	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSMLEG00000037309	SRP9	87	81.333	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	98.667	ENSMAMG00000004755	srp9	87	98.667	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	98.667	ENSMZEG00005015517	srp9	87	98.667	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSMGAG00000008061	SRP9	87	82.667	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSMAUG00000017552	Srp9	87	82.667	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	80.000	ENSMICG00000030104	-	87	80.000	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSMOCG00000012590	Srp9	87	82.667	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000019141	srp9	95	93.421	ENSMMOG00000014838	srp9	87	93.421	Mola_mola
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSMODG00000025664	SRP9	87	82.667	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000019141	srp9	95	96.000	ENSMALG00000004262	srp9	87	96.000	Monopterus_albus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	MGP_CAROLIEiJ_G0014997	Srp9	87	82.667	Mus_caroli
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSMUSG00000026511	Srp9	87	82.667	Mus_musculus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	80.000	MGP_PahariEiJ_G0028229	Srp9	87	80.000	Mus_pahari
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	MGP_SPRETEiJ_G0015797	Srp9	87	82.667	Mus_spretus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	80.000	ENSMLUG00000014914	SRP9	87	80.000	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSNGAG00000019936	Srp9	87	82.667	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000019141	srp9	95	98.667	ENSNBRG00000010915	srp9	87	98.667	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSNLEG00000013740	SRP9	87	82.667	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSOPRG00000012133	SRP9	87	81.333	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000019141	srp9	95	76.000	ENSODEG00000015075	-	86	76.000	Octodon_degus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	71.429	ENSODEG00000010125	-	66	71.429	Octodon_degus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSONIG00000011409	srp9	87	97.333	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSOANG00000001472	SRP9	87	82.667	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSOCUG00000010791	SRP9	87	81.333	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	93.333	ENSORLG00020003090	srp9	87	93.333	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000019141	srp9	95	93.333	ENSORLG00015001636	srp9	77	93.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000019141	srp9	95	94.667	ENSOMEG00000020548	srp9	87	94.667	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000019141	srp9	95	80.000	ENSOGAG00000031299	-	87	80.000	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000019141	srp9	95	80.000	ENSOGAG00000001752	-	87	80.000	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSPPAG00000042680	SRP9	87	82.667	Pan_paniscus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSPPRG00000011732	SRP9	87	81.333	Panthera_pardus
ENSSLDG00000019141	srp9	63	80.000	ENSPTIG00000014838	SRP9	58	80.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSPTRG00000002038	SRP9	87	82.667	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSPANG00000030164	SRP9	87	81.333	Papio_anubis
ENSSLDG00000019141	srp9	95	90.667	ENSPKIG00000015012	srp9	87	90.667	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000019141	srp9	95	85.333	ENSPSIG00000014842	SRP9	87	85.333	Pelodiscus_sinensis
ENSSLDG00000019141	srp9	95	65.333	ENSPMGG00000002318	srp9	84	65.333	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSPEMG00000022774	Srp9	87	82.667	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSPCIG00000017399	SRP9	87	82.667	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSPREG00000020242	srp9	87	97.333	Poecilia_reticulata
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSPPYG00000000174	SRP9	90	82.667	Pongo_abelii
ENSSLDG00000019141	srp9	95	80.000	ENSPCAG00000014886	SRP9	87	80.000	Procavia_capensis
ENSSLDG00000019141	srp9	100	63.415	ENSPCOG00000012531	-	92	63.415	Propithecus_coquereli
ENSSLDG00000019141	srp9	63	80.000	ENSPCOG00000021743	-	81	80.000	Propithecus_coquereli
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSPVAG00000008142	SRP9	87	81.333	Pteropus_vampyrus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	98.667	ENSPNYG00000010536	srp9	87	98.667	Pundamilia_nyererei
ENSSLDG00000019141	srp9	95	96.000	ENSPNAG00000008264	srp9	87	96.000	Pygocentrus_nattereri
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSRNOG00000003211	Srp9	87	82.667	Rattus_norvegicus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSRBIG00000040480	SRP9	87	81.333	Rhinopithecus_bieti
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSRROG00000028703	SRP9	87	81.333	Rhinopithecus_roxellana
ENSSLDG00000019141	srp9	95	84.000	ENSSBOG00000034573	SRP9	87	84.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSLDG00000019141	srp9	95	82.667	ENSSHAG00000013504	SRP9	87	82.667	Sarcophilus_harrisii
ENSSLDG00000019141	srp9	95	89.333	ENSSFOG00015000310	srp9	87	89.333	Scleropages_formosus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSSMAG00000001318	srp9	87	97.333	Scophthalmus_maximus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	98.667	ENSSDUG00000008772	srp9	87	98.667	Seriola_dumerili
ENSSLDG00000019141	srp9	95	61.333	ENSSPUG00000014436	SRP9	86	61.333	Sphenodon_punctatus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	98.667	ENSSPAG00000017244	srp9	87	98.667	Stegastes_partitus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSSSCG00000031664	-	87	81.333	Sus_scrofa
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSTGUG00000004123	SRP9	87	81.333	Taeniopygia_guttata
ENSSLDG00000019141	srp9	95	93.333	ENSTRUG00000024107	srp9	87	93.333	Takifugu_rubripes
ENSSLDG00000019141	srp9	95	93.333	ENSTNIG00000007254	srp9	87	93.333	Tetraodon_nigroviridis
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSTBEG00000005634	SRP9	87	81.333	Tupaia_belangeri
ENSSLDG00000019141	srp9	63	80.000	ENSTTRG00000010081	SRP9	81	80.000	Tursiops_truncatus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSUAMG00000020489	SRP9	87	81.333	Ursus_americanus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSUMAG00000015908	SRP9	87	81.333	Ursus_maritimus
ENSSLDG00000019141	srp9	63	80.000	ENSVPAG00000001698	SRP9	81	80.000	Vicugna_pacos
ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	ENSVVUG00000002065	SRP9	87	81.333	Vulpes_vulpes
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSXCOG00000000662	srp9	87	97.333	Xiphophorus_couchianus
ENSSLDG00000019141	srp9	95	97.333	ENSXMAG00000029514	srp9	87	97.333	Xiphophorus_maculatus