EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000020199 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: apobec2a
Alias: apo2a|zgc:110762
Full Name: C->U-editing enzyme APOBEC-2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15648 bases
Position: chrPEQF01099227.1:5941811-5957458
Accession: 111668645
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000025994	APOBEC_N	PF08210.11	2.6e-47	1	1
ENSSLDP00000025994	APOBEC_C	PF05240.14	2.1e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000026791	-	992	XM_023424748	ENSSLDP00000025994	252 (aa)	XP_023280516	UPI000C6FBD23

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSLDG00000020199	apobec2a	88	56.696	ENSSLDG00000003321	apobec2b	88	54.508
ENSSLDG00000020199	apobec2a	67	33.721	ENSSLDG00000023022	aicda	86	32.418

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	58.373	ENSG00000124701	APOBEC2	96	57.870	Homo_sapiens
ENSSLDG00000020199	apobec2a	88	56.306	ENSAPOG00000019390	apobec2b	90	53.226	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	92	47.826	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	100	47.826	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	49.638	ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	52.964	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	71	82.682	ENSACIG00000016370	apobec2a	70	82.682	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	88	56.757	ENSAOCG00000023355	apobec2b	100	51.471	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	75.397	ENSAOCG00000003291	apobec2a	100	75.397	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000020199	apobec2a	88	56.250	ENSAPEG00000004591	apobec2b	91	52.174	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	75.397	ENSAPEG00000003630	apobec2a	100	75.397	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	80.159	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	86.857	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	88	57.848	ENSATEG00000023043	APOBEC2	86	55.000	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	73	57.447	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	94	53.052	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000020199	apobec2a	73	55.026	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	56.983	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	58.654	ENSANAG00000026993	APOBEC2	96	57.870	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000020199	apobec2a	70	74.011	ENSACLG00000026736	-	99	74.011	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000020199	apobec2a	88	56.757	ENSACLG00000007634	APOBEC2	100	50.735	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000020199	apobec2a	90	58.261	ENSAMXG00000015966	apobec2b	85	56.790	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	79	60.680	ENSAMXG00000042992	apobec2a	91	58.621	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	56.522	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	67	55.924	Bos_taurus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	58.654	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	92	58.654	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	56.459	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	96	55.349	Canis_familiaris
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	56.938	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	96	55.814	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	55.769	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	94	55.450	Capra_hircus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	57.005	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	95	56.279	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000020199	apobec2a	75	58.163	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	98	52.889	Cavia_aperea
ENSSLDG00000020199	apobec2a	75	58.163	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	98	52.889	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	58.654	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	92	58.654	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	58.373	ENSCATG00000010691	APOBEC2	93	58.373	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000020199	apobec2a	75	58.673	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	97	53.812	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	58.373	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	94	58.019	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	69	59.116	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	59.116	Choloepus_hoffmanni
ENSSLDG00000020199	apobec2a	72	56.757	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	87	56.545	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	58.173	ENSCANG00000035072	APOBEC2	94	57.547	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	84	56.621	ENSCGRG00001014983	Apobec2	98	56.621	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000020199	apobec2a	84	56.621	ENSCGRG00000007835	Apobec2	98	56.621	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000020199	apobec2a	74	61.290	ENSCSEG00000000690	-	100	52.045	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	75.000	ENSCSEG00000020201	apobec2a	100	75.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	51.095	ENSCVAG00000012342	apobec2b	100	52.768	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	58.462	ENSDARG00000018881	apobec2a	94	59.073	Danio_rerio
ENSSLDG00000020199	apobec2a	88	59.821	ENSDARG00000113992	apobec2b	87	56.735	Danio_rerio
ENSSLDG00000020199	apobec2a	75	38.500	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	96	36.530	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	83	56.481	ENSDORG00000006447	Apobec2	99	51.837	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000020199	apobec2a	75	59.694	ENSETEG00000000624	APOBEC2	95	55.455	Echinops_telfairi
ENSSLDG00000020199	apobec2a	71	56.452	ENSEASG00005002937	APOBEC2	97	56.452	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	83	55.505	ENSECAG00000006576	APOBEC2	97	55.505	Equus_caballus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	54.808	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	94	54.502	Erinaceus_europaeus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	99	59.783	ENSELUG00000003736	apobec2a	98	60.791	Esox_lucius
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	55.502	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	96	54.419	Felis_catus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	73	46.032	ENSFALG00000003910	APOBEC2	97	42.593	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	57.767	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	95	56.279	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000020199	apobec2a	87	57.273	ENSFHEG00000005492	apobec2b	100	53.360	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	55.340	ENSGMOG00000006819	apobec2b	100	50.391	Gadus_morhua
ENSSLDG00000020199	apobec2a	69	78.857	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	78.857	Gadus_morhua
ENSSLDG00000020199	apobec2a	73	57.143	ENSGALG00000003226	APOBEC2	85	57.143	Gallus_gallus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	50.373	ENSGAFG00000007634	apobec2b	87	52.416	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	50.787	ENSGACG00000009663	apobec2b	100	53.125	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	75	82.979	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	82.979	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	85	53.211	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	53.211	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	58.373	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	93	57.870	Gorilla_gorilla
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ENSSLDG00000020199	apobec2a	90	57.456	ENSHBUG00000005993	apobec2b	100	49.632	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000020199	apobec2a	79	57.073	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	93	55.349	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000020199	apobec2a	79	57.073	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	93	55.349	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000020199	apobec2a	97	72.245	ENSHCOG00000020319	apobec2a	100	72.245	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	52.574	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	100	52.574	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	55.185	ENSIPUG00000013784	Apobec2	86	60.759	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	65.877	ENSIPUG00000017355	apobec2a	72	57.480	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	57.692	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	96	56.279	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	56.459	ENSJJAG00000009733	Apobec2	98	55.455	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	99	52.015	ENSKMAG00000020631	apobec2b	99	52.747	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	73.810	ENSLBEG00000025214	apobec2a	100	73.810	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000020199	apobec2a	88	55.947	ENSLBEG00000009422	-	92	51.724	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000020199	apobec2a	83	56.938	ENSLACG00000015985	APOBEC2	91	56.938	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	66.667	ENSLOCG00000012415	apobec2b	88	59.671	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	58.373	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	93	58.373	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	58.373	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	94	58.019	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	58.373	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	94	58.019	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	58.373	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	94	58.019	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	58.373	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	94	58.019	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	88	56.250	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	79	56.757	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	78.571	ENSMAMG00000023685	apobec2a	97	78.571	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	49.265	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	100	49.265	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000020199	apobec2a	94	72.881	ENSMZEG00005005240	-	98	72.881	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000020199	apobec2a	73	57.143	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	56.425	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000020199	apobec2a	83	55.607	ENSMAUG00000011016	Apobec2	96	55.607	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	83	55.814	ENSMICG00000043339	APOBEC2	96	55.814	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	57.692	ENSMOCG00000001904	Apobec2	96	56.542	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	50.936	ENSMMOG00000008681	apobec2b	100	51.866	Mola_mola
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	55.825	ENSMODG00000013090	APOBEC2	93	55.825	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	75.397	ENSMALG00000020523	apobec2a	100	76.587	Monopterus_albus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	100	49.807	ENSMALG00000013779	APOBEC2	100	49.807	Monopterus_albus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	57.416	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	96	56.279	Mus_caroli
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	57.416	ENSMUSG00000040694	Apobec2	96	56.279	Mus_musculus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	57.416	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	96	56.279	Mus_pahari
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	57.212	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	92	55.556	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000020199	apobec2a	83	55.349	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	93	55.349	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	56.731	ENSNGAG00000013717	Apobec2	96	55.607	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000020199	apobec2a	99	69.323	ENSNBRG00000021776	apobec2a	99	69.721	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000020199	apobec2a	88	55.804	ENSNBRG00000018806	apobec2b	78	54.286	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	58.373	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	96	57.870	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	55.825	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	93	55.825	Notamacropus_eugenii
ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	57.820	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	98	55.111	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000020199	apobec2a	79	57.282	ENSODEG00000016183	APOBEC2	99	53.275	Octodon_degus
ENSSLDG00000020199	apobec2a	88	57.207	ENSONIG00000012289	apobec2b	100	51.471	Oreochromis_niloticus
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