EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000020560 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srprb
Alias: wu:fk57h10|zgc:111820|zgc:92746
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7052 bases
Position: chrPEQF01098738.1:229578-236629
Accession: 111654129
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000026451	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000027266	-	5737	XM_023405017	ENSSLDP00000026451	275 (aa)	XP_023260785	UPI000C6FA8E8

Gene Model

Click here to download ENSSLDG00000020560's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSLDG00000020560's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSLDG00000020560	srprb	62	30.409	ENSSLDG00000008504	-	88	30.409
ENSSLDG00000020560	srprb	58	31.250	ENSSLDG00000021639	arf2b	83	31.250

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000020560	srprb	100	92.419	ENSAPOG00000021219	srprb	100	92.419	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000020560	srprb	97	90.602	ENSACIG00000014621	srprb	100	90.602	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000020560	srprb	100	92.419	ENSAOCG00000017265	srprb	100	92.419	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000020560	srprb	100	92.419	ENSAPEG00000024541	srprb	88	92.419	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000020560	srprb	100	89.455	ENSATEG00000014016	srprb	100	89.455	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000020560	srprb	100	90.580	ENSACLG00000016748	srprb	100	90.580	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000020560	srprb	97	70.677	ENSAMXG00000044118	srprb	100	70.677	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000020560	srprb	100	85.455	ENSCSEG00000017194	srprb	100	85.455	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000020560	srprb	97	87.970	ENSCVAG00000004221	srprb	100	87.970	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000020560	srprb	97	67.669	ENSDARG00000030949	srprb	100	67.669	Danio_rerio
ENSSLDG00000020560	srprb	96	81.749	ENSELUG00000009740	srprb	97	81.749	Esox_lucius
ENSSLDG00000020560	srprb	97	88.722	ENSFHEG00000006004	srprb	100	88.722	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000020560	srprb	99	78.967	ENSGMOG00000002081	srprb	100	78.967	Gadus_morhua
ENSSLDG00000020560	srprb	96	86.364	ENSGAFG00000012593	srprb	99	86.364	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000020560	srprb	99	88.561	ENSGACG00000009891	srprb	100	88.561	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000020560	srprb	100	90.580	ENSHBUG00000002145	srprb	100	90.580	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000020560	srprb	98	82.156	ENSHCOG00000007732	srprb	99	82.156	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000020560	srprb	92	68.651	ENSIPUG00000004177	srprb	94	68.651	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000020560	srprb	97	84.962	ENSKMAG00000020736	srprb	100	84.962	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000020560	srprb	100	88.727	ENSLBEG00000021483	srprb	100	88.727	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000020560	srprb	99	69.091	ENSLOCG00000009740	srprb	92	69.455	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000020560	srprb	100	90.909	ENSMAMG00000011876	srprb	100	90.909	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000020560	srprb	94	90.734	ENSMZEG00005016621	srprb	100	90.734	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000020560	srprb	97	89.552	ENSMMOG00000012550	srprb	99	89.552	Mola_mola
ENSSLDG00000020560	srprb	100	89.091	ENSMALG00000012595	srprb	100	89.091	Monopterus_albus
ENSSLDG00000020560	srprb	75	90.777	ENSNBRG00000004699	srprb	95	84.513	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000020560	srprb	100	90.182	ENSONIG00000003788	srprb	82	90.182	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000020560	srprb	99	81.919	ENSORLG00000006430	srprb	99	81.919	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000020560	srprb	100	81.455	ENSORLG00020003413	srprb	100	81.455	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000020560	srprb	100	81.455	ENSORLG00015000166	srprb	100	81.455	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000020560	srprb	100	82.182	ENSOMEG00000012735	srprb	100	82.182	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000020560	srprb	91	71.315	ENSPKIG00000013147	srprb	95	71.315	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000020560	srprb	100	81.091	ENSPMGG00000014061	srprb	100	81.091	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000020560	srprb	96	86.742	ENSPFOG00000011347	srprb	96	86.742	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000020560	srprb	94	88.372	ENSPLAG00000001156	srprb	100	88.372	Poecilia_latipinna
ENSSLDG00000020560	srprb	94	87.597	ENSPMEG00000012169	srprb	100	87.597	Poecilia_mexicana
ENSSLDG00000020560	srprb	94	87.209	ENSPREG00000001449	srprb	100	87.209	Poecilia_reticulata
ENSSLDG00000020560	srprb	100	90.580	ENSPNYG00000005911	srprb	100	90.580	Pundamilia_nyererei
ENSSLDG00000020560	srprb	97	71.805	ENSPNAG00000009983	srprb	100	71.805	Pygocentrus_nattereri
ENSSLDG00000020560	srprb	92	74.409	ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.409	Scleropages_formosus
ENSSLDG00000020560	srprb	100	90.545	ENSSMAG00000013202	srprb	100	90.545	Scophthalmus_maximus
ENSSLDG00000020560	srprb	100	99.636	ENSSDUG00000018746	srprb	94	99.636	Seriola_dumerili
ENSSLDG00000020560	srprb	100	91.697	ENSSPAG00000008898	srprb	100	91.697	Stegastes_partitus
ENSSLDG00000020560	srprb	100	86.545	ENSTRUG00000022463	srprb	100	86.545	Takifugu_rubripes
ENSSLDG00000020560	srprb	95	81.679	ENSTNIG00000007725	srprb	100	81.679	Tetraodon_nigroviridis
ENSSLDG00000020560	srprb	94	88.372	ENSXCOG00000012585	srprb	100	88.372	Xiphophorus_couchianus
ENSSLDG00000020560	srprb	94	87.984	ENSXMAG00000028725	srprb	100	87.984	Xiphophorus_maculatus