EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000024382 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16053 bases
Position: chrPEQF01098232.1:284985-301037
Accession: 111651740
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000031780	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3.2e-22	1	1
ENSSLDP00000031780	DEAD	PF00270.29	2.8e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000032688	-	3504	XM_023401770	ENSSLDP00000031780	1167 (aa)	XP_023257538	-

Gene Model

Click here to download ENSSLDG00000024382's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSLDG00000024382's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSLDG00000024382	skiv2l	79	35.908	ENSSLDG00000006301	mtrex	93	35.373

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.163	ENSG00000204351	SKIV2L	99	60.097	Homo_sapiens
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	83.871	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	83.871	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.000	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.016	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	82.210	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	82.210	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	84.355	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	84.355	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	84.355	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	84.355	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	85.761	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	85.761	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	96	67.284	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	60.742	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.732	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	60.660	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	84.123	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	84.036	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	77.778	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	77.671	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.163	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	60.097	Bos_taurus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	95	39.609	WBGene00008502	skih-2	99	39.922	Caenorhabditis_elegans
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.894	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.821	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.870	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	60.177	Canis_familiaris
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.870	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	60.177	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.407	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	60.338	Capra_hircus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.919	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	59.856	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.376	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	60.194	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.813	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	60.740	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.650	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	60.579	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.244	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.177	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.732	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	60.660	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	80	71.624	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	85	71.624	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000024382	skiv2l	92	50.130	ENSCING00000005576	-	99	50.130	Ciona_intestinalis
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.894	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	60.370	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.325	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	59.952	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	84.039	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	84.039	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000024382	skiv2l	100	85.058	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	85.058	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	79.230	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	79.230	Danio_rerio
ENSSLDG00000024382	skiv2l	90	63.743	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	90	64.093	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	92	44.663	FBgn0039117	tst	97	44.919	Drosophila_melanogaster
ENSSLDG00000024382	skiv2l	70	74.684	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	74.684	Echinops_telfairi
ENSSLDG00000024382	skiv2l	90	52.007	ENSEBUG00000013680	-	98	50.919	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000024382	skiv2l	92	60.449	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	61.015	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	93	59.278	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	59.780	Equus_caballus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	54	75.099	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	75.099	Erinaceus_europaeus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	79.967	ENSELUG00000000181	skiv2l	99	79.967	Esox_lucius
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.325	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	59.855	Felis_catus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	95	65.664	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	58.989	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000024382	skiv2l	100	83.567	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	83.650	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	77.814	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	77.814	Gadus_morhua
ENSSLDG00000024382	skiv2l	79	56.535	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.598	Gallus_gallus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	83.159	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	83.159	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	83.065	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	83.065	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.407	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	60.338	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	84.907	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	84.815	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.756	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	59.775	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	58.272	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	58.306	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	83.148	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	83.405	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	77.572	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	77.850	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	59.887	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.499	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	54	59.864	ENSLACG00000002986	-	60	59.864	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.049	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.499	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.894	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	60.821	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.894	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	60.821	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.894	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.821	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.650	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	60.579	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	87.468	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	87.468	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	84.250	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	84.163	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000024382	skiv2l	62	72.269	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	85	72.269	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.611	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.581	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.837	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	60.064	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	58.924	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.280	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	87.352	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	87.352	Mola_mola
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	59.904	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.901	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	82.131	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	82.131	Monopterus_albus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.065	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	59.920	Mus_caroli
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.179	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	59.920	Mus_musculus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.342	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	60.161	Mus_pahari
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.016	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	59.759	Mus_spretus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	58.800	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	60.097	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.919	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	59.185	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	85.299	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	85.299	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.723	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.569	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000024382	skiv2l	75	69.527	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	62.832	Notamacropus_eugenii
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.593	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.920	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.431	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	59.775	Octodon_degus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	83.629	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	83.629	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.000	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	60.418	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	82.060	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	82.060	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	82.220	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	82.220	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	81.899	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	81.899	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	82.434	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	82.434	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.837	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	59.775	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	57.211	ENSOARG00000002411	-	99	57.177	Ovis_aries
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.660	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	59.600	Pan_paniscus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.163	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	60.016	Panthera_pardus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.756	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.614	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.244	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	60.177	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.790	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	59.728	Papio_anubis
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	74.498	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	74.498	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	83.775	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	84.298	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.853	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	59.710	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	59.375	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	60.209	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	83.078	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	83.078	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	82.998	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	82.998	Poecilia_latipinna
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	83.078	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	83.078	Poecilia_mexicana
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	86.160	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	86.160	Poecilia_reticulata
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.081	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.016	Pongo_abelii
ENSSLDG00000024382	skiv2l	77	68.478	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	76	68.478	Procavia_capensis
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.163	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	60.064	Propithecus_coquereli
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.081	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	60.016	Pteropus_vampyrus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	85.895	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	85.895	Pundamilia_nyererei
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	79.268	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	79.227	Pygocentrus_nattereri
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.586	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	60.435	Rattus_norvegicus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.628	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	100	59.490	Rhinopithecus_bieti
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.813	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	60.740	Rhinopithecus_roxellana
ENSSLDG00000024382	skiv2l	80	43.508	YLR398C	-	77	43.508	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.976	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.901	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSLDG00000024382	skiv2l	96	66.667	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.372	Sarcophilus_harrisii
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	77.484	ENSSFOG00015016930	skiv2l	98	78.731	Scleropages_formosus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	84.304	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	84.304	Scophthalmus_maximus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	100	96.447	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	96.447	Seriola_dumerili
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	64.184	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	57.109	Sphenodon_punctatus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	94	84.354	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	84.354	Stegastes_partitus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	60.016	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.418	Sus_scrofa
ENSSLDG00000024382	skiv2l	71	90.909	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	73.031	Takifugu_rubripes
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	79.338	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	79.419	Tetraodon_nigroviridis
ENSSLDG00000024382	skiv2l	92	62.086	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.086	Tupaia_belangeri
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	56.179	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	55.911	Tursiops_truncatus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.163	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.177	Ursus_americanus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	92	61.226	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	61.313	Ursus_maritimus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.789	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	60.097	Vulpes_vulpes
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	56.683	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	56.924	Xenopus_tropicalis
ENSSLDG00000024382	skiv2l	100	82.915	ENSXCOG00000019517	skiv2l	98	82.915	Xiphophorus_couchianus
ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	82.984	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	82.984	Xiphophorus_maculatus