EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000025395 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC111660338
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10332 bases
Position: chrPEQF01098996.1:880441-890772
Accession: 111660338
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000033175	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000034100	-	1525	XM_023413581	ENSSLDP00000033175	448 (aa)	XP_023269349	UPI000C6F84C5
ENSSLDT00000034104	-	1230	-	ENSSLDP00000033179	409 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.101	ENSSLDG00000019145	si:ch211-11k18.4	98	59.101

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.101	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	98	59.101	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	57.623	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	57.623	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.326	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	98	59.326	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.101	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	98	59.101	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.326	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	98	59.326	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	58.296	ENSACAG00000028632	-	98	58.389	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	58.613	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	98	58.613	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.243	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.243	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	80.942	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	99	80.942	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	77	61.739	ENSCING00000020807	-	91	61.739	Ciona_intestinalis
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	98	54.545	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.000	Ciona_savignyi
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	88.839	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	85.849	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	58.652	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	98	59.326	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.551	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	98	59.551	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	89.062	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	89.062	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	60.000	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	97	74.869	Danio_rerio
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	98	82.609	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	82.609	Danio_rerio
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	80	56.267	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	56.267	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	80.899	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	80.899	Esox_lucius
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.508	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	98	59.508	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	88	55.303	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	98	55.303	Gadus_morhua
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	89.732	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.101	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	98	59.101	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	58	93.798	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	93.798	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	80	65.833	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	98	61.209	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	58.837	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	98	58.837	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	84.234	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	84.234	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	58.876	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.876	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	95	59.346	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	98	59.346	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	78.700	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	78.700	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	84	57.447	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	57.447	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.101	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	98	59.101	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	61.124	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.348	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	68.919	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.919	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	60.579	ENSLACG00000004899	-	99	60.579	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	75.391	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.391	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	95	59.813	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	98	59.813	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	58.389	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	98	58.389	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	57.718	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	98	57.718	Mola_mola
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	98	88.838	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	88.838	Monopterus_albus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.326	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	98	59.326	Monopterus_albus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	95	59.112	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	97	59.112	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	58.613	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	98	58.613	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	84.375	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	84.375	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	60.314	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	98	60.314	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	87.277	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	87.277	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	60.314	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	98	60.314	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	87.500	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	87.500	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	60.314	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	98	60.314	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	89.062	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	89.062	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	59.775	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	98	59.775	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	58.876	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.775	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	77.079	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	99	77.079	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	57.658	ENSPKIG00000023918	-	97	57.658	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	85.268	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	85.268	Periophthalmus_magnuspinnatus
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