EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000025449 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: probable global transcription activator SNF2L2
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 36954 bases
Position: chrPEQF01099003.1:741158-778111
Accession: 111660974
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000033260	BRK	PF07533.16	4.7e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000034187	SMARCA2-201	4653	XM_023414430	ENSSLDP00000033260	1550 (aa)	XP_023270198	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	90	70.145	ENSSLDG00000023663	-	97	70.424
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	93	69.384	ENSSLDG00000024486	smarca4a	100	72.045

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.597	ENSG00000080503	SMARCA2	97	95.238	Homo_sapiens
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	89.023	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	91.774	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	88	74.625	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	84.395	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	89.256	ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	89.701	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	89.942	ENSAOCG00000009647	-	99	89.854	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	88.783	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	99	90.825	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	88.910	ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	88.662	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	86	77.378	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.260	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	94	79.219	ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	79.299	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.702	ENSANAG00000026498	SMARCA2	99	80.995	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	88.917	ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	89.686	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	83.933	ENSAMXG00000012404	smarca2	98	83.751	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.870	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	99	79.114	Bos_taurus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.687	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.083	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.805	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	99	79.569	Canis_familiaris
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	72	87.249	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	87.074	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.740	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	99	79.177	Capra_hircus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	97	80.115	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.706	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.118	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	80.219	Cavia_aperea
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	97	79.832	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	99	80.804	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.962	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	99	81.186	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.857	ENSCATG00000031470	SMARCA2	99	80.637	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	97	79.639	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	80.980	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	91	81.643	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	81.330	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	83	82.353	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	83	82.353	Choloepus_hoffmanni
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.477	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	96	84.621	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.767	ENSCANG00000039597	SMARCA2	99	81.059	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	75.292	ENSCGRG00001002323	Smarca2	99	74.512	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	87.667	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	99	87.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	84	87.922	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	87.622	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	81.336	ENSDARG00000008904	smarca2	99	81.024	Danio_rerio
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.547	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	99	79.987	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	97	80.117	ENSDORG00000014832	Smarca2	99	80.676	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	76	61.570	FBgn0000212	brm	74	61.330	Drosophila_melanogaster
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	83	60.701	ENSEBUG00000002449	-	93	62.444	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	94	69.215	ENSEBUG00000011442	-	97	68.605	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.805	ENSEASG00005010312	SMARCA2	99	79.492	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	59	94.118	ENSEEUG00000015540	-	69	79.730	Erinaceus_europaeus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	95	83.143	ENSELUG00000010318	smarca2	96	83.434	Esox_lucius
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.739	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	99	78.951	Felis_catus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	94	78.501	ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	80.137	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	97	79.614	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	79.749	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	88.776	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	88.347	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	81.071	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.007	Gadus_morhua
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	78.790	ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	79.114	Gallus_gallus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	95	84.590	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	84.388	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	85.303	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	85.053	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	78.794	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	99	79.172	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	88	85.008	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	97	83.910	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	89.079	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	98	89.841	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	97	79.833	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	80.088	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.610	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	99	79.974	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	89	82.531	ENSHCOG00000015348	-	95	88.921	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	82.071	ENSIPUG00000011060	smarca2	99	82.272	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	97	80.518	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	99	81.095	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.390	ENSJJAG00000010867	Smarca2	99	80.612	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	88.449	ENSKMAG00000015844	-	99	88.261	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.811	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	81.630	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	78.608	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	78.887	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.597	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	99	80.485	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	97	80.415	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	99	81.122	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.130	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	99	80.828	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.272	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	79.606	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	90.013	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.208	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	89.016	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	98	89.778	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	73	65.654	ENSMGAG00000005160	-	99	59.156	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.390	ENSMICG00000005162	SMARCA2	99	80.740	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	97	80.739	ENSMOCG00000001611	Smarca2	99	80.867	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	88.889	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	100	88.889	Mola_mola
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	95	77.349	ENSMODG00000003578	SMARCA2	99	79.363	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	91.160	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	91.095	Monopterus_albus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.545	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	99	79.836	Mus_caroli
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.662	ENSMUSG00000024921	Smarca2	93	98.000	Mus_musculus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.416	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	99	80.216	Mus_pahari
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.480	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	88.075	Mus_spretus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	78	83.871	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	93	84.432	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	75.016	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	81	80.370	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	97	79.092	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	79.426	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	93	75.603	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	84.080	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.012	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	78.711	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	91	74.079	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	99	72.383	Notamacropus_eugenii
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	76.360	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	76.015	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	97	79.279	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	79.013	Octodon_degus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	87.894	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	88.079	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	78	84.988	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	80	84.894	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	86.926	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	87.240	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	86.854	ENSORLG00015006289	SMARCA2	99	87.237	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	87.051	ENSOMEG00000009736	-	99	87.372	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	79	84.190	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	78.049	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	77.870	ENSOARG00000013265	SMARCA2	99	78.247	Ovis_aries
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	77.778	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	99	78.463	Pan_paniscus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.804	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	99	79.014	Panthera_pardus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.029	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	98	80.677	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	76.863	ENSPANG00000025121	SMARCA2	99	77.299	Papio_anubis
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	82.510	ENSPKIG00000018469	-	98	82.470	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	94	78.252	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	99	78.368	Pelodiscus_sinensis
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	81.601	ENSPMGG00000013696	-	99	82.483	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.026	ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	79.873	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	94	69.172	ENSPMAG00000005337	-	97	69.392	Petromyzon_marinus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	79.156	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	99	79.528	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	87.184	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	87.871	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	100	85.908	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	98	87.933	Poecilia_latipinna
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	100	86.207	ENSPMEG00000001815	-	99	87.871	Poecilia_mexicana
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	100	86.181	ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	86.806	Poecilia_reticulata
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	96	80.572	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	99	80.804	Pongo_abelii
ENSSLDG00000025449	SMARCA2	75	74.296	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	74.296	Procavia_capensis
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