EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000025629 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo2
Alias: fb01c02|fe01f03|ik:tdsubc_2a7|tdsubc_2a7|wu:fb01c02|wu:fe01f03|wu:fe16e12|xx:tdsubc_2a7|zgc:101009
Full Name: transportin-2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16794 bases
Position: chrPEQF01099435.1:775222-792015
Accession: 111645857
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000033508	IBN_N	PF03810.19	5.8e-16	1	1
ENSSLDP00000033507	IBN_N	PF03810.19	8.3e-16	1	1
ENSSLDP00000033506	IBN_N	PF03810.19	8.9e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000034437	-	2334	-	ENSSLDP00000033508	777 (aa)	-	-
ENSSLDT00000034436	-	6419	XM_023395172	ENSSLDP00000033507	889 (aa)	XP_023250940	UPI000BBE691B
ENSSLDT00000034435	-	6455	XM_023395170	ENSSLDP00000033506	901 (aa)	XP_023250938	UPI000C6F803D

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.951	ENSSLDG00000013107	-	100	95.951
ENSSLDG00000025629	tnpo2	99	86.374	ENSSLDG00000014578	tnpo1	99	86.374

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSG00000105576	TNPO2	100	92.913	Homo_sapiens
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.838	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	95.838	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	93	93.931	ENSAPOG00000013185	-	96	97.379	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	90.323	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	90.323	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000025629	tnpo2	99	94.872	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	98.573	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	99	92.866	ENSACIG00000009586	-	100	95.984	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.838	ENSAOCG00000010152	-	100	95.838	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	99.438	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	99.438	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	99.438	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	99.438	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.838	ENSAPEG00000013268	-	100	95.838	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.838	ENSATEG00000019171	-	100	95.838	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	98.650	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	98.650	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.363	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	93.363	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.801	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	92.801	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	89.651	ENSACLG00000020672	-	100	89.651	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	98.875	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	98.875	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.787	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	95.787	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.801	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	92.801	Bos_taurus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	91.880	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.801	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	93.026	Canis_familiaris
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.026	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	88.209	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	87.875	Capra_hircus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000025629	tnpo2	93	90.606	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	90.606	Cavia_aperea
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	92.913	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	92.913	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	91.880	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	91.880	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.913	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	92.913	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.363	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	93.476	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000025629	tnpo2	96	93.116	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	93.116	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	91.991	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	91.991	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.026	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	93.026	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000025629	tnpo2	99	90.827	ENSCSEG00000011477	-	100	93.928	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.926	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	93.926	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.838	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	95.838	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	96.180	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	96.180	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.801	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	92.801	Danio_rerio
ENSSLDG00000025629	tnpo2	99	81.371	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	83.929	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	99	89.060	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	91.241	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	72.595	FBgn0024921	Tnpo	100	72.483	Drosophila_melanogaster
ENSSLDG00000025629	tnpo2	91	84.171	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	84.171	Echinops_telfairi
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	92.913	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	92.913	Equus_caballus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	99	82.065	ENSELUG00000016542	-	99	84.961	Esox_lucius
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	96.781	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	96.781	Esox_lucius
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	91.880	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	91.880	Felis_catus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	92.913	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	96.629	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	96.629	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	97	95.349	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	95.349	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	88	92.593	ENSGMOG00000014237	-	90	94.454	Gadus_morhua
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	88.031	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	88.031	Gadus_morhua
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	97.303	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	97.303	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.613	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	95.613	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.363	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	93.476	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	98.875	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	98.875	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.838	ENSHBUG00000018317	-	100	95.838	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.801	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	92.801	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	91.212	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	91.212	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.501	ENSHCOG00000020440	-	100	95.501	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	96.400	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	96.400	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.163	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	95.163	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	96.288	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	96.288	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.026	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	93.026	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	91.880	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	91.880	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	94.038	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	94.038	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.726	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	95.726	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	96.063	ENSLBEG00000005301	-	100	96.063	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	98.988	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	98.988	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	90.551	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	90.551	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	96.625	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.625	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	91.991	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	91.880	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	91.880	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	92.913	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	92.913	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000025629	tnpo2	96	92.056	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	92.042	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	97.780	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	97.780	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.838	ENSMAMG00000011862	-	100	95.838	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	94.719	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	94.719	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.838	ENSMZEG00005007408	-	100	95.838	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	98.875	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	98.875	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	92.913	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.026	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	93.026	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000025629	tnpo2	99	92.996	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	95.990	Mola_mola
ENSSLDG00000025629	tnpo2	99	90.347	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	93.411	Mola_mola
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.326	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	93.326	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	97.413	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	97.413	Monopterus_albus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.613	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	95.613	Monopterus_albus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.026	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	93.026	Mus_caroli
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.026	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	93.026	Mus_musculus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.026	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	93.026	Mus_pahari
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.026	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	93.026	Mus_spretus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.026	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	93.026	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000025629	tnpo2	96	93.116	ENSMLUG00000012669	TNPO2	100	93.116	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.026	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	93.026	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	95.838	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	95.838	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	93.588	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	93.588	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	82.889	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	82.889	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	87.542	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	87.542	Notamacropus_eugenii
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	92.913	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	92.913	Octodon_degus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	94.878	ENSONIG00000017706	-	100	94.878	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	98.875	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	98.875	Oreochromis_niloticus
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