EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000000808 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago4
Alias: Ago4|eif2c4|fd14f04|wu:fd14f04
Full Name: argonaute RISC catalytic component 4
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20681 bases
Position: chr22:4881838-4902518
Accession: ZDB-GENE-030131-5357
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000001367	PAZ	PF02170.22	2.3e-28	1	1
ENSSMAP00000001338	PAZ	PF02170.22	2.4e-28	1	1
ENSSMAP00000001399	PAZ	PF02170.22	2.5e-28	1	1
ENSSMAP00000001367	Piwi	PF02171.17	1.3e-105	1	1
ENSSMAP00000001338	Piwi	PF02171.17	1.4e-105	1	1
ENSSMAP00000001399	Piwi	PF02171.17	1.5e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000001399	-	7780	-	ENSSMAP00000001367	910 (aa)	-	-
ENSSMAT00000001370	-	7843	-	ENSSMAP00000001338	931 (aa)	-	-
ENSSMAT00000001430	-	7635	-	ENSSMAP00000001399	961 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000000808	ago4	92	78.043	ENSSMAG00000014089	ago2	97	78.777
ENSSMAG00000000808	ago4	93	80.237	ENSSMAG00000002841	ago1	99	80.795
ENSSMAG00000000808	ago4	93	78.756	ENSSMAG00000001969	-	99	79.682
ENSSMAG00000000808	ago4	93	78.689	ENSSMAG00000002775	ago3a	100	79.853

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.611	ENSG00000134698	AGO4	100	93.855	Homo_sapiens
ENSSMAG00000000808	ago4	93	99.171	ENSAPOG00000023867	ago4	100	99.171	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.918	ENSAMEG00000000573	AGO4	99	96.412	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000000808	ago4	85	97.933	ENSACIG00000014548	ago4	100	98.509	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000000808	ago4	85	93.669	ENSAPEG00000022426	ago4	100	94.037	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000000808	ago4	99	97.912	ENSATEG00000006717	ago4	100	99.876	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000000808	ago4	91	95.889	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	96.387	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000000808	ago4	93	94.201	ENSACAG00000017275	AGO4	98	95.602	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.492	ENSANAG00000031428	AGO4	99	96.296	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000000808	ago4	93	99.051	ENSACLG00000005181	ago4	100	97.207	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.695	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.872	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000000808	ago4	92	94.982	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.507	Bos_taurus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.611	ENSCJAG00000001610	AGO4	99	96.412	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000000808	ago4	85	95.736	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.273	Canis_familiaris
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.730	ENSCHIG00000026564	AGO4	99	95.512	Capra_hircus
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.798	ENSTSYG00000014007	AGO4	99	96.296	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000000808	ago4	86	90.672	ENSCAPG00000009369	AGO4	99	91.667	Cavia_aperea
ENSSMAG00000000808	ago4	93	93.349	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	94.444	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.611	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	95.982	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.611	ENSCATG00000043421	AGO4	100	97.416	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.558	ENSCLAG00000012097	AGO4	99	96.065	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.611	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	93.855	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000000808	ago4	73	97.690	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	97.345	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.918	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.412	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.918	ENSCANG00000016914	AGO4	99	96.412	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.018	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	93.296	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.318	ENSCGRG00000013335	Ago4	99	95.833	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000000808	ago4	85	91.366	ENSCSEG00000010696	ago4	100	92.193	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000000808	ago4	93	97.628	ENSDARG00000100854	ago4	100	95.866	Danio_rerio
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.374	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	93.631	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.492	ENSDORG00000008933	Ago4	99	96.185	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000000808	ago4	57	97.044	ENSETEG00000018390	AGO4	83	97.044	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.611	ENSEASG00005012079	AGO4	100	93.855	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.611	ENSECAG00000024686	AGO4	100	93.855	Equus_caballus
ENSSMAG00000000808	ago4	71	93.684	ENSEEUG00000000745	AGO4	75	93.684	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.347	ENSELUG00000023873	ago4	100	96.983	Esox_lucius
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.492	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	93.743	Felis_catus
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.798	ENSFDAG00000021483	AGO4	99	96.296	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000000808	ago4	90	88.113	ENSFHEG00000019658	ago4	100	89.020	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000000808	ago4	92	97.139	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.699	Gadus_morhua
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.611	ENSGALG00000039713	AGO4	100	96.273	Gallus_gallus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.814	ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.983	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000000808	ago4	92	97.619	ENSGACG00000002683	ago4	99	98.272	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000000808	ago4	85	95.736	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.273	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000000808	ago4	93	91.449	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	93.039	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000000808	ago4	93	99.051	ENSHBUG00000001525	ago4	100	97.207	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.492	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	93.743	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000000808	ago4	91	95.904	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.932	ENSHCOG00000003725	ago4	100	97.095	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.814	ENSIPUG00000015600	ago4	100	96.983	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.487	ENSSTOG00000004725	AGO4	99	95.968	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.932	ENSKMAG00000018602	ago4	100	97.095	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.351	ENSLBEG00000010670	ago4	100	96.559	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.730	ENSLACG00000016888	AGO4	100	93.966	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.221	ENSLOCG00000000584	ago4	100	96.425	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000000808	ago4	86	95.134	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	95.690	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.611	ENSMFAG00000035543	AGO4	99	96.412	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.024	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	96.429	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.611	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	96.429	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.918	ENSMLEG00000039490	AGO4	99	96.412	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	99.051	ENSMAMG00000003874	ago4	100	99.730	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	99.051	ENSMZEG00005026346	ago4	100	97.207	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.335	ENSMGAG00000003851	AGO4	100	95.848	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000000808	ago4	77	97.087	ENSMAUG00000021743	Ago4	95	97.794	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.683	ENSMICG00000033507	AGO4	99	96.185	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.136	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	93.408	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000000808	ago4	85	96.382	ENSMMOG00000013473	ago4	100	97.019	Mola_mola
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.730	ENSMODG00000017888	AGO4	100	93.966	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.699	ENSMALG00000011797	ago4	99	96.313	Monopterus_albus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	94.781	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	93.073	Mus_caroli
ENSSMAG00000000808	ago4	93	94.543	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	92.849	Mus_musculus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	94.306	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	92.626	Mus_pahari
ENSSMAG00000000808	ago4	93	94.543	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	92.849	Mus_spretus
ENSSMAG00000000808	ago4	85	95.736	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	96.273	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000000808	ago4	94	93.890	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	95.833	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.798	ENSNGAG00000020544	Ago4	99	96.296	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000000808	ago4	93	99.051	ENSNBRG00000013492	ago4	100	97.207	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.918	ENSNLEG00000011125	AGO4	99	96.412	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000000808	ago4	81	96.914	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	96.914	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000000808	ago4	92	88.475	ENSOPRG00000012309	AGO4	99	89.236	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000000808	ago4	85	95.630	ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.168	Octodon_degus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	99.051	ENSONIG00000013603	ago4	100	97.207	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000000808	ago4	85	95.866	ENSOANG00000002082	AGO4	100	96.398	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.374	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	93.631	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000000808	ago4	99	96.806	ENSORLG00000009865	ago4	99	95.208	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000000808	ago4	99	96.806	ENSORLG00020016978	ago4	99	95.208	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000000808	ago4	99	96.806	ENSORLG00015008800	ago4	99	95.208	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000000808	ago4	93	99.170	ENSOMEG00000006399	ago4	99	99.769	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000000808	ago4	93	87.189	ENSOGAG00000027107	-	99	88.502	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000000808	ago4	86	94.737	ENSOGAG00000004233	-	100	95.309	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000000808	ago4	93	94.118	ENSOARG00000019568	AGO4	97	96.065	Ovis_aries
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.918	ENSPPAG00000031752	AGO4	99	96.412	Pan_paniscus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.492	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	93.743	Panthera_pardus
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.798	ENSPTIG00000020262	AGO4	99	96.296	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.611	ENSPTRG00000000527	AGO4	99	96.301	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000000808	ago4	85	95.736	ENSPANG00000007232	AGO4	100	96.273	Papio_anubis
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.458	ENSPKIG00000022598	ago4	100	96.648	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.918	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	96.412	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000000808	ago4	85	97.804	ENSPMGG00000023325	ago4	100	98.385	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000000808	ago4	91	86.007	ENSPEMG00000022651	-	95	94.286	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.730	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	93.966	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.932	ENSPFOG00000001935	ago4	100	97.095	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000000808	ago4	93	97.628	ENSPLAG00000011534	ago4	100	95.866	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.932	ENSPMEG00000005049	ago4	100	97.095	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.932	ENSPREG00000010315	ago4	100	97.216	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.918	ENSPPYG00000001552	AGO4	99	96.412	Pongo_abelii
ENSSMAG00000000808	ago4	92	95.564	ENSPCOG00000015935	AGO4	99	96.069	Propithecus_coquereli
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