EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000002409 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo11
Alias: zgc:91897
Full Name: importin 11
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 91280 bases
Position: chr9:16356779-16448058
Accession: ZDB-GENE-040711-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000004134	IBN_N	PF03810.19	1.5e-18	1	1
ENSSMAP00000004184	IBN_N	PF03810.19	1.6e-18	1	1
ENSSMAP00000004086	IBN_N	PF03810.19	1.7e-18	1	1
ENSSMAP00000004039	IBN_N	PF03810.19	1.8e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSSMAT00000004104	-	5047	-	ENSSMAP00000004039	1021 (aa)	-	-
ENSSMAT00000004198	-	4995	-	ENSSMAP00000004134	975 (aa)	-	-
ENSSMAT00000004248	-	2856	-	ENSSMAP00000004184	951 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.103	ENSG00000086200	IPO11	100	90.741	Homo_sapiens
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	97.538	ENSAPOG00000009256	ipo11	100	97.538	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.930	ENSAMEG00000004080	IPO11	99	83.930	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000002409	ipo11	92	97.007	ENSACIG00000003345	ipo11	98	97.022	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	93.047	ENSAOCG00000000164	ipo11	100	93.047	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	93.252	ENSAPEG00000005496	ipo11	100	93.252	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000002409	ipo11	95	96.855	ENSATEG00000016853	ipo11	99	96.855	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	78.985	ENSAPLG00000009338	IPO11	100	78.985	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	82.667	ENSACAG00000008472	IPO11	99	82.667	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.103	ENSANAG00000027877	IPO11	99	84.103	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	90.491	ENSACLG00000014997	ipo11	100	90.491	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	82.275	ENSAMXG00000005993	ipo11	100	82.275	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000002409	ipo11	88	83.740	ENSBTAG00000018616	IPO11	99	83.740	Bos_taurus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.103	ENSCJAG00000015559	IPO11	99	84.103	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.410	ENSCAFG00000007240	IPO11	100	84.410	Canis_familiaris
ENSSMAG00000002409	ipo11	72	83.499	ENSCAFG00020022776	-	99	83.499	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.795	ENSCHIG00000013218	IPO11	100	83.795	Capra_hircus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	82.256	ENSCPOG00000009412	IPO11	100	82.256	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.308	ENSCCAG00000024860	IPO11	99	84.308	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.103	ENSCATG00000040159	IPO11	100	84.103	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.205	ENSCLAG00000003889	IPO11	100	84.205	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000002409	ipo11	56	83.610	ENSCSAG00000016001	IPO11	97	83.456	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000002409	ipo11	76	81.573	ENSCHOG00000002780	IPO11	77	81.898	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.615	ENSCPBG00000026824	IPO11	100	88.953	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000002409	ipo11	99	34.448	ENSCING00000006626	-	99	34.448	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000002409	ipo11	99	33.566	ENSCSAVG00000003664	-	99	33.566	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	78.593	ENSCANG00000042405	IPO11	99	82.907	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.692	ENSCGRG00001012206	Ipo11	100	83.692	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.692	ENSCGRG00000003026	-	100	83.692	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	95.385	ENSCSEG00000017257	ipo11	100	95.385	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	95.487	ENSCVAG00000011995	ipo11	100	95.487	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	91.179	ENSDARG00000054224	ipo11	100	91.179	Danio_rerio
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	81.026	ENSDORG00000002721	Ipo11	100	81.026	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000002409	ipo11	99	35.237	FBgn0284254	Impbeta11	95	34.716	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000002409	ipo11	99	60.597	ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.700	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000002409	ipo11	54	78.868	ENSEASG00005006951	-	98	78.868	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.000	ENSECAG00000014185	IPO11	99	83.047	Equus_caballus
ENSSMAG00000002409	ipo11	92	84.494	ENSEEUG00000000271	IPO11	92	84.685	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	93.333	ENSELUG00000002842	ipo11	100	93.333	Esox_lucius
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.410	ENSFCAG00000003236	IPO11	100	84.410	Felis_catus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.000	ENSFALG00000011086	IPO11	100	84.000	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.487	ENSFDAG00000016117	IPO11	100	83.487	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	81.365	ENSFHEG00000017985	ipo11	100	81.365	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	92.103	ENSGMOG00000007727	ipo11	100	92.103	Gadus_morhua
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.077	ENSGALG00000014740	IPO11	100	83.077	Gallus_gallus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	94.667	ENSGAFG00000012342	ipo11	100	94.680	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	94.359	ENSGACG00000006939	ipo11	100	94.359	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000002409	ipo11	84	87.791	ENSGAGG00000008880	IPO11	97	87.791	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.205	ENSGGOG00000003240	IPO11	100	84.205	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	96.513	ENSHBUG00000004364	ipo11	100	96.513	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.000	ENSHGLG00000002375	IPO11	100	84.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.000	ENSHGLG00100011662	IPO11	100	84.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	90.122	ENSHCOG00000013529	ipo11	100	90.122	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000002409	ipo11	99	72.895	ENSIPUG00000019077	clc4f	100	72.895	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.308	ENSSTOG00000006070	IPO11	100	84.308	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.179	ENSJJAG00000007223	Ipo11	100	83.179	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000002409	ipo11	99	95.165	ENSKMAG00000013674	ipo11	100	95.165	Kryptolebias_marmoratus
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ENSSMAG00000002409	ipo11	100	88.358	ENSLOCG00000007848	ipo11	100	91.097	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.692	ENSLAFG00000003115	IPO11	100	83.641	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.103	ENSMFAG00000035631	IPO11	98	84.103	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.103	ENSMMUG00000001233	IPO11	100	90.741	Macaca_mulatta
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ENSSMAG00000002409	ipo11	100	93.686	ENSMMOG00000001391	ipo11	100	93.686	Mola_mola
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ENSSMAG00000002409	ipo11	100	96.205	ENSMALG00000017198	ipo11	100	96.205	Monopterus_albus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.077	MGP_CAROLIEiJ_G0018871	Ipo11	100	83.077	Mus_caroli
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.282	ENSMUSG00000042590	Ipo11	100	83.282	Mus_musculus
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ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.282	MGP_SPRETEiJ_G0019750	Ipo11	100	83.282	Mus_spretus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	81.333	ENSMPUG00000007026	IPO11	100	81.333	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.000	ENSMLUG00000011760	IPO11	99	84.000	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	83.487	ENSNGAG00000007024	Ipo11	100	83.487	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000002409	ipo11	95	89.816	ENSNBRG00000013831	ipo11	100	89.816	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.000	ENSNLEG00000003072	IPO11	100	84.000	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000002409	ipo11	74	82.609	ENSMEUG00000003783	-	74	82.609	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.205	ENSODEG00000017269	IPO11	100	84.205	Octodon_degus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	96.821	ENSONIG00000015147	ipo11	100	96.821	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000002409	ipo11	84	82.742	ENSOANG00000012524	IPO11	91	82.742	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	94.667	ENSORLG00000004267	ipo11	100	96.512	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	94.872	ENSORLG00020002280	ipo11	100	95.334	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	94.667	ENSORLG00015010565	ipo11	100	97.093	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	95.179	ENSOMEG00000021765	ipo11	100	95.179	Oryzias_melastigma
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ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.410	ENSPTIG00000015280	IPO11	100	84.410	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000002409	ipo11	100	84.205	ENSPTRG00000016915	IPO11	100	84.205	Pan_troglodytes
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ENSSMAG00000002409	ipo11	100	90.667	ENSPKIG00000016964	ipo11	100	90.667	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSSMAG00000002409	ipo11	90	87.955	ENSPMGG00000013232	ipo11	95	87.955	Periophthalmus_magnuspinnatus
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