EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000002775 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago3a
Alias: Ago3a|eif2c3a|sb:eu275|sb:eu416
Full Name: argonaute RISC catalytic component 3a
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29777 bases
Position: chr1:13500839-13530615
Accession: ZDB-GENE-051107-16
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000004520	PAZ	PF02170.22	1.6e-28	1	1
ENSSMAP00000004554	PAZ	PF02170.22	2e-26	1	1
ENSSMAP00000004554	Piwi	PF02171.17	1e-113	1	1
ENSSMAP00000004520	Piwi	PF02171.17	1.2e-113	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000004590	-	3455	-	ENSSMAP00000004520	860 (aa)	-	UPI00097CE702
ENSSMAT00000004625	-	2385	-	ENSSMAP00000004554	794 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	95.963	ENSSMAG00000001969	-	100	95.963
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	81.360	ENSSMAG00000014089	ago2	97	80.756
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	79.853	ENSSMAG00000000808	ago4	93	78.689
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	84.005	ENSSMAG00000002841	ago1	100	83.506

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSG00000126070	AGO3	100	98.403	Homo_sapiens
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	95.963	ENSAPOG00000014494	-	100	95.963	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	99.767	ENSAPOG00000024260	ago3a	100	99.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSAMEG00000000497	AGO3	100	97.209	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	98.866	ENSACIG00000005333	ago3a	100	99.621	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	96.348	ENSACIG00000019272	AGO3	100	97.092	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	88.413	ENSAOCG00000017051	-	100	89.210	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000002775	ago3a	54	90.188	ENSAOCG00000022538	-	91	90.188	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	99.767	ENSAOCG00000017642	ago3a	100	99.767	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	98.962	ENSAPEG00000004375	ago3a	100	98.962	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	95.732	ENSAPEG00000020249	-	100	95.732	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	98.962	ENSATEG00000008458	ago3a	100	98.962	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	96.078	ENSATEG00000005160	-	100	96.078	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.233	ENSAPLG00000009642	AGO3	99	97.427	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSACAG00000003385	AGO3	100	96.977	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSANAG00000037735	AGO3	100	97.093	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	95.502	ENSACLG00000001965	-	100	95.502	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	99.767	ENSACLG00000000963	ago3a	100	99.767	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	96.599	ENSAMXG00000002198	ago3a	100	97.345	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	94.962	ENSAMXG00000009571	ago3b	100	95.702	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSBTAG00000018324	AGO3	100	97.209	Bos_taurus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSCJAG00000031580	AGO3	100	97.093	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.103	ENSCAFG00000024682	AGO3	100	97.093	Canis_familiaris
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSCAFG00020009051	AGO3	99	97.771	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSCHIG00000011536	AGO3	100	97.209	Capra_hircus
ENSSMAG00000002775	ago3a	84	96.961	ENSTSYG00000011897	AGO3	100	96.961	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	81.784	ENSCAPG00000011589	AGO3	99	81.784	Cavia_aperea
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	93.451	ENSCPOG00000030524	AGO3	99	93.911	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSCCAG00000034189	AGO3	100	98.403	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSCATG00000029748	AGO3	100	98.403	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSCLAG00000013184	AGO3	100	97.209	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSCSAG00000001092	AGO3	100	97.093	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000002775	ago3a	92	97.143	ENSCHOG00000011621	AGO3	92	97.143	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.355	ENSCPBG00000018583	AGO3	100	97.326	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSCANG00000033258	AGO3	100	98.403	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.103	ENSCGRG00001024614	Ago3	100	96.977	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.103	ENSCGRG00000010670	Ago3	100	96.977	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	98.237	ENSCSEG00000001040	ago3a	100	98.989	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	90.423	ENSCSEG00000009788	-	100	91.011	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000002775	ago3a	52	86.842	ENSCVAG00000011229	-	98	86.842	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	99.302	ENSCVAG00000018224	ago3a	100	99.302	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.093	ENSDARG00000063079	ago3b	100	97.093	Danio_rerio
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	98.616	ENSDARG00000059888	ago3a	100	98.616	Danio_rerio
ENSSMAG00000002775	ago3a	88	97.098	ENSDNOG00000008106	AGO3	100	97.098	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSDORG00000009414	Ago3	100	97.209	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000002775	ago3a	85	96.620	ENSETEG00000007639	AGO3	89	96.620	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSEASG00005012089	AGO3	100	97.209	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSECAG00000023972	AGO3	100	97.209	Equus_caballus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	80.581	ENSEEUG00000007058	AGO3	100	80.581	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	95.444	ENSELUG00000001774	-	100	95.444	Esox_lucius
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	95.466	ENSELUG00000016755	ago3a	100	96.207	Esox_lucius
ENSSMAG00000002775	ago3a	79	97.456	ENSFCAG00000000747	-	100	98.403	Felis_catus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.233	ENSFALG00000000802	AGO3	99	97.310	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSFDAG00000012874	AGO3	99	97.535	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	94.507	ENSFHEG00000016205	-	100	94.348	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000002775	ago3a	89	80.081	ENSGMOG00000019418	-	89	80.081	Gadus_morhua
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.733	ENSGMOG00000013069	-	100	98.204	Gadus_morhua
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.355	ENSGALG00000043711	AGO3	100	97.209	Gallus_gallus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	94.507	ENSGAFG00000015911	-	100	94.233	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	99.535	ENSGAFG00000009808	ago3a	100	99.535	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	95.970	ENSGACG00000002455	AGO3	100	96.647	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	98.494	ENSGACG00000012453	ago3a	100	99.247	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.355	ENSGAGG00000012887	AGO3	100	97.209	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSGGOG00000036711	AGO3	100	97.093	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	95.502	ENSHBUG00000017794	-	100	95.502	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000002775	ago3a	93	94.197	ENSHBUG00000010542	ago3a	97	98.191	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSHGLG00000012538	AGO3	100	97.209	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	96.599	ENSHGLG00100006043	AGO3	100	97.059	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	94.507	ENSHCOG00000011851	AGO3	100	94.464	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000002775	ago3a	87	97.718	ENSHCOG00000005674	ago3a	97	97.718	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	92.965	ENSIPUG00000023241	ago3a	99	93.612	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	96.770	ENSIPUG00000008548	ago3b	100	96.770	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000002775	ago3a	96	97.237	ENSSTOG00000025904	AGO3	100	92.674	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.355	ENSJJAG00000017436	Ago3	100	97.326	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	98.962	ENSKMAG00000019534	ago3a	100	98.962	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	94.989	ENSLBEG00000016073	-	100	94.989	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	99.118	ENSLBEG00000007592	ago3a	100	99.874	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSLAFG00000002744	AGO3	100	97.209	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSMFAG00000035610	AGO3	100	98.403	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSMMUG00000006252	AGO3	100	97.093	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSMNEG00000039518	AGO3	100	98.403	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSMLEG00000027912	AGO3	100	98.403	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.985	ENSMAMG00000008440	ago3a	100	98.736	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	95.502	ENSMAMG00000005697	-	100	95.502	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	95.617	ENSMZEG00005026243	-	100	95.617	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	99.767	ENSMZEG00005007949	ago3a	100	99.767	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.233	ENSMGAG00000003773	AGO3	99	97.430	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	84.257	ENSMAUG00000010128	Ago3	96	85.176	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSMICG00000016158	AGO3	100	97.209	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	94.081	ENSMOCG00000020568	Ago3	99	94.484	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	93.955	ENSMMOG00000014065	-	100	94.690	Mola_mola
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	93.696	ENSMMOG00000018446	ago3a	100	94.417	Mola_mola
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.229	ENSMODG00000017869	AGO3	100	97.209	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	93.703	ENSMALG00000014658	-	99	94.111	Monopterus_albus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	95.718	ENSMALG00000010895	ago3a	99	96.698	Monopterus_albus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	96.744	MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	96.744	Mus_caroli
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ENSSMAG00000002775	ago3a	100	96.744	MGP_PahariEiJ_G0028808	Ago3	100	96.744	Mus_pahari
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	96.860	MGP_SPRETEiJ_G0027456	Ago3	100	96.860	Mus_spretus
ENSSMAG00000002775	ago3a	79	97.297	ENSMLUG00000009668	AGO3	100	98.243	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	97.103	ENSNGAG00000012607	Ago3	100	97.093	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	96.096	ENSNBRG00000015687	AGO3	100	96.839	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	90.063	ENSNBRG00000010936	ago3a	100	90.440	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000002775	ago3a	100	92.569	ENSNLEG00000027092	AGO3	99	93.184	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000002775	ago3a	87	94.286	ENSMEUG00000009200	AGO3	84	94.286	Notamacropus_eugenii
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