EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000002783 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7551 bases
Position: chr3:21279941-21287491
Accession: ZDB-GENE-030219-11
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000004500	SRP54	PF00448.22	5.5e-48	1	1
ENSSMAP00000004500	SRP54_N	PF02881.19	8.1e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000004571	-	1809	-	ENSSMAP00000004500	602 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSMAG00000002783's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSMAG00000002783's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.096	ENSG00000182934	SRPRA	100	66.149	Homo_sapiens
ENSSMAG00000002783	srpra	100	79.736	ENSAPOG00000017588	srpra	100	79.736	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.941	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	66.563	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000002783	srpra	100	75.193	ENSACIG00000021588	srpra	100	75.387	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	85.155	ENSAOCG00000018884	srpra	100	85.667	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000002783	srpra	100	84.992	ENSAPEG00000022286	srpra	100	85.502	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000002783	srpra	100	80.033	ENSATEG00000023578	srpra	100	80.033	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000002783	srpra	93	67.208	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	68.534	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000002783	srpra	100	67.180	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	67.385	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.096	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	65.367	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000002783	srpra	100	74.615	ENSACLG00000000518	srpra	100	74.652	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000002783	srpra	100	72.552	ENSAMXG00000009975	srpra	100	70.787	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.798	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	65.426	Bos_taurus
ENSSMAG00000002783	srpra	99	48.661	WBGene00009521	F38A1.8	99	48.038	Caenorhabditis_elegans
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.199	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	65.312	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	64.596	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	63.453	Canis_familiaris
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.304	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	65.163	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.667	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	65.116	Capra_hircus
ENSSMAG00000002783	srpra	81	85.366	ENSTSYG00000005187	SRPRA	100	73.990	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000002783	srpra	95	67.808	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	87.970	Cavia_aperea
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.204	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	87.970	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.096	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	66.149	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.941	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	65.109	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.049	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.719	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.096	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.563	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000002783	srpra	52	87.245	ENSCHOG00000010015	-	71	87.245	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000002783	srpra	100	64.526	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	66.769	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000002783	srpra	99	55.435	ENSCING00000008954	-	100	55.283	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000002783	srpra	99	57.795	ENSCSAVG00000005602	-	100	58.599	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.888	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	65.523	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.256	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	66.041	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.256	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.148	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000002783	srpra	100	83.089	ENSCSEG00000002374	srpra	100	83.089	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000002783	srpra	100	77.727	ENSCVAG00000019881	srpra	100	78.341	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	72.308	ENSDARG00000061124	srpra	100	71.385	Danio_rerio
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.154	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	65.177	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.667	ENSDORG00000016719	Srpr	100	67.344	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000002783	srpra	99	51.339	FBgn0010391	Gtp-bp	100	52.716	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.891	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	64.697	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000002783	srpra	63	72.798	ENSEBUG00000002602	srpra	96	69.762	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.719	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	64.798	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.719	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	64.798	Equus_caballus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	62.208	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	61.646	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	73.435	ENSELUG00000017643	srpra	100	74.426	Esox_lucius
ENSSMAG00000002783	srpra	79	60.465	ENSFCAG00000030894	-	99	57.864	Felis_catus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.770	ENSFCAG00000011274	-	100	64.697	Felis_catus
ENSSMAG00000002783	srpra	99	62.519	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	64.099	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.895	ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	88.636	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000002783	srpra	100	76.336	ENSFHEG00000016959	srpra	100	76.489	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	75.355	ENSGMOG00000013244	srpra	100	77.107	Gadus_morhua
ENSSMAG00000002783	srpra	100	67.580	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	68.673	Gallus_gallus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	82.680	ENSGAFG00000000453	srpra	100	82.680	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000002783	srpra	100	77.138	ENSGACG00000006550	srpra	100	77.449	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	64.955	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	67.381	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.096	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	66.149	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000002783	srpra	100	74.462	ENSHBUG00000000119	srpra	100	74.498	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.895	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.895	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000002783	srpra	100	81.683	ENSHCOG00000010749	srpra	100	81.683	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000002783	srpra	94	69.444	ENSIPUG00000000867	srpra	99	69.608	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.096	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	66.149	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.000	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	65.781	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	77.419	ENSKMAG00000002280	srpra	100	77.573	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	74.924	ENSLBEG00000009608	srpra	100	78.955	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000002783	srpra	100	68.829	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	69.620	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000002783	srpra	100	73.323	ENSLOCG00000002733	srpra	100	72.965	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	64.923	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	64.798	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.252	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	66.719	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.252	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	66.719	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.252	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	66.304	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.941	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	65.109	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	75.772	ENSMAMG00000000473	srpra	100	75.846	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	74.615	ENSMZEG00005013432	srpra	100	74.652	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000002783	srpra	93	66.884	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	67.987	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.256	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	66.041	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.771	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	66.927	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.948	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	65.728	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000002783	srpra	100	82.229	ENSMMOG00000005019	srpra	100	82.419	Mola_mola
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.874	ENSMODG00000004576	-	100	66.354	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000002783	srpra	100	75.613	ENSMALG00000011343	srpra	100	77.217	Monopterus_albus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.102	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	89.394	Mus_caroli
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.927	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	88.636	Mus_musculus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.615	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	88.636	Mus_pahari
ENSSMAG00000002783	srpra	100	62.407	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	61.161	Mus_spretus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.149	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	66.512	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.250	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	66.875	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.102	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	66.303	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000002783	srpra	100	74.769	ENSNBRG00000017311	srpra	100	74.652	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000002783	srpra	99	62.074	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	64.532	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000002783	srpra	93	65.506	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	64.735	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000002783	srpra	100	62.191	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.240	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.842	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	66.354	Octodon_degus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	74.308	ENSONIG00000005324	srpra	100	74.343	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.667	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	66.978	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	76.050	ENSORLG00000014676	srpra	100	75.385	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000002783	srpra	100	74.154	ENSORLG00020009240	srpra	100	75.267	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000002783	srpra	100	78.288	ENSORLG00015015405	srpra	100	77.516	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000002783	srpra	100	79.421	ENSOMEG00000005872	srpra	100	79.421	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000002783	srpra	100	67.134	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	65.938	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000002783	srpra	100	62.980	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	64.099	Ovis_aries
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.096	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	66.149	Pan_paniscus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.770	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	64.697	Panthera_pardus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.615	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	64.541	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.096	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	66.149	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.252	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	66.719	Papio_anubis
ENSSMAG00000002783	srpra	100	74.682	ENSPKIG00000016106	srpra	100	75.598	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000002783	srpra	93	65.913	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	67.381	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000002783	srpra	100	76.480	ENSPMGG00000001393	srpra	100	76.777	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.102	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	65.884	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000002783	srpra	99	60.630	ENSPMAG00000009559	srpra	99	59.937	Petromyzon_marinus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.202	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	65.443	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	76.606	ENSPFOG00000003114	srpra	100	77.829	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000002783	srpra	100	82.459	ENSPLAG00000007323	srpra	100	82.680	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000002783	srpra	100	82.702	ENSPMEG00000015658	srpra	100	82.043	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000002783	srpra	100	81.773	ENSPREG00000004937	srpra	100	82.102	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000002783	srpra	88	86.842	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	86.842	Pongo_abelii
ENSSMAG00000002783	srpra	61	90.698	ENSPCAG00000003801	-	61	90.698	Procavia_capensis
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.615	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	66.355	Propithecus_coquereli
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.938	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	66.719	Pteropus_vampyrus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	74.615	ENSPNYG00000012371	srpra	100	74.652	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000002783	srpra	100	71.870	ENSPNAG00000013476	srpra	100	73.107	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.102	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	65.884	Rattus_norvegicus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.563	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	66.304	Rhinopithecus_bieti
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.096	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	66.563	Rhinopithecus_roxellana
ENSSMAG00000002783	srpra	54	41.279	YDR292C	-	52	41.641	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.941	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.407	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSMAG00000002783	srpra	94	66.060	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.615	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000002783	srpra	100	77.668	ENSSFOG00015008837	srpra	100	77.011	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	84.754	ENSSDUG00000013920	srpra	100	84.754	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000002783	srpra	100	78.834	ENSSLDG00000008601	srpra	93	78.834	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000002783	srpra	80	85.366	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	Sorex_araneus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.485	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	67.028	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000002783	srpra	96	89.071	ENSSPAG00000005103	srpra	100	78.746	Stegastes_partitus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.770	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	66.822	Sus_scrofa
ENSSMAG00000002783	srpra	93	62.761	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	64.332	Taeniopygia_guttata
ENSSMAG00000002783	srpra	100	79.741	ENSTRUG00000006856	srpra	100	79.741	Takifugu_rubripes
ENSSMAG00000002783	srpra	100	72.508	ENSTNIG00000010316	srpra	100	72.508	Tetraodon_nigroviridis
ENSSMAG00000002783	srpra	100	67.287	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	65.062	Tursiops_truncatus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.096	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	66.460	Ursus_americanus
ENSSMAG00000002783	srpra	96	61.650	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	61.489	Ursus_maritimus
ENSSMAG00000002783	srpra	67	90.698	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	90.698	Vicugna_pacos
ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.460	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	65.319	Vulpes_vulpes
ENSSMAG00000002783	srpra	100	58.904	ENSXETG00000003920	srpra	100	58.079	Xenopus_tropicalis
ENSSMAG00000002783	srpra	100	75.914	ENSXCOG00000001286	srpra	100	75.914	Xiphophorus_couchianus
ENSSMAG00000002783	srpra	100	78.034	ENSXMAG00000028401	srpra	100	78.187	Xiphophorus_maculatus