EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000002841 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: argonaute RISC catalytic component 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18975 bases
Position: chr1:13531117-13550091
Accession: ZDB-GENE-110606-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000004627	PAZ	PF02170.22	7.7e-29	1	1
ENSSMAP00000004627	Piwi	PF02171.17	1.7e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000004698	-	5821	-	ENSSMAP00000004627	858 (aa)	-	A0A2U9AX29

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000002841	ago1	100	82.151	ENSSMAG00000001969	-	100	82.151
ENSSMAG00000002841	ago1	100	83.506	ENSSMAG00000002775	ago3a	100	84.005
ENSSMAG00000002841	ago1	99	80.795	ENSSMAG00000000808	ago4	93	80.237
ENSSMAG00000002841	ago1	98	82.479	ENSSMAG00000014089	ago2	99	80.974

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSG00000092847	AGO1	100	97.187	Homo_sapiens
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.650	ENSAPOG00000024299	ago1	100	99.650	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	96.154	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000002841	ago1	82	93.162	ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.650	ENSAOCG00000017727	ago1	100	99.650	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.650	ENSAPEG00000004458	ago1	100	99.650	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.650	ENSATEG00000008523	ago1	100	99.650	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000002841	ago1	99	89.559	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	89.559	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000002841	ago1	91	97.059	ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.028	ENSANAG00000037711	AGO1	100	96.154	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.417	ENSACLG00000000890	ago1	100	99.417	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000002841	ago1	80	99.854	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.854	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.568	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	Bos_taurus
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.576	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	96.154	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	96.154	Canis_familiaris
ENSSMAG00000002841	ago1	99	95.770	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.222	ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	Capra_hircus
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.576	ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000002841	ago1	100	75.641	ENSTSYG00000032426	-	99	78.143	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000002841	ago1	89	92.531	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	Cavia_aperea
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.576	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	96.154	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	95.804	ENSCATG00000031521	AGO1	100	97.187	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.576	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	96.154	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000002841	ago1	85	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000002841	ago1	100	95.921	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.921	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSCANG00000039798	AGO1	100	96.154	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.235	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	96.154	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.576	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	96.576	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000002841	ago1	99	97.567	ENSCSEG00000001051	ago1	100	97.567	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.534	ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.534	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.068	ENSDARG00000092644	ago1	100	99.068	Danio_rerio
ENSSMAG00000002841	ago1	91	97.187	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	97.187	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000002841	ago1	91	97.087	ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000002841	ago1	82	89.816	ENSETEG00000007626	AGO1	100	89.197	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.576	ENSEASG00005012086	AGO1	100	96.154	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSECAG00000024353	AGO1	100	96.154	Equus_caballus
ENSSMAG00000002841	ago1	92	88.818	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000002841	ago1	91	99.744	ENSELUG00000016803	ago1	100	99.744	Esox_lucius
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	96.154	Felis_catus
ENSSMAG00000002841	ago1	91	90.816	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000002841	ago1	100	96.037	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.037	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000002841	ago1	99	95.637	ENSFHEG00000017927	ago1	100	95.637	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000002841	ago1	87	86.649	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.649	Gadus_morhua
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.679	ENSGALG00000002249	AGO1	100	96.037	Gallus_gallus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.883	ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.883	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000002841	ago1	87	99.334	ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000002841	ago1	91	97.059	ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000002841	ago1	100	95.688	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	96.154	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.417	ENSHBUG00000010459	ago1	100	99.417	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.576	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	96.154	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.576	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	96.154	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000002841	ago1	99	99.646	ENSHCOG00000005708	ago1	100	99.646	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.184	ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.184	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000002841	ago1	99	95.902	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	96.154	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	96.037	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	96.037	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.767	ENSKMAG00000019464	ago1	100	99.767	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.767	ENSLBEG00000007694	ago1	100	99.767	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000002841	ago1	99	90.706	ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.706	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000002841	ago1	100	94.639	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.639	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.235	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	96.154	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000002841	ago1	99	91.972	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	92.052	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000002841	ago1	100	92.308	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	97.187	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	96.154	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.650	ENSMAMG00000008381	ago1	100	99.650	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.417	ENSMZEG00005007996	ago1	100	99.417	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000002841	ago1	99	90.603	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	96.154	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.028	ENSMICG00000016147	AGO1	100	96.154	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000002841	ago1	99	95.688	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	96.037	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000002841	ago1	78	99.701	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.701	Mola_mola
ENSSMAG00000002841	ago1	100	95.804	ENSMODG00000023335	AGO1	100	95.804	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000002841	ago1	99	99.528	ENSMALG00000011057	ago1	100	99.528	Monopterus_albus
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	Mus_caroli
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	98.011	Mus_musculus
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	98.011	Mus_pahari
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	98.011	Mus_spretus
ENSSMAG00000002841	ago1	84	97.772	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.772	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000002841	ago1	61	94.646	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	94.646	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	95.921	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	95.921	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000002841	ago1	91	99.872	ENSNBRG00000010867	ago1	100	99.872	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000002841	ago1	100	96.154	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000002841	ago1	84	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000002841	ago1	93	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000002841	ago1	100	94.919	ENSODEG00000005321	AGO1	100	96.154	Octodon_degus
ENSSMAG00000002841	ago1	99	99.412	ENSONIG00000016345	ago1	100	99.412	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	88.153	ENSOANG00000002080	AGO1	100	88.153	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.679	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	96.037	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.767	ENSORLG00000014965	ago1	100	99.767	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.767	ENSORLG00020018253	ago1	100	99.767	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.767	ENSORLG00015003287	ago1	100	99.767	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.767	ENSOMEG00000020528	ago1	100	99.767	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.019	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	96.019	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.568	ENSOARG00000019591	AGO1	100	96.154	Ovis_aries
ENSSMAG00000002841	ago1	100	95.688	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	96.154	Pan_paniscus
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	96.154	Panthera_pardus
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.560	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	95.921	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000002841	ago1	100	95.688	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	96.154	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSPANG00000009060	AGO1	100	96.154	Papio_anubis
ENSSMAG00000002841	ago1	98	95.843	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.843	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000002841	ago1	80	98.547	ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000002841	ago1	99	95.906	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000002841	ago1	100	95.804	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.804	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.883	ENSPFOG00000005867	ago1	100	99.883	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.883	ENSPLAG00000002824	ago1	100	99.883	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.883	ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.883	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.883	ENSPREG00000006534	ago1	100	99.883	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000002841	ago1	98	96.797	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	96.154	Pongo_abelii
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