EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000002970 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4483 bases
Position: chr4:6576207-6580689
Accession: ZDB-GENE-040426-1578
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000004810	RRM_1	PF00076.22	1.2e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000004883	-	2613	-	ENSSMAP00000004810	454 (aa)	-	A0A2U9B7H0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	58.770	ENSG00000102241	HTATSF1	97	56.780	Homo_sapiens
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	78.867	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	78.214	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	75.325	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	77.106	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	78.913	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	78.478	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	79.476	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	79.476	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000002970	htatsf1	93	80.706	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	80.471	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	92	62.619	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.619	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000002970	htatsf1	72	68.196	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.950	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000002970	htatsf1	85	58.355	ENSANAG00000025458	-	53	58.355	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.623	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	77.273	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	68.398	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	68.467	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	82	63.874	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	50	63.874	Bos_taurus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	70	37.941	WBGene00022025	Y65B4A.1	75	37.883	Caenorhabditis_elegans
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	59.594	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	55	59.410	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000002970	htatsf1	78	62.192	ENSCCAG00000025329	-	55	63.660	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	58.597	ENSCATG00000029963	HTATSF1	55	58.597	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	58.597	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	55	58.597	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	62.500	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	62.500	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000002970	htatsf1	89	44.211	ENSCING00000005914	-	82	44.928	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000002970	htatsf1	87	43.935	ENSCSAVG00000000371	-	87	44.382	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	58.371	ENSCANG00000028495	HTATSF1	55	58.371	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	75.983	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	76.638	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	68.490	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	67.686	Danio_rerio
ENSSMAG00000002970	htatsf1	78	46.240	FBgn0037081	barc	63	46.779	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000002970	htatsf1	87	56.459	ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	57.248	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	59.410	ENSEASG00005003440	HTATSF1	54	59.410	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	59.410	ENSECAG00000009156	HTATSF1	54	59.410	Equus_caballus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	61.905	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	63.368	Esox_lucius
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	57.895	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	55	57.701	Felis_catus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	83	67.013	ENSFALG00000003728	HTATSF1	83	67.013	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000002970	htatsf1	98	78.319	ENSFHEG00000020286	htatsf1	98	77.655	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	79	75.278	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	75.278	Gadus_morhua
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	59.957	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	59.868	Gallus_gallus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.419	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	76.419	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	75.599	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	75.381	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	58.770	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	54	58.770	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.840	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	77.489	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000002970	htatsf1	84	62.690	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	50	62.755	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000002970	htatsf1	98	71.205	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	71.875	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	65.319	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	66.453	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	59.589	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	56	59.633	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.856	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	76.419	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	77.948	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	77.948	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	60.659	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	60.394	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	46.089	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	45.397	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	92	60.789	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	54	65.013	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	58.597	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	55	58.597	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	58.597	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	55	58.597	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	58.597	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	60	58.597	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	58.597	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	55	58.597	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	77.243	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	77.462	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.840	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	77.489	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000002970	htatsf1	93	61.215	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	97	61.215	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	59.318	ENSMICG00000009348	HTATSF1	55	58.770	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	78.166	ENSMMOG00000011013	htatsf1	100	77.948	Mola_mola
ENSSMAG00000002970	htatsf1	54	60.078	ENSMODG00000000199	-	91	58.921	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	61.184	ENSMODG00000014087	-	96	60.793	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	78.166	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	77.948	Monopterus_albus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	58.352	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	53	58.161	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	56.561	ENSMLUG00000009234	-	51	62.533	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	78	63.187	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	50	63.802	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.407	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	77.056	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	58.542	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	54	58.542	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000002970	htatsf1	86	65.174	ENSMEUG00000004133	-	89	67.792	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.840	ENSONIG00000008638	htatsf1	100	77.922	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	91	59.952	ENSOANG00000011674	-	98	59.569	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	73.696	ENSORLG00000002356	htatsf1	100	73.261	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	72.944	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	73.160	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	72.668	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	72.885	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.906	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	75.817	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	58.770	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	54	58.770	Pan_paniscus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	58.810	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	55	58.621	Panthera_pardus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	85	59.690	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	50	59.481	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	58.770	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	54	58.770	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	67.329	ENSPKIG00000024852	htatsf1	99	67.329	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000002970	htatsf1	76	66.667	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	97	66.282	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	71.895	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	71.242	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	55.507	ENSPCIG00000018896	-	84	62.338	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	83	65.385	ENSPCIG00000030173	-	86	65.385	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.419	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	76.856	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.201	ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	76.419	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	75.983	ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	76.419	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.201	ENSPREG00000007811	htatsf1	100	76.201	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	58.542	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	54	59.318	Pongo_abelii
ENSSMAG00000002970	htatsf1	96	53.020	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	51	58.158	Procavia_capensis
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	59.404	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	54	59.404	Propithecus_coquereli
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	58.050	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	60	57.859	Pteropus_vampyrus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	77.056	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	77.706	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	67.308	ENSPNAG00000006166	htatsf1	99	67.308	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	58.597	ENSRROG00000021939	HTATSF1	55	58.597	Rhinopithecus_roxellana
ENSSMAG00000002970	htatsf1	95	58.065	ENSSBOG00000017914	-	50	63.377	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSMAG00000002970	htatsf1	82	67.647	ENSSHAG00000006440	-	94	67.647	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	58.734	ENSSHAG00000018908	-	83	66.753	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	60.805	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	61.359	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.419	ENSSDUG00000020002	htatsf1	99	77.293	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	81.659	ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	82.096	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000002970	htatsf1	98	54.902	ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	61.719	Sorex_araneus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	59.737	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	59.300	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	81.659	ENSSPAG00000000732	htatsf1	100	81.659	Stegastes_partitus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	78	64.286	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	54	64.249	Sus_scrofa
ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	60.480	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	99	60.349	Taeniopygia_guttata
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	73.799	ENSTRUG00000013383	htatsf1	100	73.362	Takifugu_rubripes
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	72.926	ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	72.926	Tetraodon_nigroviridis
ENSSMAG00000002970	htatsf1	76	62.040	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	58	62.040	Tursiops_truncatus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	58.124	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	55	57.931	Ursus_americanus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	94	58.124	ENSUMAG00000010393	HTATSF1	53	57.931	Ursus_maritimus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	98	60.619	ENSXETG00000019749	htatsf1	83	59.778	Xenopus_tropicalis
ENSSMAG00000002970	htatsf1	97	76.244	ENSXCOG00000006912	htatsf1	98	76.697	Xiphophorus_couchianus
ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	75.551	ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	75.991	Xiphophorus_maculatus