EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000005657 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ireb2
Alias: IRP2|im:7153062
Full Name: iron-responsive element binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8223 bases
Position: chr10:6573442-6581664
Accession: ZDB-GENE-051205-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000009279	Aconitase	PF00330.20	2.8e-158	1	1
ENSSMAP00000009257	Aconitase	PF00330.20	1.1e-154	1	2
ENSSMAP00000009257	Aconitase	PF00330.20	1.1e-154	2	2
ENSSMAP00000009279	Aconitase_C	PF00694.19	1.6e-36	1	1
ENSSMAP00000009257	Aconitase_C	PF00694.19	1.9e-36	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000009390	-	2676	-	ENSSMAP00000009279	891 (aa)	-	-
ENSSMAT00000009367	-	2919	-	ENSSMAP00000009257	972 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000005657	ireb2	75	61.377	ENSSMAG00000018908	aco1	80	61.145

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.219	ENSG00000136381	IREB2	97	72.973	Homo_sapiens
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	92.074	ENSAPOG00000015501	-	99	90.956	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	92.074	ENSAPOG00000020564	ireb2	99	90.956	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	92.074	ENSAPOG00000016684	ireb2	99	91.640	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	71.771	ENSAMEG00000012645	IREB2	99	68.079	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	90.937	ENSACIG00000012557	ireb2	100	90.937	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	93.094	ENSAOCG00000000407	ireb2	99	92.157	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	92.961	ENSAPEG00000009121	ireb2	99	92.021	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	87.024	ENSATEG00000021145	ireb2	99	87.024	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000005657	ireb2	98	86.594	ENSATEG00000021210	ireb2	99	85.170	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	70.784	ENSAPLG00000016388	IREB2	99	66.872	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.427	ENSANAG00000021994	IREB2	99	68.427	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	90.155	ENSACLG00000024688	ireb2	99	90.155	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	82.048	ENSAMXG00000008756	ireb2	99	79.442	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.666	ENSBTAG00000002504	IREB2	99	68.666	Bos_taurus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.149	ENSCJAG00000010259	IREB2	99	68.149	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	71.963	ENSCAFG00000001766	IREB2	99	68.497	Canis_familiaris
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	71.963	ENSCAFG00020021072	IREB2	99	69.635	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.873	ENSCHIG00000023111	IREB2	99	68.873	Capra_hircus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	71.829	ENSTSYG00000011729	IREB2	99	68.215	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000005657	ireb2	85	69.188	ENSCAPG00000011854	IREB2	99	64.737	Cavia_aperea
ENSSMAG00000005657	ireb2	85	74.022	ENSCPOG00000013905	IREB2	99	67.790	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.427	ENSCCAG00000021202	IREB2	99	68.427	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.634	ENSCATG00000033462	IREB2	99	68.634	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	71.829	ENSCLAG00000008985	IREB2	99	68.497	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.634	ENSCSAG00000014904	IREB2	99	68.634	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000005657	ireb2	96	70.839	ENSCHOG00000004107	IREB2	99	66.112	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.318	ENSCPBG00000024247	IREB2	99	69.121	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.530	ENSCANG00000029420	IREB2	99	68.530	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	67.909	ENSCGRG00001019234	Ireb2	99	67.909	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	67.909	ENSCGRG00000016786	Ireb2	99	67.909	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	88.048	ENSCSEG00000003080	ireb2	99	86.736	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	87.970	ENSCVAG00000010739	ireb2	97	86.350	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	80.984	ENSDARG00000021466	ireb2	99	76.907	Danio_rerio
ENSSMAG00000005657	ireb2	96	71.295	ENSDNOG00000009614	IREB2	99	68.550	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000005657	ireb2	89	66.038	ENSDORG00000014339	Ireb2	99	60.021	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000005657	ireb2	74	69.512	ENSETEG00000012717	IREB2	74	69.512	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	72.630	ENSEASG00005015622	IREB2	99	68.737	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	72.630	ENSECAG00000016731	IREB2	99	71.154	Equus_caballus
ENSSMAG00000005657	ireb2	92	66.556	ENSEEUG00000007999	IREB2	99	66.556	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	85.372	ENSELUG00000023666	ireb2	99	82.645	Esox_lucius
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	72.497	ENSFCAG00000001921	IREB2	99	68.737	Felis_catus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.326	ENSFALG00000010640	IREB2	99	69.415	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	71.829	ENSFDAG00000009355	IREB2	99	68.323	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	89.229	ENSFHEG00000017905	ireb2	96	88.913	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	81.854	ENSGMOG00000009184	ireb2	99	80.475	Gadus_morhua
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	70.080	ENSGALG00000035462	IREB2	99	66.874	Gallus_gallus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	89.096	ENSGAFG00000005145	ireb2	98	85.121	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	87.203	ENSGACG00000007341	ireb2	99	85.391	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	67.769	ENSGAGG00000006117	IREB2	96	67.802	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.219	ENSGGOG00000015650	IREB2	99	68.219	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	90.155	ENSHBUG00000007184	ireb2	99	90.155	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	72.764	ENSHGLG00000000783	Ireb2	99	69.119	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	72.764	ENSHGLG00100019429	Ireb2	99	69.119	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000005657	ireb2	98	85.372	ENSHCOG00000007424	ireb2	100	83.631	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	80.053	ENSIPUG00000014808	Ireb2	99	77.081	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.769	ENSSTOG00000009273	IREB2	99	68.769	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	63.759	ENSJJAG00000019768	Ireb2	99	63.759	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	89.142	ENSKMAG00000016020	ireb2	98	89.142	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	92.032	ENSLBEG00000020371	ireb2	99	90.994	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000005657	ireb2	100	61.460	ENSLACG00000001182	IREB2	100	61.460	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	80.452	ENSLOCG00000015029	ireb2	99	77.343	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.219	ENSLAFG00000012839	IREB2	99	68.219	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.634	ENSMFAG00000039630	IREB2	99	68.634	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.634	ENSMMUG00000045680	IREB2	99	68.634	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	66.460	ENSMNEG00000039698	IREB2	99	66.460	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.634	ENSMLEG00000031047	IREB2	99	68.634	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	91.368	ENSMAMG00000023095	ireb2	99	90.052	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	90.259	ENSMZEG00005010935	ireb2	99	90.259	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	70.385	ENSMGAG00000003688	IREB2	99	66.942	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.459	ENSMICG00000005757	IREB2	99	68.459	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	67.598	ENSMOCG00000010784	Ireb2	99	67.598	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	90.373	ENSMMOG00000001385	ireb2	97	90.373	Mola_mola
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	69.112	ENSMODG00000011768	IREB2	99	69.112	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000005657	ireb2	100	87.766	ENSMALG00000015314	ireb2	100	87.654	Monopterus_albus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.421	MGP_CAROLIEiJ_G0032235	Ireb2	99	68.421	Mus_caroli
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	71.941	ENSMUSG00000032293	Ireb2	98	70.909	Mus_musculus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.215	MGP_PahariEiJ_G0015103	Ireb2	99	68.215	Mus_pahari
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	71.941	MGP_SPRETEiJ_G0033375	Ireb2	99	68.318	Mus_spretus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	72.497	ENSMPUG00000010978	IREB2	95	68.898	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	70.040	ENSMLUG00000006783	IREB2	99	67.695	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.323	ENSNGAG00000017333	Ireb2	99	68.323	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	90.508	ENSNBRG00000017676	ireb2	100	90.508	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.427	ENSNLEG00000008549	IREB2	99	68.427	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000005657	ireb2	74	77.670	ENSMEUG00000001630	-	74	77.000	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	65.424	ENSOPRG00000000340	IREB2	99	65.424	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	71.963	ENSODEG00000015993	IREB2	99	68.361	Octodon_degus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	90.466	ENSONIG00000012838	ireb2	99	90.466	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	72.533	ENSOANG00000013218	-	98	69.231	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000005657	ireb2	93	71.963	ENSOCUG00000009907	IREB2	99	69.627	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	87.422	ENSORLG00000001943	ireb2	91	87.422	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	87.526	ENSORLG00020000623	ireb2	96	87.526	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	87.565	ENSORLG00015014057	ireb2	97	87.565	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	86.736	ENSOMEG00000005120	ireb2	97	86.736	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	71.829	ENSOGAG00000010622	IREB2	99	65.670	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.448	ENSOARG00000000881	IREB2	99	68.345	Ovis_aries
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.323	ENSPPAG00000038956	IREB2	99	68.323	Pan_paniscus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	72.497	ENSPPRG00000003145	IREB2	99	68.841	Panthera_pardus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	72.230	ENSPTIG00000021418	IREB2	86	68.421	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.252	ENSPTRG00000007342	IREB2	99	68.252	Pan_troglodytes
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ENSSMAG00000005657	ireb2	99	84.707	ENSPMGG00000016828	ireb2	100	83.419	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.012	ENSPEMG00000020204	Ireb2	99	68.012	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	68.692	ENSPCIG00000019022	IREB2	87	68.692	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	89.362	ENSPFOG00000014509	ireb2	98	88.394	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000005657	ireb2	99	89.628	ENSPLAG00000002220	ireb2	98	88.338	Poecilia_latipinna
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