EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000005707 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: CBP80/20-dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 45702 bases
Position: chr16:11459942-11505643
Accession: ZDB-GENE-130530-1003
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000009431	MIF4G	PF02854.19	2.6e-24	1	1
ENSSMAP00000009388	MIF4G	PF02854.19	3.3e-24	1	1
ENSSMAP00000009349	MIF4G	PF02854.19	3.4e-24	1	1
ENSSMAP00000009308	MIF4G	PF02854.19	3.8e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000009544	-	1686	-	ENSSMAP00000009431	561 (aa)	-	-
ENSSMAT00000009460	-	2203	-	ENSSMAP00000009349	641 (aa)	-	-
ENSSMAT00000009499	-	2179	-	ENSSMAP00000009388	633 (aa)	-	-
ENSSMAT00000009420	-	2302	-	ENSSMAP00000009308	674 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.696	ENSG00000134030	CTIF	100	65.468	Homo_sapiens
ENSSMAG00000005707	ctif	91	88.525	ENSAPOG00000020192	ctif	96	88.525	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000005707	ctif	88	56.940	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	54.442	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000005707	ctif	100	82.698	ENSACIG00000017099	ctif	100	80.938	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000005707	ctif	100	90.796	ENSAOCG00000014275	ctif	100	90.640	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000005707	ctif	100	89.793	ENSAPEG00000016975	ctif	100	89.645	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000005707	ctif	100	88.905	ENSATEG00000016752	ctif	100	85.651	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	60.324	ENSACAG00000018006	CTIF	92	64.266	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.814	ENSANAG00000024925	CTIF	99	56.792	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000005707	ctif	100	89.199	ENSACLG00000005956	ctif	100	83.876	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000005707	ctif	91	62.912	ENSAMXG00000015964	ctif	99	64.853	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000005707	ctif	88	89.583	ENSBTAG00000018901	CTIF	71	89.583	Bos_taurus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.842	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	56.650	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000005707	ctif	97	57.595	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	56.178	Canis_familiaris
ENSSMAG00000005707	ctif	97	57.962	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	56.178	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.430	ENSCHIG00000014455	CTIF	99	54.194	Capra_hircus
ENSSMAG00000005707	ctif	90	56.724	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	54.364	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000005707	ctif	99	55.630	ENSCAPG00000011865	CTIF	99	55.333	Cavia_aperea
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.692	ENSCPOG00000001049	CTIF	99	55.806	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.320	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	56.281	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	59.027	ENSCATG00000038134	CTIF	99	57.002	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000005707	ctif	99	59.219	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	57.048	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.887	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	55.859	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000005707	ctif	88	91.667	ENSCPBG00000025654	CTIF	70	91.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.842	ENSCANG00000030916	CTIF	99	57.191	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	59.288	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	56.818	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000005707	ctif	99	54.940	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	52.351	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000005707	ctif	100	82.456	ENSCSEG00000019857	ctif	100	82.749	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000005707	ctif	100	80.296	ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.963	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	69.163	ENSDARG00000090617	ctif	50	70.710	Danio_rerio
ENSSMAG00000005707	ctif	77	60.137	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	59.681	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.895	ENSDORG00000003221	Ctif	99	56.006	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000005707	ctif	78	89.583	ENSEASG00005016094	CTIF	99	56.650	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.631	ENSECAG00000020473	CTIF	99	57.190	Equus_caballus
ENSSMAG00000005707	ctif	90	54.467	ENSEEUG00000012451	CTIF	99	52.834	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000005707	ctif	92	96.000	ENSELUG00000008733	ctif	95	82.011	Esox_lucius
ENSSMAG00000005707	ctif	88	89.583	ENSFCAG00000000664	CTIF	71	89.583	Felis_catus
ENSSMAG00000005707	ctif	97	58.776	ENSFALG00000008943	CTIF	98	56.441	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000005707	ctif	99	56.801	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	54.589	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000005707	ctif	100	79.349	ENSFHEG00000004334	ctif	100	86.441	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000005707	ctif	88	91.667	ENSGALG00000035912	-	71	91.667	Gallus_gallus
ENSSMAG00000005707	ctif	91	89.831	ENSGAFG00000011896	ctif	100	89.831	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000005707	ctif	74	56.699	ENSGAGG00000020663	CTIF	86	61.449	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.514	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	56.979	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000005707	ctif	100	89.199	ENSHBUG00000018092	ctif	100	84.024	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.089	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	56.046	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.935	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	55.882	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000005707	ctif	99	68.196	ENSHCOG00000011784	ctif	97	86.772	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000005707	ctif	99	67.656	ENSIPUG00000014050	ctif	96	54.419	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.540	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	56.515	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.538	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	56.956	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000005707	ctif	100	81.832	ENSKMAG00000014651	ctif	100	81.093	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	75.427	ENSLBEG00000018277	ctif	99	75.891	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000005707	ctif	99	66.129	ENSLOCG00000011697	ctif	99	65.889	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	51.090	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	76.136	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000005707	ctif	99	59.027	ENSMFAG00000037903	CTIF	99	57.002	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000005707	ctif	99	59.027	ENSMMUG00000020898	CTIF	99	57.002	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000005707	ctif	99	59.027	ENSMNEG00000039395	CTIF	99	57.002	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.842	ENSMLEG00000041132	CTIF	99	56.814	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000005707	ctif	100	89.895	ENSMAMG00000014741	ctif	100	85.355	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000005707	ctif	89	86.158	ENSMZEG00005019767	ctif	90	81.954	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000005707	ctif	89	41.667	ENSMGAG00000001378	CTIF	69	91.667	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000005707	ctif	99	59.133	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	57.143	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.927	ENSMICG00000010167	CTIF	99	56.709	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.887	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	56.656	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000005707	ctif	100	81.503	ENSMMOG00000000831	ctif	100	79.619	Mola_mola
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.348	ENSMODG00000003464	CTIF	99	57.923	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000005707	ctif	74	88.462	ENSMALG00000020553	ctif	100	88.462	Monopterus_albus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.421	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	54.945	Mus_caroli
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.399	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	54.930	Mus_musculus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	59.380	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	56.911	Mus_pahari
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.146	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	88	89.583	Mus_spretus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.658	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	56.628	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.787	ENSMLUG00000003025	CTIF	99	56.770	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.887	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	56.726	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000005707	ctif	100	86.243	ENSNBRG00000008679	ctif	100	84.024	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.372	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	56.977	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000005707	ctif	99	51.339	ENSMEUG00000000218	CTIF	81	89.583	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000005707	ctif	99	56.839	ENSOPRG00000003558	CTIF	99	55.323	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.014	ENSODEG00000018390	CTIF	99	54.849	Octodon_degus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	82.306	ENSONIG00000007750	ctif	100	75.658	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000005707	ctif	85	45.955	ENSOANG00000001337	CTIF	99	43.029	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	59.119	ENSOCUG00000024842	CTIF	99	57.309	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000005707	ctif	100	81.912	ENSORLG00000005786	ctif	100	80.147	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000005707	ctif	100	81.630	ENSORLG00020005385	ctif	100	78.815	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000005707	ctif	100	81.832	ENSORLG00015011872	ctif	100	79.025	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000005707	ctif	100	82.570	ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.764	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.951	ENSOGAG00000013927	CTIF	99	56.250	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.805	ENSOARG00000003754	CTIF	99	54.604	Ovis_aries
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.514	ENSPPAG00000023554	CTIF	99	56.494	Pan_paniscus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.915	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	56.979	Panthera_pardus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.970	ENSPTIG00000013761	CTIF	99	56.792	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.669	ENSPTRG00000010009	CTIF	99	56.656	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.842	ENSPANG00000017087	CTIF	99	56.814	Papio_anubis
ENSSMAG00000005707	ctif	84	59.880	ENSPKIG00000011234	ctif	91	68.245	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000005707	ctif	88	89.583	ENSPSIG00000006508	CTIF	88	89.583	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000005707	ctif	100	74.439	ENSPMGG00000022958	ctif	100	72.264	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.796	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	56.472	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000005707	ctif	78	57.848	ENSPCIG00000026247	CTIF	97	60.671	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000005707	ctif	100	78.390	ENSPFOG00000009243	ctif	96	86.760	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000005707	ctif	100	82.232	ENSPLAG00000019171	ctif	96	87.108	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000005707	ctif	100	82.379	ENSPMEG00000020089	ctif	96	87.108	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000005707	ctif	100	76.596	ENSPREG00000017326	ctif	89	76.322	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000005707	ctif	85	58.640	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	56.031	Pongo_abelii
ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.098	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	55.155	Propithecus_coquereli
ENSSMAG00000005707	ctif	99	59.049	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	57.003	Pteropus_vampyrus
ENSSMAG00000005707	ctif	100	89.199	ENSPNYG00000007879	ctif	98	88.235	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000005707	ctif	99	53.880	ENSPNAG00000029174	ctif	100	71.775	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000005707	ctif	99	59.380	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	57.236	Rattus_norvegicus
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.842	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	57.191	Rhinopithecus_bieti
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.685	ENSRROG00000006039	CTIF	99	57.191	Rhinopithecus_roxellana
ENSSMAG00000005707	ctif	89	88.000	ENSSBOG00000028468	CTIF	71	88.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.172	ENSSHAG00000016321	CTIF	99	57.746	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000005707	ctif	99	68.047	ENSSFOG00015022594	ctif	99	67.211	Scleropages_formosus
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ENSSMAG00000005707	ctif	100	89.349	ENSSLDG00000007282	ctif	100	89.349	Seriola_lalandi_dorsalis
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