EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000007828 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo4
Alias: fc26b07|wu:fc26b07|wu:fi43b10|zgc:55678
Full Name: exportin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 48603 bases
Position: chr14:19293099-19341701
Accession: ZDB-GENE-030131-3062
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000012763	CRM1_C	PF08767.11	0.00021	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000012930	-	3453	-	ENSSMAP00000012763	1150 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.856	ENSG00000132953	XPO4	99	84.856	Homo_sapiens
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.769	ENSAMEG00000014679	XPO4	99	84.769	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	93.979	ENSACIG00000006476	xpo4	100	93.979	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	96.708	ENSATEG00000001554	xpo4	100	96.708	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	83.990	ENSAPLG00000003203	XPO4	99	83.990	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.878	ENSACAG00000002526	XPO4	99	84.696	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	94.502	ENSACLG00000017587	xpo4	99	94.588	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	91.770	ENSAMXG00000005543	xpo4	100	91.770	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	83.739	ENSBTAG00000003710	XPO4	100	83.411	Bos_taurus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.769	ENSCJAG00000004899	XPO4	99	84.769	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.769	ENSCAFG00000007222	XPO4	99	91.275	Canis_familiaris
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.682	ENSCCAG00000020123	XPO4	99	84.682	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.682	ENSCATG00000036978	XPO4	99	84.682	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000007828	xpo4	79	83.832	ENSCSAG00000018125	XPO4	100	83.832	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000007828	xpo4	75	38.117	ENSCING00000002840	-	100	37.887	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	37.500	ENSCSAVG00000008902	-	99	37.674	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.595	ENSCANG00000031628	XPO4	99	84.595	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.682	ENSCGRG00001004627	Xpo4	99	84.682	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.097	ENSCGRG00000015666	Xpo4	99	84.097	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	93.467	ENSCSEG00000009017	xpo4	99	93.467	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	92.261	ENSDARG00000010281	xpo4	99	92.261	Danio_rerio
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	84.127	ENSDNOG00000008001	XPO4	100	84.127	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	89.245	ENSELUG00000006395	xpo4	99	89.245	Esox_lucius
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.769	ENSFCAG00000000855	XPO4	99	84.769	Felis_catus
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	84.690	ENSFALG00000008733	XPO4	98	84.690	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.682	ENSFDAG00000017460	XPO4	99	84.682	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	94.621	ENSFHEG00000015300	xpo4	99	94.621	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.790	ENSGALG00000017132	XPO4	99	84.769	Gallus_gallus
ENSSMAG00000007828	xpo4	100	92.876	ENSGAFG00000003860	xpo4	99	92.876	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000007828	xpo4	100	83.189	ENSGAGG00000025383	XPO4	98	83.189	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.856	ENSGGOG00000000890	XPO4	99	84.856	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000007828	xpo4	100	95.399	ENSHBUG00000003863	xpo4	99	95.399	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.769	ENSHGLG00000018113	XPO4	99	84.769	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.769	ENSHGLG00100011413	XPO4	99	84.769	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	91.034	ENSIPUG00000003777	xpo4	99	91.034	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.508	ENSSTOG00000010695	XPO4	99	84.508	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	94.483	ENSKMAG00000013983	xpo4	99	94.483	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000007828	xpo4	100	94.276	ENSLBEG00000014303	xpo4	99	94.276	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000007828	xpo4	100	79.275	ENSLOCG00000010910	xpo4	100	86.561	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.595	ENSLAFG00000003781	XPO4	99	84.595	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.682	ENSMFAG00000030414	XPO4	99	84.682	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.595	ENSMNEG00000043776	XPO4	99	84.595	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000007828	xpo4	100	97.133	ENSMAMG00000020520	xpo4	99	97.133	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	94.502	ENSMZEG00005019337	xpo4	99	94.588	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.174	ENSMICG00000004636	XPO4	99	84.174	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.508	ENSMOCG00000006678	Xpo4	99	84.508	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000007828	xpo4	100	94.440	ENSMMOG00000019453	xpo4	99	94.440	Mola_mola
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.589	ENSMODG00000008262	XPO4	99	84.589	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	90.815	ENSMALG00000018033	xpo4	99	90.815	Monopterus_albus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.508	MGP_CAROLIEiJ_G0019352	Xpo4	99	84.508	Mus_caroli
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.595	ENSMUSG00000021952	Xpo4	99	84.595	Mus_musculus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.508	MGP_PahariEiJ_G0030370	Xpo4	99	84.508	Mus_pahari
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.595	MGP_SPRETEiJ_G0020246	Xpo4	99	84.595	Mus_spretus
ENSSMAG00000007828	xpo4	96	90.728	ENSMPUG00000000600	XPO4	99	90.728	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	84.554	ENSMLUG00000012089	-	99	84.554	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.421	ENSNGAG00000014823	Xpo4	99	84.421	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000007828	xpo4	81	88.728	ENSNBRG00000011410	xpo4	94	88.728	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.769	ENSNLEG00000001816	XPO4	99	84.769	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000007828	xpo4	90	83.905	ENSOPRG00000010581	XPO4	90	83.905	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000007828	xpo4	100	95.486	ENSONIG00000015714	xpo4	100	95.486	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.375	ENSOANG00000009030	-	99	84.375	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.238	ENSOCUG00000008490	XPO4	99	84.238	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	93.398	ENSORLG00000013136	xpo4	99	93.398	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	93.678	ENSORLG00020009218	xpo4	100	93.678	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000007828	xpo4	100	93.576	ENSORLG00015012168	xpo4	100	93.576	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	92.982	ENSOMEG00000009492	xpo4	100	93.070	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	83.579	ENSOGAG00000000048	XPO4	99	83.579	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	84.039	ENSOARG00000013784	XPO4	100	84.039	Ovis_aries
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.856	ENSPPAG00000031464	XPO4	99	84.856	Pan_paniscus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.682	ENSPPRG00000017050	XPO4	99	84.682	Panthera_pardus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.682	ENSPANG00000001765	XPO4	99	84.682	Papio_anubis
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	91.043	ENSPKIG00000001940	xpo4	99	91.043	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000007828	xpo4	88	91.667	ENSPSIG00000006908	XPO4	99	90.667	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.769	ENSPEMG00000017255	Xpo4	99	84.769	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.762	ENSPCIG00000000193	XPO4	99	84.762	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	95.403	ENSPFOG00000005062	xpo4	99	95.403	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	91.028	ENSPLAG00000001184	xpo4	99	91.028	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	91.028	ENSPMEG00000016525	xpo4	99	91.028	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	95.234	ENSPREG00000000899	xpo4	99	95.234	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.769	ENSPPYG00000005196	XPO4	99	84.769	Pongo_abelii
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	76.762	ENSPCAG00000004580	XPO4	99	76.762	Procavia_capensis
ENSSMAG00000007828	xpo4	91	80.439	ENSPCOG00000013299	-	97	80.439	Propithecus_coquereli
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	94.502	ENSPNYG00000006605	xpo4	99	94.588	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	92.160	ENSPNAG00000005781	xpo4	99	92.160	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.568	ENSRNOG00000010137	Xpo4	99	84.568	Rattus_norvegicus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.595	ENSRROG00000034581	XPO4	99	84.595	Rhinopithecus_roxellana
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.769	ENSSBOG00000020841	XPO4	99	84.769	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSMAG00000007828	xpo4	91	84.747	ENSSHAG00000006069	XPO4	100	84.747	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	91.022	ENSSFOG00015001025	xpo4	100	91.022	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000007828	xpo4	91	93.206	ENSSDUG00000013955	xpo4	93	93.206	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000007828	xpo4	100	93.826	ENSSLDG00000013233	xpo4	99	93.826	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	84.486	ENSSPUG00000014529	XPO4	99	84.486	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000007828	xpo4	89	92.617	ENSSSCG00000009276	XPO4	100	93.590	Sus_scrofa
ENSSMAG00000007828	xpo4	98	84.173	ENSTGUG00000011343	XPO4	100	84.173	Taeniopygia_guttata
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	91.812	ENSTRUG00000015851	xpo4	99	91.812	Takifugu_rubripes
ENSSMAG00000007828	xpo4	100	92.221	ENSTNIG00000015669	xpo4	100	92.221	Tetraodon_nigroviridis
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	84.261	ENSTTRG00000015597	XPO4	99	84.261	Tursiops_truncatus
ENSSMAG00000007828	xpo4	93	96.711	ENSXCOG00000018340	xpo4	99	85.591	Xiphophorus_couchianus
ENSSMAG00000007828	xpo4	99	93.937	ENSXMAG00000014884	xpo4	99	94.022	Xiphophorus_maculatus