EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000009867 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11017 bases
Position: chr17:14752572-14763588
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000016092	SYF2	PF08231.12	3.3e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000016290	-	4858	-	ENSSMAP00000016092	238 (aa)	-	A0A2U9CLZ3

Gene Model

Click here to download ENSSMAG00000009867's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSMAG00000009867's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.944	ENSG00000117614	SYF2	90	81.651	Homo_sapiens
ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.916	ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.916	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000009867	syf2	82	82.564	ENSAMEG00000010134	-	100	82.564	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000009867	syf2	92	82.569	ENSAMEG00000010115	-	90	82.569	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000009867	syf2	99	88.085	ENSACIG00000023688	syf2	94	88.085	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000009867	syf2	93	89.140	ENSAOCG00000010912	syf2	69	89.140	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.916	ENSAOCG00000022046	syf2	98	90.043	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.916	ENSAPEG00000018858	syf2	92	89.916	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.496	ENSATEG00000007745	syf2	100	89.496	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000009867	syf2	84	81.910	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.910	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000009867	syf2	70	68.862	ENSACAG00000026777	-	100	68.862	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000009867	syf2	86	81.863	ENSACAG00000013653	-	100	81.863	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.407	ENSANAG00000032473	SYF2	90	82.110	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000009867	syf2	100	88.235	ENSACLG00000019916	syf2	100	88.235	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000009867	syf2	100	80.672	ENSAMXG00000004051	syf2	100	80.672	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.273	ENSBTAG00000001651	SYF2	99	77.273	Bos_taurus
ENSSMAG00000009867	syf2	87	53.810	WBGene00019402	syf-2	100	50.000	Caenorhabditis_elegans
ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.407	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	82.110	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.870	ENSCAFG00000012895	-	89	82.569	Canis_familiaris
ENSSMAG00000009867	syf2	91	76.852	ENSCAFG00000030331	-	95	75.225	Canis_familiaris
ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.870	ENSCAFG00020021091	-	89	82.569	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000009867	syf2	78	72.193	ENSCAFG00020021094	-	97	72.193	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.955	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	76.955	Capra_hircus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	74.486	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	74.486	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000009867	syf2	83	80.808	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.808	Cavia_aperea
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.230	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	76.230	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.407	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	82.110	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.119	ENSCATG00000026917	SYF2	95	77.119	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000009867	syf2	98	79.399	ENSCLAG00000008474	SYF2	93	79.399	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.119	ENSCSAG00000000948	SYF2	95	77.119	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000009867	syf2	74	61.326	ENSCHOG00000005273	-	100	61.326	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000009867	syf2	93	81.982	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	79.325	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000009867	syf2	95	51.982	ENSCING00000003017	-	95	52.423	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000009867	syf2	89	50.235	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.235	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000009867	syf2	99	68.220	ENSCANG00000037322	SYF2	94	68.220	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.033	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	76.033	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000009867	syf2	82	81.122	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.313	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000009867	syf2	92	86.697	ENSCSEG00000000117	syf2	99	82.700	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000009867	syf2	100	87.029	ENSCVAG00000019543	syf2	100	87.448	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	81.933	ENSDARG00000004706	syf2	100	81.933	Danio_rerio
ENSSMAG00000009867	syf2	100	75.918	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	75.918	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	75.820	ENSDORG00000001274	Syf2	100	75.820	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000009867	syf2	92	55.000	FBgn0033556	CG12343	97	55.000	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000009867	syf2	86	68.137	ENSETEG00000015729	SYF2	100	64.192	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000009867	syf2	83	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000009867	syf2	100	68.182	ENSEASG00005004232	-	100	68.182	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000009867	syf2	92	82.569	ENSEASG00005004224	-	89	82.569	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000009867	syf2	95	80.000	ENSECAG00000012023	-	94	80.000	Equus_caballus
ENSSMAG00000009867	syf2	92	82.569	ENSECAG00000010440	-	91	82.569	Equus_caballus
ENSSMAG00000009867	syf2	74	66.480	ENSEEUG00000015084	SYF2	98	66.480	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	82.353	ENSELUG00000003465	syf2	99	82.353	Esox_lucius
ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.637	ENSFCAG00000010324	-	81	77.637	Felis_catus
ENSSMAG00000009867	syf2	92	82.110	ENSFCAG00000043095	-	89	82.110	Felis_catus
ENSSMAG00000009867	syf2	86	78.922	ENSFALG00000000460	SYF2	89	78.440	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.543	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	76.543	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000009867	syf2	95	75.221	ENSFHEG00000007238	syf2	100	75.221	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000009867	syf2	90	87.442	ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.442	Gadus_morhua
ENSSMAG00000009867	syf2	93	80.631	ENSGALG00000013639	SYF2	96	74.793	Gallus_gallus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	85.714	ENSGAFG00000019435	syf2	100	85.714	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000009867	syf2	94	87.054	ENSGACG00000007305	syf2	100	86.192	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000009867	syf2	93	82.432	ENSGAGG00000010670	SYF2	95	79.574	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.944	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	81.651	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000009867	syf2	100	87.815	ENSHBUG00000020477	syf2	100	87.815	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000009867	syf2	93	81.081	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.081	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000009867	syf2	93	70.721	ENSHGLG00000004304	-	100	67.227	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000009867	syf2	93	81.081	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.081	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000009867	syf2	100	86.555	ENSHCOG00000012904	syf2	78	86.555	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000009867	syf2	100	80.335	ENSIPUG00000019859	syf2	100	80.335	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000009867	syf2	61	75.342	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	75.342	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000009867	syf2	84	81.910	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.910	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.076	ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.076	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.916	ENSLBEG00000014425	syf2	100	89.916	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000009867	syf2	93	80.090	ENSLACG00000012064	SYF2	93	80.090	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000009867	syf2	100	81.933	ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.933	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.327	ENSLAFG00000023150	-	100	76.327	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000009867	syf2	77	55.676	ENSLAFG00000030814	-	100	55.676	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.119	ENSMFAG00000041831	SYF2	95	77.119	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.019	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.734	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.119	ENSMNEG00000030180	SYF2	95	77.119	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.119	ENSMLEG00000030248	SYF2	95	77.119	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	91.597	ENSMAMG00000010403	syf2	98	91.597	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	88.235	ENSMZEG00005006429	syf2	100	88.235	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000009867	syf2	84	81.407	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.407	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.860	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	76.860	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000009867	syf2	84	81.910	ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.910	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.446	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	76.446	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000009867	syf2	95	89.381	ENSMMOG00000002396	syf2	95	89.381	Mola_mola
ENSSMAG00000009867	syf2	93	77.679	ENSMODG00000013951	-	98	77.679	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000009867	syf2	100	88.382	ENSMALG00000010706	syf2	100	88.797	Monopterus_albus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.860	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	76.860	Mus_caroli
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.860	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	76.860	Mus_musculus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.860	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	76.860	Mus_pahari
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.860	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	76.860	Mus_spretus
ENSSMAG00000009867	syf2	92	82.569	ENSMPUG00000015801	-	89	82.569	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.870	ENSMPUG00000015802	-	89	82.569	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000009867	syf2	99	75.833	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	75.833	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.215	ENSNGAG00000007912	Syf2	96	77.215	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000009867	syf2	100	77.686	ENSNBRG00000010720	syf2	99	77.686	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.944	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	81.651	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000009867	syf2	100	74.486	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	74.486	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000009867	syf2	93	79.730	ENSODEG00000017664	-	93	79.730	Octodon_degus
ENSSMAG00000009867	syf2	98	69.099	ENSODEG00000014338	-	99	67.635	Octodon_degus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.076	ENSONIG00000008213	syf2	100	89.076	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000009867	syf2	85	82.178	ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.178	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.944	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	77.966	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000009867	syf2	98	87.554	ENSORLG00000028820	syf2	100	87.554	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000009867	syf2	100	85.714	ENSORLG00020018333	syf2	100	85.714	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000009867	syf2	100	85.294	ENSORLG00015014665	syf2	100	85.294	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000009867	syf2	100	86.975	ENSOMEG00000013911	syf2	100	86.975	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.637	ENSOGAG00000009962	SYF2	95	77.637	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000009867	syf2	82	57.436	ENSOARG00000006269	-	100	57.436	Ovis_aries
ENSSMAG00000009867	syf2	99	76.230	ENSOARG00000006348	-	99	76.230	Ovis_aries
ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.944	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	81.651	Pan_paniscus
ENSSMAG00000009867	syf2	92	82.569	ENSPPRG00000001638	-	96	77.215	Panthera_pardus
ENSSMAG00000009867	syf2	92	82.110	ENSPPRG00000001651	-	89	82.110	Panthera_pardus
ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.870	ENSPTIG00000005711	-	83	78.205	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000009867	syf2	97	80.000	ENSPTIG00000007036	-	91	80.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.944	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	81.651	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.119	ENSPANG00000008139	SYF2	95	77.119	Papio_anubis
ENSSMAG00000009867	syf2	100	80.672	ENSPKIG00000008130	syf2	100	80.672	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000009867	syf2	97	78.448	ENSPSIG00000011816	SYF2	90	78.448	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000009867	syf2	98	85.837	ENSPMGG00000008755	syf2	91	85.837	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.033	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	76.033	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000009867	syf2	93	81.532	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	75.600	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	84.519	ENSPFOG00000004116	syf2	99	84.519	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000009867	syf2	98	86.266	ENSPLAG00000006691	syf2	100	86.266	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000009867	syf2	100	83.193	ENSPMEG00000011684	syf2	100	83.193	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000009867	syf2	100	86.134	ENSPREG00000003009	syf2	100	86.134	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000009867	syf2	92	81.651	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.651	Pongo_abelii
ENSSMAG00000009867	syf2	99	53.814	ENSPCOG00000027011	SYF2	93	53.814	Propithecus_coquereli
ENSSMAG00000009867	syf2	93	71.171	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	71.171	Pteropus_vampyrus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	87.815	ENSPNYG00000004979	syf2	100	87.815	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000009867	syf2	100	80.672	ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.672	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.860	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	76.860	Rattus_norvegicus
ENSSMAG00000009867	syf2	99	75.424	ENSRBIG00000042970	SYF2	95	75.424	Rhinopithecus_bieti
ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.119	ENSRROG00000001347	SYF2	95	77.119	Rhinopithecus_roxellana
ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.944	ENSSBOG00000020184	SYF2	96	77.311	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSMAG00000009867	syf2	93	80.180	ENSSHAG00000015630	-	89	80.180	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000009867	syf2	86	81.553	ENSSHAG00000007152	-	100	81.553	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000009867	syf2	100	81.513	ENSSFOG00015023647	syf2	100	81.513	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.916	ENSSDUG00000013072	syf2	100	89.916	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.916	ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.916	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000009867	syf2	99	58.506	ENSSARG00000012889	SYF2	99	58.506	Sorex_araneus
ENSSMAG00000009867	syf2	99	76.860	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	76.860	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000009867	syf2	100	91.597	ENSSPAG00000009626	syf2	100	91.597	Stegastes_partitus
ENSSMAG00000009867	syf2	92	82.569	ENSSSCG00000037481	SYF2	89	82.569	Sus_scrofa
ENSSMAG00000009867	syf2	63	51.656	ENSTGUG00000001126	SYF2	79	54.375	Taeniopygia_guttata
ENSSMAG00000009867	syf2	100	85.833	ENSTRUG00000001499	syf2	95	85.232	Takifugu_rubripes
ENSSMAG00000009867	syf2	93	86.878	ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.878	Tetraodon_nigroviridis
ENSSMAG00000009867	syf2	100	56.790	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	56.790	Tupaia_belangeri
ENSSMAG00000009867	syf2	99	76.763	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	77.178	Tursiops_truncatus
ENSSMAG00000009867	syf2	92	82.569	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	82.569	Ursus_americanus
ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.407	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	82.110	Ursus_maritimus
ENSSMAG00000009867	syf2	99	76.763	ENSVPAG00000005705	SYF2	99	76.763	Vicugna_pacos
ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.870	ENSVVUG00000027175	-	89	82.569	Vulpes_vulpes
ENSSMAG00000009867	syf2	86	81.951	ENSVVUG00000027181	-	94	77.215	Vulpes_vulpes
ENSSMAG00000009867	syf2	99	75.949	ENSXETG00000022797	syf2	94	75.949	Xenopus_tropicalis
ENSSMAG00000009867	syf2	100	86.134	ENSXMAG00000022698	syf2	100	86.134	Xiphophorus_maculatus