EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000011202 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20030 bases
Position: chr4:24773314-24793343
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000018359	IBN_N	PF03810.19	7.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000018585	-	2643	-	ENSSMAP00000018359	880 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	86.581	ENSSMAG00000004050	-	96	86.581
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	86.581	ENSSMAG00000012008	tnpo2	98	85.029

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	98.248	ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	98.248	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	92.477	ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	92.593	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000011202	tnpo1	84	96.757	ENSACIG00000003711	tnpo1	95	96.757	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	98.364	ENSAOCG00000008154	tnpo1	96	98.364	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	98.364	ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	98.364	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	98.131	ENSATEG00000010408	tnpo1	96	98.131	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	99	89.784	ENSAPLG00000009619	-	98	89.671	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.575	ENSACAG00000009599	TNPO1	96	93.575	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000011202	tnpo1	98	58.763	ENSANAG00000027118	-	97	61.283	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000011202	tnpo1	98	85.215	ENSANAG00000025351	-	96	85.215	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	92.991	ENSANAG00000022453	-	95	92.991	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	95.327	ENSACLG00000027223	tnpo1	96	95.327	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	94.755	ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	94.522	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.575	ENSBTAG00000007979	TNPO1	95	93.575	Bos_taurus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.107	ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	93.107	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.232	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.232	Canis_familiaris
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	91.005	ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	91.005	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	93.458	Capra_hircus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	98	91.531	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.047	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	92.991	ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	92.991	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSCATG00000043792	TNPO1	96	93.458	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.224	ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	93.224	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSCSAG00000015616	TNPO1	95	93.458	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	91	81.366	ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	81.366	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.925	ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	93.925	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	76.190	ENSCSAVG00000010981	-	96	75.842	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSCANG00000004353	TNPO1	95	93.458	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.341	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	93.341	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.333	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.333	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.379	ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	96.379	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.963	ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	96.963	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	94.516	ENSDARG00000035390	tnpo1	96	93.816	Danio_rerio
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	87.660	ENSDNOG00000006647	TNPO1	96	87.660	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	94	93.494	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.486	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000011202	tnpo1	95	60.432	FBgn0035693	CG8219	96	60.072	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000011202	tnpo1	83	94.757	ENSETEG00000017805	TNPO1	85	94.757	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000011202	tnpo1	95	85.476	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.476	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSEASG00005018055	TNPO1	96	93.458	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.341	ENSECAG00000024424	TNPO1	95	93.341	Equus_caballus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	88.348	ENSELUG00000002821	tnpo1	96	87.725	Esox_lucius
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSFCAG00000013181	TNPO1	96	93.458	Felis_catus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.808	ENSFALG00000010292	TNPO1	96	93.808	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.107	ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	93.107	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.966	ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	96.966	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	92.899	ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	92.899	Gadus_morhua
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	92.991	ENSGALG00000015014	TNPO1	96	92.991	Gallus_gallus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.737	ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	96.737	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	97.430	ENSGACG00000015841	tnpo1	96	97.430	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	94.042	ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	94.042	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	77.946	ENSGGOG00000022535	-	97	76.739	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSGGOG00000026800	TNPO1	96	93.458	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	97.196	ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	97.196	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.224	ENSHGLG00000000970	-	95	93.224	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.107	ENSHGLG00100017090	-	99	93.107	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	73.481	ENSHGLG00100000963	-	98	72.780	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.575	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	93.575	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.963	ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	96.963	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	88	94.337	ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	94.337	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	86.860	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.860	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	94.743	ENSLOCG00000011092	tnpo1	93	94.743	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.216	ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	93.216	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSMFAG00000003636	TNPO1	95	93.458	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.341	ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	93.341	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSMNEG00000044581	TNPO1	95	93.458	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSMLEG00000030740	TNPO1	95	93.458	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	98.014	ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	98.014	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.729	ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	96.729	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.341	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	93.341	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	89.486	ENSMICG00000008468	TNPO1	96	89.486	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.341	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	93.341	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000011202	tnpo1	84	96.900	ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	96.900	Mola_mola
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.830	ENSMODG00000001721	TNPO1	77	93.830	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.612	ENSMALG00000009782	tnpo1	96	96.612	Monopterus_albus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.341	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	96	93.661	Mus_caroli
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.341	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	96	93.661	Mus_musculus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	93.790	Mus_pahari
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.341	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	96	93.661	Mus_spretus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSMPUG00000014387	TNPO1	95	93.458	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.132	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.132	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	93.458	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000011202	tnpo1	84	96.892	ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	96.892	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSNLEG00000004572	TNPO1	96	93.458	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000011202	tnpo1	91	88.139	ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	88.017	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	92.991	ENSODEG00000001771	TNPO1	95	92.991	Octodon_degus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.404	ENSONIG00000011151	tnpo1	95	96.404	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	93	94.146	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.146	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	87.266	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.266	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	84	96.622	ENSORLG00000003182	tnpo1	95	96.622	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.612	ENSORLG00020011559	tnpo1	96	96.612	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.963	ENSORLG00015019113	tnpo1	96	96.963	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.612	ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	96.612	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSOGAG00000000808	TNPO1	95	93.458	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.575	ENSOARG00000005038	TNPO1	80	93.575	Ovis_aries
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSPPAG00000042518	TNPO1	95	93.458	Pan_paniscus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSPPRG00000022336	TNPO1	96	93.458	Panthera_pardus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSPTIG00000018839	TNPO1	96	93.458	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSPTRG00000016972	TNPO1	95	93.458	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000011202	tnpo1	91	82.174	ENSPTRG00000047731	-	99	80.563	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSPANG00000006074	TNPO1	95	93.458	Papio_anubis
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	91.355	ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	91.355	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	94.042	ENSPSIG00000014366	TNPO1	96	94.042	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	94.166	ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	93.932	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.333	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.333	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	94.159	ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	94.159	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.973	ENSPFOG00000011447	tnpo1	96	96.973	Poecilia_formosa
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ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.458	ENSPCOG00000004254	TNPO1	95	93.458	Propithecus_coquereli
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