EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000011905 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-98f17.5
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13704 bases
Position: chr9:11931122-11944825
Accession: ZDB-GENE-060526-354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000019434	MMR_HSR1	PF01926.23	1.3e-07	1	1
ENSSMAP00000019450	MMR_HSR1	PF01926.23	1.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000019692	-	3901	-	ENSSMAP00000019450	448 (aa)	-	A0A2U9BTZ5
ENSSMAT00000019675	-	1332	-	ENSSMAP00000019434	443 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSMAG00000011905's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSMAG00000011905's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSSMAG00000009651	si:ch211-11k18.4	99	58.667

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	58.537	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.537	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	58.072	ENSACAG00000028632	-	98	58.482	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.202	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.202	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	79.821	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	99	79.821	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	81	61.003	ENSCING00000020807	-	95	61.003	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	98	55.455	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.455	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	88.208	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	57.556	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	87.723	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	87.723	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	98	82.639	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	82.380	Danio_rerio
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.980	Danio_rerio
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	79	57.746	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	57.746	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	80.493	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	80.493	Esox_lucius
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	88.839	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	88.839	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	58.758	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	58.758	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	90	55.112	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.112	Gadus_morhua
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	88.616	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	86	63.089	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.097	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	58	93.798	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	93.798	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.424	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	58.876	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.876	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	85.135	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.135	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	77.130	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.130	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	90	56.030	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	88	56.030	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	98	59.677	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.815	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	62.306	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	99	62.528	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	67.793	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	67.793	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	61.470	ENSLACG00000004899	-	99	61.470	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	98	60.369	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.369	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	58.980	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	58.980	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	57.333	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.333	Mola_mola
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Monopterus_albus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	98	87.699	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.699	Monopterus_albus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	98	59.447	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	99	59.447	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.202	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.202	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	84.152	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	84.152	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	87.054	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	87.054	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	60.449	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	98	60.449	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	87.723	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	87.723	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	59.775	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.775	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	76.629	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	99	76.629	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	57.366	ENSPKIG00000023918	-	98	57.906	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	83.929	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	83.929	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	87.583	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	87.583	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	87.946	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	87.946	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	100	62.069	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	88.170	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	88.170	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	98	58.542	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	98	58.542	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	98	86.333	ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	86.333	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSPNYG00000017266	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.424	ENSPNYG00000017099	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSPNAG00000022138	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	79.821	ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	99	79.821	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.868	ENSSFOG00015000985	si:ch211-11k18.4	94	59.868	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	74.831	ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	99	74.831	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSSDUG00000016411	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSSLDG00000019145	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	88	60.101	ENSSPUG00000010096	-	99	60.705	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSSPAG00000010697	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Stegastes_partitus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Stegastes_partitus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSTRUG00000020291	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Takifugu_rubripes
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	87.723	ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	87.723	Takifugu_rubripes
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	57.395	ENSXETG00000031783	-	99	57.395	Xenopus_tropicalis
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	87.723	ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	100	87.723	Xiphophorus_couchianus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.424	ENSXCOG00000018094	si:ch211-11k18.4	99	59.341	Xiphophorus_couchianus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	87.946	ENSXMAG00000007688	si:dkey-98f17.5	95	87.946	Xiphophorus_maculatus
ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSXMAG00000021235	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Xiphophorus_maculatus