EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000012008 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo2
Alias: fb01c02|fe01f03|ik:tdsubc_2a7|tdsubc_2a7|wu:fb01c02|wu:fe01f03|wu:fe16e12|xx:tdsubc_2a7|zgc:101009
Full Name: transportin 2 (importin 3%2C karyopherin beta 2b)
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15848 bases
Position: chr19:9598275-9614122
Accession: ZDB-GENE-040822-16
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000019683	IBN_N	PF03810.19	1.6e-16	1	1
ENSSMAP00000019644	IBN_N	PF03810.19	1.7e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000019927	-	5607	-	ENSSMAP00000019683	889 (aa)	-	A0A2U9CT06
ENSSMAT00000019886	-	6974	-	ENSSMAP00000019644	901 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.501	ENSSMAG00000004050	-	100	95.501
ENSSMAG00000012008	tnpo2	98	85.029	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	86.581

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSG00000105576	TNPO2	100	93.138	Homo_sapiens
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.726	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	95.726	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	82	97.103	ENSAPOG00000013185	-	96	97.103	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	90.545	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	90.545	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000012008	tnpo2	87	95.855	ENSACIG00000009586	-	100	95.855	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	87	98.573	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	98.573	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	99.213	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	99.213	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.726	ENSAOCG00000010152	-	100	95.726	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	99.213	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	99.213	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.726	ENSAPEG00000013268	-	100	95.726	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	98.650	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	98.650	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.726	ENSATEG00000019171	-	100	95.726	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.363	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	93.588	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.026	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	93.026	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	98.650	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	98.650	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	89.539	ENSACLG00000020672	-	100	89.539	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.676	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	95.676	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.026	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	93.026	Bos_taurus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	92.102	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	92.102	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	92.913	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	93.251	Canis_familiaris
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.251	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.251	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	88.432	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	87.987	Capra_hircus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	93.138	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000012008	tnpo2	93	90.844	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	90.844	Cavia_aperea
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	93.138	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	93.138	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	92.102	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	92.102	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	93.138	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	93.138	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.363	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	93.701	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000012008	tnpo2	96	93.349	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	93.349	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	92.214	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	92.214	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.251	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	93.251	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000012008	tnpo2	87	93.798	ENSCSEG00000011477	-	100	93.798	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	94.151	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	94.151	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	96.180	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	96.180	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.726	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	95.726	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	92.801	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	92.801	Danio_rerio
ENSSMAG00000012008	tnpo2	88	83.801	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	84.184	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	86.570	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	91.971	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	72.483	FBgn0024921	Tnpo	100	72.371	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000012008	tnpo2	91	84.171	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	84.171	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	93.138	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	93.138	Equus_caballus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	96.670	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	96.670	Esox_lucius
ENSSMAG00000012008	tnpo2	79	93.353	ENSELUG00000016542	-	99	84.833	Esox_lucius
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	92.102	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	92.102	Felis_catus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	93.138	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000012008	tnpo2	97	95.349	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	95.349	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	96.629	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	96.629	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	81	93.519	ENSGMOG00000014237	-	90	94.127	Gadus_morhua
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	88.255	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	88.255	Gadus_morhua
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	97.303	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	97.303	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.501	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	95.501	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.363	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	93.701	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.726	ENSHBUG00000018317	-	100	95.726	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	98.650	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	98.650	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.026	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	93.026	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	91.435	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	91.435	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.613	ENSHCOG00000020440	-	100	95.613	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	96.625	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	96.625	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.051	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	95.051	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	96.063	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	96.063	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.251	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	93.251	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	92.102	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	92.102	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	94.038	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	94.038	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.613	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	95.613	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.951	ENSLBEG00000005301	-	100	95.951	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	99.213	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	99.213	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	90.776	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	90.776	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	96.738	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.738	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	92.214	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	92.214	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	92.102	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	92.102	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	93.138	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	93.138	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000012008	tnpo2	96	92.290	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	92.272	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	97.780	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	97.780	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.726	ENSMAMG00000011862	-	100	95.726	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.726	ENSMZEG00005007408	-	100	95.726	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	94.494	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	94.494	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	98.650	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	98.650	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	93.138	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.251	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	93.251	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000012008	tnpo2	88	95.262	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	95.990	Mola_mola
ENSSMAG00000012008	tnpo2	87	93.152	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	93.152	Mola_mola
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.326	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	93.326	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.613	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	95.613	Monopterus_albus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	97.300	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	97.300	Monopterus_albus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.251	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	93.251	Mus_caroli
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.251	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	93.251	Mus_musculus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.251	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	93.251	Mus_pahari
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.251	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	93.251	Mus_spretus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.251	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	93.251	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000012008	tnpo2	96	93.349	ENSMLUG00000012669	TNPO2	100	93.349	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.251	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	93.251	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.363	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	93.363	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	95.726	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	95.726	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	83.111	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	83.111	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	87.542	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	87.542	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.138	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	93.138	Octodon_degus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	94.766	ENSONIG00000017706	-	100	94.766	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	98.650	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	98.650	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	93.363	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	93.363	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	91	93.023	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	93.023	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000012008	tnpo2	56	96.000	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	96.000	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	98.200	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	98.200	Oryzias_latipes
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