EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000013202 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srprb
Alias: wu:fk57h10|zgc:111820|zgc:92746
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6668 bases
Position: chr3:11962829-11969496
Accession: ZDB-GENE-040718-311
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000021535	MMR_HSR1	PF01926.23	2e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000021789	-	4843	-	ENSSMAP00000021535	275 (aa)	-	A0A2U9B4W2

Gene Model

Click here to download ENSSMAG00000013202's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSMAG00000013202's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000013202	srprb	63	31.034	ENSSMAG00000002927	-	90	31.034
ENSSMAG00000013202	srprb	52	30.405	ENSSMAG00000008394	arl4d	72	30.405
ENSSMAG00000013202	srprb	63	31.034	ENSSMAG00000001861	arf3b	90	31.034
ENSSMAG00000013202	srprb	65	30.000	ENSSMAG00000004541	-	92	30.337
ENSSMAG00000013202	srprb	58	31.875	ENSSMAG00000010770	arf2b	83	31.875

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000013202	srprb	100	88.809	ENSAPOG00000021219	srprb	100	88.809	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000013202	srprb	97	88.722	ENSACIG00000014621	srprb	100	88.722	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000013202	srprb	100	88.809	ENSAOCG00000017265	srprb	100	88.809	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000013202	srprb	100	88.809	ENSAPEG00000024541	srprb	88	88.809	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000013202	srprb	100	86.545	ENSATEG00000014016	srprb	100	86.545	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000013202	srprb	100	87.681	ENSACLG00000016748	srprb	100	87.681	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000013202	srprb	97	68.797	ENSAMXG00000044118	srprb	100	68.797	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000013202	srprb	100	85.091	ENSCSEG00000017194	srprb	100	85.091	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000013202	srprb	97	85.338	ENSCVAG00000004221	srprb	100	85.338	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000013202	srprb	97	66.541	ENSDARG00000030949	srprb	100	66.541	Danio_rerio
ENSSMAG00000013202	srprb	96	79.468	ENSELUG00000009740	srprb	97	79.468	Esox_lucius
ENSSMAG00000013202	srprb	97	86.090	ENSFHEG00000006004	srprb	100	86.090	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000013202	srprb	99	80.443	ENSGMOG00000002081	srprb	100	80.443	Gadus_morhua
ENSSMAG00000013202	srprb	96	85.171	ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.171	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000013202	srprb	99	87.823	ENSGACG00000009891	srprb	100	87.823	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000013202	srprb	100	87.681	ENSHBUG00000002145	srprb	100	87.681	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000013202	srprb	92	84.980	ENSHCOG00000007732	srprb	95	84.980	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000013202	srprb	97	64.794	ENSIPUG00000004177	srprb	100	64.794	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000013202	srprb	97	85.338	ENSKMAG00000020736	srprb	100	85.338	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000013202	srprb	100	88.000	ENSLBEG00000021483	srprb	100	88.000	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000013202	srprb	95	68.966	ENSLOCG00000009740	srprb	87	69.615	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000013202	srprb	100	90.182	ENSMAMG00000011876	srprb	100	90.182	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000013202	srprb	94	87.645	ENSMZEG00005016621	srprb	100	87.645	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000013202	srprb	97	85.075	ENSMMOG00000012550	srprb	99	85.075	Mola_mola
ENSSMAG00000013202	srprb	100	87.273	ENSMALG00000012595	srprb	100	87.273	Monopterus_albus
ENSSMAG00000013202	srprb	75	89.806	ENSNBRG00000004699	srprb	88	89.806	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000013202	srprb	100	88.000	ENSONIG00000003788	srprb	82	88.000	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000013202	srprb	99	80.443	ENSORLG00000006430	srprb	99	80.443	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000013202	srprb	100	80.000	ENSORLG00020003413	srprb	100	80.000	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000013202	srprb	100	80.000	ENSORLG00015000166	srprb	100	80.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000013202	srprb	100	81.091	ENSOMEG00000012735	srprb	100	81.091	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000013202	srprb	91	70.916	ENSPKIG00000013147	srprb	95	70.916	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000013202	srprb	100	80.727	ENSPMGG00000014061	srprb	100	80.727	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000013202	srprb	96	85.551	ENSPFOG00000011347	srprb	95	85.551	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000013202	srprb	94	86.434	ENSPLAG00000001156	srprb	100	86.434	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000013202	srprb	94	85.659	ENSPMEG00000012169	srprb	100	85.659	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000013202	srprb	94	85.271	ENSPREG00000001449	srprb	100	85.271	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000013202	srprb	100	87.681	ENSPNYG00000005911	srprb	100	87.681	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000013202	srprb	97	69.173	ENSPNAG00000009983	srprb	100	69.173	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000013202	srprb	92	72.047	ENSSFOG00015019355	srprb	95	72.047	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000013202	srprb	100	90.909	ENSSDUG00000018746	srprb	94	90.909	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000013202	srprb	100	90.545	ENSSLDG00000020560	srprb	100	90.545	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000013202	srprb	100	88.809	ENSSPAG00000008898	srprb	100	88.809	Stegastes_partitus
ENSSMAG00000013202	srprb	100	84.364	ENSTRUG00000022463	srprb	100	84.364	Takifugu_rubripes
ENSSMAG00000013202	srprb	95	82.759	ENSTNIG00000007725	srprb	99	82.759	Tetraodon_nigroviridis
ENSSMAG00000013202	srprb	94	86.047	ENSXCOG00000012585	srprb	100	86.047	Xiphophorus_couchianus
ENSSMAG00000013202	srprb	94	85.659	ENSXMAG00000028725	srprb	100	85.659	Xiphophorus_maculatus