EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000013707 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 43497 bases
Position: chr9:22531951-22575447
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000022701	BRK	PF07533.16	1.9e-17	1	1
ENSSMAP00000022663	BRK	PF07533.16	1.9e-17	1	1
ENSSMAP00000022555	BRK	PF07533.16	2e-17	1	1
ENSSMAP00000022617	BRK	PF07533.16	2e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000022925	SMARCA2-203	6789	-	ENSSMAP00000022663	1570 (aa)	-	-
ENSSMAT00000022817	SMARCA2-201	6891	-	ENSSMAP00000022555	1604 (aa)	-	-
ENSSMAT00000022963	SMARCA2-204	4638	-	ENSSMAP00000022701	1545 (aa)	-	-
ENSSMAT00000022879	SMARCA2-202	6891	-	ENSSMAP00000022617	1604 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	95	67.127	ENSSMAG00000014082	-	99	67.412
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	93	72.793	ENSSMAG00000003200	smarca4a	99	70.346

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	79.682	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	92.456	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	91.958	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	80	84.280	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	84.514	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	89.886	ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	89.570	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	92.269	ENSAOCG00000009647	-	100	91.771	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	92.145	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	100	91.771	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	92.035	ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	91.214	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	89	77.693	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.786	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.000	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.306	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.722	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	80.704	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	91.146	ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	91.019	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	84.490	ENSAMXG00000012404	smarca2	99	84.125	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	81.209	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	81.179	Bos_taurus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.804	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	80.815	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	81.209	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	81.115	Canis_familiaris
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	74	86.533	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	85.752	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	81.274	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	81.242	Capra_hircus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	78.139	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.315	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	78.896	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	79.215	Cavia_aperea
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.727	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	80.653	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.799	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	80.779	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	79.284	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	80.327	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	79.379	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.401	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	91	81.755	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	81.237	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	85	80.432	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	80.178	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	84.361	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	99	84.211	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.762	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	80.680	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	75.258	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	75.078	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	87.928	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	99	87.356	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	84	88.200	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	88.297	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	83.911	ENSDARG00000008904	smarca2	100	83.106	Danio_rerio
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	79.543	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	79.800	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.167	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	80.489	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	77	62.052	FBgn0000212	brm	83	56.133	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	85	61.943	ENSEBUG00000002449	-	94	63.232	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	94	70.620	ENSEBUG00000011442	-	97	69.697	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.949	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	80.925	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	61	88.235	ENSEEUG00000015540	-	69	72.963	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	95	84.150	ENSELUG00000010318	smarca2	99	80.823	Esox_lucius
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	81.014	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	80.925	Felis_catus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	79.975	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.271	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	79.001	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	78.181	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	90.491	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	90.242	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	85.080	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	84.472	Gadus_morhua
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	79.665	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	79.762	Gallus_gallus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	95	83.502	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	92	94.444	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	88.442	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	87.312	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	80.420	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	80.427	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	91	85.552	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	84.041	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	90.835	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	90.711	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	79.575	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	79.810	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.637	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	80.811	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	89	82.634	ENSHCOG00000015348	-	95	88.454	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	82.979	ENSIPUG00000011060	smarca2	100	81.358	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.398	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	80.326	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.103	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	80.289	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	91.242	ENSKMAG00000015844	-	100	90.621	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	81.773	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	81.582	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	79.071	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.454	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	78.038	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	80.405	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.645	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	80.629	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.052	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	80.377	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	79.584	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	79.975	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	91.822	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.326	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	90.960	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	100	90.835	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	75	67.282	ENSMGAG00000005160	-	99	61.028	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	81.088	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	81.250	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.747	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	80.477	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	86.987	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	100	86.735	Mola_mola
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	78.891	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	79.901	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	92.308	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	91.661	Monopterus_albus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	78.904	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	79.084	Mus_caroli
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	96	80.311	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	96	80.519	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	79.452	Mus_pahari
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	96	80.194	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	99	90.909	Mus_spretus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	81	84.627	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	84.394	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	75.937	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	75.890	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	79.692	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	79.672	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	95	77.160	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	92	93.333	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	78.689	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.721	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	72.103	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	73.622	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	75.047	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.062	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	79.344	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	79.520	Octodon_degus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	90.452	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	90.075	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	80.115	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	79.812	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	90.779	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	90.343	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	90.654	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	90.218	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	89.873	ENSOMEG00000009736	-	100	89.554	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	77.036	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.096	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	79.228	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	80.341	Ovis_aries
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	95	85.578	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	100	84.766	Pan_paniscus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	81.079	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	80.989	Panthera_pardus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	79.517	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	80.062	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	76.888	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	76.463	Papio_anubis
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	83.789	ENSPKIG00000018469	-	100	83.280	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	80.127	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	79.887	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	84.536	ENSPMGG00000013696	-	98	84.343	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	97	79.884	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.511	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	95	70.741	ENSPMAG00000005337	-	97	69.710	Petromyzon_marinus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	79.745	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	80.989	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	89.745	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	89.124	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	89.755	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	96	89.126	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000013707	SMARCA2	99	89.937	ENSPMEG00000001815	-	99	89.213	Poecilia_mexicana
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