EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000013854 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp30
Alias: fk66h08|rpp1|wu:fk66h08|zgc:110189
Full Name: ribonuclease P/MRP 30 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3665 bases
Position: chr18:21337821-21341485
Accession: ZDB-GENE-050320-45
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000022689	RNase_P_p30	PF01876.16	1.2e-65	1	1
ENSSMAP00000022705	RNase_P_p30	PF01876.16	9e-56	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000022968	-	1043	-	ENSSMAP00000022705	262 (aa)	-	-
ENSSMAT00000022951	-	1073	-	ENSSMAP00000022689	272 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	56.296	ENSG00000148688	RPP30	99	56.808	Homo_sapiens
ENSSMAG00000013854	rpp30	92	77.821	ENSAPOG00000023156	rpp30	95	73.810	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	58.647	ENSAMEG00000016776	RPP30	99	58.647	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000013854	rpp30	85	83.478	ENSACIG00000022810	rpp30	99	69.030	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	79.775	ENSAOCG00000016438	rpp30	89	79.775	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	79.775	ENSAPEG00000008697	rpp30	89	79.775	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000013854	rpp30	97	82.900	ENSATEG00000015263	rpp30	98	82.900	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000013854	rpp30	86	54.357	ENSAPLG00000009959	RPP30	100	54.357	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000013854	rpp30	99	53.480	ENSACAG00000007996	RPP30	100	53.480	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000013854	rpp30	90	51.681	ENSANAG00000009439	RPP30	77	51.681	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	80.970	ENSACLG00000015389	-	99	80.970	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	61.798	ENSAMXG00000040653	rpp30	97	61.798	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	57.519	ENSBTAG00000002973	RPP30	99	57.519	Bos_taurus
ENSSMAG00000013854	rpp30	90	59.677	ENSCJAG00000011045	RPP30	92	59.677	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	57.895	ENSCAFG00000031801	RPP30	99	57.895	Canis_familiaris
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	57.895	ENSCAFG00020000258	RPP30	99	57.895	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	57.031	ENSCHIG00000012901	RPP30	99	57.031	Capra_hircus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.015	ENSTSYG00000013903	RPP30	99	56.015	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000013854	rpp30	85	42.017	ENSCAPG00000001326	RPP30	98	43.421	Cavia_aperea
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.391	ENSCPOG00000033174	RPP30	99	56.391	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	57.037	ENSCCAG00000029514	RPP30	99	57.037	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000013854	rpp30	99	56.250	ENSCATG00000042072	RPP30	99	56.667	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.391	ENSCLAG00000008595	RPP30	99	56.391	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	56.296	ENSCSAG00000006694	RPP30	99	56.296	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000013854	rpp30	54	35.119	ENSCHOG00000007023	-	65	35.119	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	56.134	ENSCPBG00000026518	RPP30	98	56.134	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000013854	rpp30	54	48.980	ENSCING00000019714	-	93	36.255	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000013854	rpp30	92	38.783	ENSCSAVG00000011282	-	87	38.783	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	56.296	ENSCANG00000041084	RPP30	99	56.296	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	48.519	ENSCGRG00001000834	-	99	48.519	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000013854	rpp30	85	58.369	ENSCGRG00001017068	-	97	58.369	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	55.556	ENSCGRG00000002508	-	99	55.556	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	48.889	ENSCGRG00000006196	-	99	48.889	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000013854	rpp30	100	70.652	ENSCSEG00000001779	rpp30	95	70.652	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	78.277	ENSCVAG00000003139	rpp30	99	78.277	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000013854	rpp30	99	64.444	ENSDARG00000027428	rpp30	99	64.444	Danio_rerio
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.391	ENSDNOG00000010186	RPP30	91	56.391	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.767	ENSDORG00000015333	Rpp30	99	56.767	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000013854	rpp30	89	30.924	FBgn0283652	Rpp30	82	30.924	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.015	ENSETEG00000018823	RPP30	99	56.015	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000013854	rpp30	52	40.146	ENSEBUG00000003989	-	80	40.146	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.767	ENSEASG00005011050	RPP30	99	56.767	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.767	ENSECAG00000021917	RPP30	99	56.767	Equus_caballus
ENSSMAG00000013854	rpp30	96	38.636	ENSEEUG00000009986	-	99	38.636	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000013854	rpp30	99	61.255	ENSELUG00000003731	rpp30	95	61.255	Esox_lucius
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	57.895	ENSFCAG00000029073	RPP30	92	57.895	Felis_catus
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	53.704	ENSFALG00000007711	RPP30	99	53.704	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.391	ENSFDAG00000019241	RPP30	99	56.391	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000013854	rpp30	92	75.697	ENSFHEG00000014739	rpp30	98	75.410	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000013854	rpp30	89	67.227	ENSGMOG00000005379	rpp30	99	67.227	Gadus_morhua
ENSSMAG00000013854	rpp30	96	52.239	ENSGALG00000006486	RPP30	99	57.724	Gallus_gallus
ENSSMAG00000013854	rpp30	94	75.686	ENSGAFG00000001445	rpp30	94	75.686	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000013854	rpp30	99	76.429	ENSGACG00000010285	rpp30	100	76.429	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000013854	rpp30	92	57.708	ENSGAGG00000000980	RPP30	65	57.708	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000013854	rpp30	100	56.000	ENSGGOG00000026917	RPP30	99	56.667	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	80.970	ENSHBUG00000019332	rpp30	99	80.970	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.391	ENSHGLG00000013072	RPP30	99	56.391	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.391	ENSHGLG00100017798	RPP30	99	56.391	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000013854	rpp30	100	65.371	ENSHCOG00000004763	-	100	65.371	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	60.674	ENSIPUG00000003863	rpp30	99	60.674	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	55.639	ENSSTOG00000027002	RPP30	99	55.639	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	58.519	ENSJJAG00000020041	Rpp30	99	58.519	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000013854	rpp30	99	78.439	ENSKMAG00000015355	rpp30	99	78.439	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000013854	rpp30	100	67.636	ENSLBEG00000019989	rpp30	100	67.636	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000013854	rpp30	70	47.727	ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.727	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	61.423	ENSLOCG00000000031	rpp30	98	61.423	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	55.556	ENSLAFG00000015931	RPP30	99	55.556	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000013854	rpp30	99	55.882	ENSMFAG00000031109	RPP30	99	56.296	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	56.296	ENSMMUG00000006628	RPP30	99	56.296	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000013854	rpp30	99	55.515	ENSMNEG00000033838	RPP30	97	62.400	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000013854	rpp30	99	55.882	ENSMLEG00000037578	RPP30	99	56.296	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	81.111	ENSMAMG00000010934	rpp30	99	81.111	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	81.343	ENSMZEG00005018508	-	99	81.343	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000013854	rpp30	96	47.761	ENSMGAG00000008452	RPP30	100	48.134	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	55.926	ENSMAUG00000008797	Rpp30	99	55.926	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000013854	rpp30	100	56.727	ENSMICG00000012019	RPP30	99	57.519	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	54.444	ENSMOCG00000016872	Rpp30	99	54.444	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000013854	rpp30	93	81.301	ENSMMOG00000009266	rpp30	95	81.301	Mola_mola
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	47.925	ENSMODG00000009342	-	99	47.925	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.226	ENSMODG00000006863	-	99	56.226	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	78.229	ENSMALG00000011718	rpp30	99	78.229	Monopterus_albus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	55.263	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	55.263	Mus_caroli
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	55.639	ENSMUSG00000024800	Rpp30	99	55.639	Mus_musculus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	55.263	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	55.263	Mus_pahari
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	55.185	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	55.185	Mus_spretus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	58.647	ENSMPUG00000017258	RPP30	93	58.647	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	57.037	ENSMLUG00000017169	RPP30	99	57.037	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000013854	rpp30	70	56.477	ENSNGAG00000014392	-	82	56.477	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000013854	rpp30	94	56.654	ENSNGAG00000012018	-	98	56.654	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000013854	rpp30	93	73.171	ENSNBRG00000024170	-	94	73.171	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000013854	rpp30	100	56.000	ENSNLEG00000012383	RPP30	99	56.667	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	51.292	ENSMEUG00000015587	-	100	51.292	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000013854	rpp30	52	63.380	ENSOPRG00000007367	-	100	63.380	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	42.105	ENSODEG00000004560	-	99	42.105	Octodon_degus
ENSSMAG00000013854	rpp30	94	56.654	ENSODEG00000004530	-	99	56.654	Octodon_degus
ENSSMAG00000013854	rpp30	75	82.353	ENSONIG00000019140	rpp30	100	80.193	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	56.981	ENSOANG00000003415	RPP30	99	56.981	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	54.135	ENSOCUG00000006896	RPP30	91	54.135	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000013854	rpp30	93	79.842	ENSORLG00000020420	rpp30	86	79.842	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000013854	rpp30	97	78.947	ENSORLG00020009037	-	99	78.947	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000013854	rpp30	97	78.947	ENSORLG00015008300	rpp30	92	78.947	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000013854	rpp30	69	80.663	ENSOMEG00000012640	-	98	80.663	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	57.143	ENSOGAG00000013963	RPP30	99	57.143	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000013854	rpp30	94	54.373	ENSOARG00000015789	RPP30	98	54.373	Ovis_aries
ENSSMAG00000013854	rpp30	98	56.667	ENSPPAG00000043779	RPP30	99	56.667	Pan_paniscus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	57.895	ENSPPRG00000000115	RPP30	99	57.895	Panthera_pardus
ENSSMAG00000013854	rpp30	95	57.895	ENSPTIG00000014949	RPP30	99	57.895	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000013854	rpp30	97	57.090	ENSPTRG00000002742	RPP30	99	55.769	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000013854	rpp30	99	55.882	ENSPANG00000021710	RPP30	99	56.296	Papio_anubis
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