EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000015598 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13053 bases
Position: chr15:14528481-14541533
Accession: ZDB-GENE-040426-1256
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000025466	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.4e-29	1	2
ENSSMAP00000025466	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.4e-29	2	2
ENSSMAP00000025488	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6.2e-29	1	2
ENSSMAP00000025488	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6.2e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000025798	-	4864	-	ENSSMAP00000025488	868 (aa)	-	-
ENSSMAT00000025776	-	5236	-	ENSSMAP00000025466	822 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSMAG00000015598's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSMAG00000015598's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.920	ENSG00000115421	PAPOLG	100	87.607	Homo_sapiens
ENSSMAG00000015598	papolg	100	84.465	ENSAPOG00000004798	papolg	95	97.504	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	77.891	ENSACIG00000010546	papolg	96	97.148	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000015598	papolg	100	87.100	ENSATEG00000009007	papolg	86	98.211	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000015598	papolg	93	63.452	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	78.839	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000015598	papolg	77	55.436	ENSACAG00000015048	-	83	73.201	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.386	ENSANAG00000024627	PAPOLG	99	81.533	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000015598	papolg	100	88.188	ENSACLG00000015592	papolg	98	87.791	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000015598	papolg	98	75.097	ENSAMXG00000004611	papolg	87	88.929	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000015598	papolg	99	67.097	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	98	82.616	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.085	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	95	82.491	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.000	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	78	81.142	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000015598	papolg	87	81.197	ENSCATG00000044395	PAPOLG	73	84.651	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.375	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	75	83.214	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.640	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	78	81.533	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000015598	papolg	85	65.455	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	99	80.567	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000015598	papolg	60	64.300	ENSCING00000024664	-	92	64.300	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000015598	papolg	59	64.948	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.948	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.640	ENSCANG00000038120	PAPOLG	80	81.533	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000015598	papolg	93	68.921	ENSCGRG00001014951	Papolg	76	81.900	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000015598	papolg	93	68.921	ENSCGRG00000005552	-	76	81.900	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000015598	papolg	95	80.332	ENSCSEG00000000771	papolg	99	97.326	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000015598	papolg	100	84.120	ENSCVAG00000016602	papolg	89	96.016	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000015598	papolg	98	75.924	ENSDARG00000012141	papolg	87	88.929	Danio_rerio
ENSSMAG00000015598	papolg	53	85.450	ENSDORG00000016228	Papolg	100	84.954	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000015598	papolg	95	55.348	ENSETEG00000011815	PAPOLG	73	67.283	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000015598	papolg	56	58.952	ENSEBUG00000005042	-	78	58.952	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000015598	papolg	54	72.135	ENSEBUG00000004020	papolg	88	72.135	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000015598	papolg	95	60.226	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	75	73.561	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	73.540	ENSELUG00000014497	papolg	78	90.519	Esox_lucius
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.790	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	75	83.154	Felis_catus
ENSSMAG00000015598	papolg	93	58.420	ENSFALG00000011079	PAPOLG	81	72.830	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.000	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	73	83.036	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000015598	papolg	69	81.010	ENSFHEG00000019080	papolg	58	94.375	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000015598	papolg	81	92.349	ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.171	Gadus_morhua
ENSSMAG00000015598	papolg	94	60.746	ENSGALG00000007853	PAPOLG	85	76.083	Gallus_gallus
ENSSMAG00000015598	papolg	100	83.986	ENSGAFG00000003263	papolg	67	94.580	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000015598	papolg	95	86.003	ENSGACG00000002718	papolg	88	97.662	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.544	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	78	81.533	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000015598	papolg	100	88.188	ENSHBUG00000004882	papolg	99	87.791	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000015598	papolg	93	68.535	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	76	82.857	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.165	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	78	81.347	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000015598	papolg	99	74.651	ENSIPUG00000021642	papolg	95	89.945	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.085	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	75	83.036	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000015598	papolg	53	85.681	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	85.185	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000015598	papolg	100	83.676	ENSKMAG00000016439	papolg	89	93.950	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000015598	papolg	100	87.100	ENSLBEG00000023218	papolg	98	86.921	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000015598	papolg	96	63.449	ENSLACG00000009543	PAPOLG	86	75.090	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000015598	papolg	99	76.448	ENSLOCG00000016130	papolg	87	90.942	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.915	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	96	87.409	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.554	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	78	81.707	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.554	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	78	81.707	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000015598	papolg	95	60.656	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	77	72.539	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.419	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	80	81.533	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000015598	papolg	85	96.460	ENSMAMG00000010667	papolg	95	96.283	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000015598	papolg	100	88.188	ENSMZEG00005018140	papolg	95	98.155	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000015598	papolg	93	61.608	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	85	75.752	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000015598	papolg	93	69.091	ENSMAUG00000009088	Papolg	76	82.796	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.669	ENSMICG00000010042	PAPOLG	99	80.977	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.147	ENSMOCG00000006857	Papolg	78	81.282	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000015598	papolg	99	84.447	ENSMMOG00000008020	papolg	87	96.564	Mola_mola
ENSSMAG00000015598	papolg	93	67.853	ENSMODG00000002160	PAPOLG	71	84.181	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000015598	papolg	99	85.835	ENSMALG00000007012	papolg	98	85.648	Monopterus_albus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.535	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	85.781	Mus_caroli
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.535	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.781	Mus_musculus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.408	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.781	Mus_spretus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.000	ENSNGAG00000001120	Papolg	78	80.936	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000015598	papolg	95	77.382	ENSNBRG00000011943	papolg	82	86.531	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000015598	papolg	53	85.185	ENSNLEG00000009507	-	100	84.954	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000015598	papolg	57	68.000	ENSMEUG00000013605	-	68	67.791	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000015598	papolg	51	83.933	ENSODEG00000012424	PAPOLG	97	84.019	Octodon_degus
ENSSMAG00000015598	papolg	99	77.150	ENSONIG00000002985	papolg	87	87.928	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000015598	papolg	98	66.962	ENSOANG00000012403	PAPOLG	85	83.395	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.166	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	78	80.656	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000015598	papolg	100	82.373	ENSORLG00000001577	papolg	68	93.531	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000015598	papolg	100	82.143	ENSORLG00020002482	papolg	68	93.706	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000015598	papolg	100	82.373	ENSORLG00015008836	papolg	68	93.706	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000015598	papolg	100	82.877	ENSOMEG00000001406	papolg	68	93.531	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000015598	papolg	57	55.579	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	65	75.472	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.794	ENSOARG00000001563	PAPOLG	68	82.975	Ovis_aries
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.920	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	99	81.882	Pan_paniscus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.790	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	75	83.154	Panthera_pardus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.665	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	75	82.975	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.920	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	99	81.882	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000015598	papolg	95	64.177	ENSPANG00000014543	PAPOLG	77	77.257	Papio_anubis
ENSSMAG00000015598	papolg	99	72.785	ENSPKIG00000003313	papolg	97	88.043	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000015598	papolg	96	73.040	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	92	87.455	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000015598	papolg	96	65.051	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	83	81.203	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000015598	papolg	93	68.523	ENSPEMG00000008960	-	76	82.616	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000015598	papolg	61	63.944	ENSPMAG00000004864	-	96	64.887	Petromyzon_marinus
ENSSMAG00000015598	papolg	94	52.506	ENSPMAG00000002961	papolg	75	61.972	Petromyzon_marinus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.665	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	78	80.522	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000015598	papolg	100	84.350	ENSPFOG00000012909	papolg	73	95.848	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000015598	papolg	100	84.332	ENSPLAG00000018445	papolg	67	95.105	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000015598	papolg	100	84.580	ENSPMEG00000003961	papolg	67	95.105	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000015598	papolg	100	84.350	ENSPREG00000010358	papolg	67	94.755	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.386	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	78	81.707	Pongo_abelii
ENSSMAG00000015598	papolg	93	61.783	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	85	83.726	Procavia_capensis
ENSSMAG00000015598	papolg	95	62.453	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	92	74.957	Propithecus_coquereli
ENSSMAG00000015598	papolg	80	81.655	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	86	83.240	Pteropus_vampyrus
ENSSMAG00000015598	papolg	100	88.188	ENSPNYG00000006729	papolg	94	97.148	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000015598	papolg	98	75.226	ENSPNAG00000015521	papolg	88	88.014	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.625	ENSRNOG00000006261	Papolg	78	81.282	Rattus_norvegicus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	63.776	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	77	75.610	Rhinopithecus_bieti
ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.240	ENSRROG00000035954	PAPOLG	80	81.707	Rhinopithecus_roxellana
ENSSMAG00000015598	papolg	89	68.218	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	74	82.197	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000015598	papolg	95	64.204	ENSSFOG00015011874	papolg	91	79.891	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	70.375	ENSSFOG00015002383	papolg	97	85.088	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000015598	papolg	100	89.171	ENSSDUG00000000912	papolg	95	97.683	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000015598	papolg	100	89.055	ENSSLDG00000001217	papolg	92	93.060	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000015598	papolg	94	65.700	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	74	81.618	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000015598	papolg	100	88.242	ENSSPAG00000009004	papolg	94	97.504	Stegastes_partitus
ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.750	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	81.002	Sus_scrofa
ENSSMAG00000015598	papolg	64	73.245	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	72.830	Taeniopygia_guttata
ENSSMAG00000015598	papolg	95	79.592	ENSTRUG00000006410	papolg	93	93.628	Takifugu_rubripes
ENSSMAG00000015598	papolg	95	78.239	ENSTNIG00000017106	papolg	78	86.575	Tetraodon_nigroviridis
ENSSMAG00000015598	papolg	93	62.468	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	98	76.071	Tupaia_belangeri
ENSSMAG00000015598	papolg	96	64.413	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	76	78.393	Vicugna_pacos
ENSSMAG00000015598	papolg	93	66.879	ENSXETG00000002208	papolg	72	81.181	Xenopus_tropicalis
ENSSMAG00000015598	papolg	61	95.825	ENSXCOG00000006611	papolg	73	95.825	Xiphophorus_couchianus
ENSSMAG00000015598	papolg	68	93.254	ENSXMAG00000007383	papolg	94	93.902	Xiphophorus_maculatus