EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000015740 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: mtrf1
Alias: zgc:113104
Full Name: mitochondrial translational release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3056 bases
Position: chr1:11112469-11115524
Accession: ZDB-GENE-050220-8
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000025693	RF-1	PF00472.20	2.3e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000026005	-	1597	-	ENSSMAP00000025693	446 (aa)	-	A0A2U9AWP6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	40.806	ENSSMAG00000019886	mtrf1l	86	40.806

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.482	ENSG00000120662	MTRF1	94	52.482	Homo_sapiens
ENSSMAG00000015740	mtrf1	88	77.975	ENSAPOG00000010181	mtrf1	95	77.975	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	57.218	ENSAMEG00000008696	MTRF1	85	57.218	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000015740	mtrf1	55	84.082	ENSACIG00000001495	mtrf1	98	84.082	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	77.477	ENSAOCG00000002832	mtrf1	98	77.477	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	76.802	ENSAPEG00000014844	mtrf1	98	76.802	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000015740	mtrf1	92	74.699	ENSATEG00000017403	mtrf1	99	74.699	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	84	54.521	ENSAPLG00000009317	MTRF1	87	54.521	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	54.780	ENSACAG00000000897	MTRF1	87	54.780	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000015740	mtrf1	75	58.806	ENSANAG00000025310	-	92	58.806	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	52.865	ENSANAG00000023063	-	85	52.865	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	77.455	ENSACLG00000023945	mtrf1	99	77.455	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000015740	mtrf1	55	73.171	ENSAMXG00000031859	mtrf1	99	73.171	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.510	ENSBTAG00000012260	MTRF1	85	58.263	Bos_taurus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.919	ENSCJAG00000017739	MTRF1	96	66.467	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	56.806	ENSCAFG00000004795	MTRF1	86	56.806	Canis_familiaris
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	56.806	ENSCAFG00020018178	MTRF1	86	56.806	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.510	ENSCHIG00000011810	MTRF1	86	56.510	Capra_hircus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	56.298	ENSTSYG00000006976	MTRF1	87	56.298	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.104	ENSCAPG00000013163	MTRF1	88	56.104	Cavia_aperea
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	55.844	ENSCPOG00000005264	MTRF1	85	55.844	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	57.180	ENSCCAG00000035116	MTRF1	85	57.180	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.482	ENSCATG00000009909	MTRF1	94	52.482	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	55.875	ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	55.875	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.246	ENSCSAG00000017835	MTRF1	94	52.246	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	79	53.258	ENSCHOG00000011915	-	86	53.258	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	55.181	ENSCPBG00000007969	MTRF1	86	55.181	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.009	ENSCANG00000040353	MTRF1	94	52.009	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.736	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	86	56.736	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.736	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	86	56.736	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	69.556	ENSCSEG00000005667	mtrf1	99	69.556	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000015740	mtrf1	97	67.130	ENSCVAG00000021729	mtrf1	99	66.438	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	52	65.517	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	65.517	Danio_rerio
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	54.286	ENSDNOG00000034196	MTRF1	98	60.526	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	57.180	ENSDORG00000016429	Mtrf1	86	57.180	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	54.780	ENSETEG00000014811	MTRF1	86	54.780	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000015740	mtrf1	52	54.348	ENSEBUG00000000778	mtrf1	94	54.348	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	55.814	ENSEASG00005015715	MTRF1	86	55.814	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	56.430	ENSECAG00000014389	MTRF1	83	56.430	Equus_caballus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	43.333	ENSEEUG00000004450	-	87	43.590	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	88	69.543	ENSELUG00000006544	mtrf1	91	69.543	Esox_lucius
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	57.743	ENSFCAG00000031635	MTRF1	85	57.743	Felis_catus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	53.351	ENSFALG00000008036	MTRF1	96	53.351	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	55.814	ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	55.814	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000015740	mtrf1	97	69.676	ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	69.676	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	66.491	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	66.491	Gadus_morhua
ENSSMAG00000015740	mtrf1	84	55.585	ENSGALG00000016951	MTRF1	82	55.585	Gallus_gallus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	71.106	ENSGAFG00000007093	mtrf1	99	71.106	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	80.371	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	80.371	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	71	59.494	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	59.494	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.246	ENSGGOG00000002529	MTRF1	94	52.246	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000015740	mtrf1	96	51.282	ENSHGLG00000003210	MTRF1	95	51.282	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	54.499	ENSHGLG00100011843	MTRF1	87	54.499	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000015740	mtrf1	96	68.046	ENSHCOG00000009449	mtrf1	98	68.046	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.397	ENSSTOG00000021682	MTRF1	86	56.397	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.806	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	85	56.806	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	100	71.556	ENSKMAG00000003231	mtrf1	99	71.556	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	54	88.703	ENSLBEG00000023151	mtrf1	96	88.703	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000015740	mtrf1	54	88.703	ENSLBEG00000027169	-	96	88.703	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	59.530	ENSLACG00000010582	MTRF1	85	59.530	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	61.917	ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	61.917	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	43.702	ENSLAFG00000030499	-	86	43.702	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	55.641	ENSLAFG00000022177	-	87	55.641	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.482	ENSMFAG00000037972	MTRF1	94	52.482	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.482	ENSMNEG00000035487	MTRF1	94	52.482	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.358	ENSMLEG00000033582	MTRF1	94	52.358	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	75.955	ENSMAMG00000022048	mtrf1	99	75.955	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	77.455	ENSMZEG00005017922	mtrf1	99	77.455	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000015740	mtrf1	84	55.585	ENSMGAG00000014971	MTRF1	90	56.117	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.848	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	86	56.848	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.658	ENSMICG00000033131	MTRF1	86	56.658	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	88	55.980	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	88	55.980	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000015740	mtrf1	54	70.782	ENSMMOG00000013394	mtrf1	100	70.782	Mola_mola
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	54.756	ENSMODG00000014772	MTRF1	87	54.756	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000015740	mtrf1	98	77.273	ENSMALG00000013274	mtrf1	99	77.273	Monopterus_albus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	82	58.197	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	81	58.197	Mus_caroli
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	57.784	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	85	57.784	Mus_musculus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	56.728	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	85	56.728	Mus_pahari
ENSSMAG00000015740	mtrf1	84	58.021	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	83	58.021	Mus_spretus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	57.330	ENSMPUG00000001874	MTRF1	85	57.330	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.250	ENSMLUG00000017237	MTRF1	86	56.250	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	83	58.133	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	83	58.133	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000015740	mtrf1	53	85.169	ENSNBRG00000004634	mtrf1	99	85.169	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.719	ENSNLEG00000001236	MTRF1	94	52.719	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	52.972	ENSMEUG00000001846	MTRF1	87	52.972	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000015740	mtrf1	61	35.401	ENSOPRG00000006450	-	83	35.401	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.136	ENSODEG00000005782	MTRF1	86	56.136	Octodon_degus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	82.597	ENSONIG00000012476	mtrf1	99	82.597	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	68	58.306	ENSOANG00000003383	-	97	58.306	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.658	ENSOCUG00000025207	MTRF1	85	56.658	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	67.647	ENSORLG00000003225	mtrf1	98	67.647	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	67.640	ENSORLG00020021048	mtrf1	98	67.640	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	67.647	ENSORLG00015020957	mtrf1	98	67.647	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	68.326	ENSOMEG00000002022	mtrf1	97	68.326	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000015740	mtrf1	73	50.462	ENSOGAG00000026411	-	99	50.462	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000015740	mtrf1	79	59.207	ENSOGAG00000009719	-	79	59.207	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	56.510	ENSOARG00000006994	MTRF1	86	56.510	Ovis_aries
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.482	ENSPPAG00000000050	MTRF1	94	52.482	Pan_paniscus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	58.005	ENSPPRG00000009511	MTRF1	85	58.005	Panthera_pardus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	57.743	ENSPTIG00000006673	MTRF1	85	57.743	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.482	ENSPTRG00000005815	MTRF1	94	52.482	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000015740	mtrf1	95	52.482	ENSPANG00000010809	MTRF1	94	52.482	Papio_anubis
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	59.079	ENSPKIG00000015711	mtrf1	91	59.079	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	54.404	ENSPSIG00000004773	MTRF1	85	54.922	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000015740	mtrf1	52	82.051	ENSPMGG00000006724	mtrf1	95	82.051	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	85	56.842	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	85	56.842	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000015740	mtrf1	69	53.185	ENSPMAG00000009849	mtrf1	89	53.503	Petromyzon_marinus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	54.453	ENSPCIG00000012940	MTRF1	87	55.527	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000015740	mtrf1	97	70.602	ENSPFOG00000000254	mtrf1	98	70.602	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000015740	mtrf1	97	71.065	ENSPLAG00000014280	mtrf1	98	71.065	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000015740	mtrf1	97	70.833	ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	70.833	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000015740	mtrf1	52	75.966	ENSPREG00000018619	mtrf1	96	75.966	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000015740	mtrf1	86	55.091	ENSPPYG00000005313	MTRF1	86	55.091	Pongo_abelii
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ENSSMAG00000015740	mtrf1	97	71.363	ENSXMAG00000009853	mtrf1	98	71.363	Xiphophorus_maculatus