EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000016747 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ptrh1
Alias: zgc:112961
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6299 bases
Position: chr9:24321565-24327863
Accession: ZDB-GENE-050306-33
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000027394	Pept_tRNA_hydro	PF01195.19	8.7e-42	1	1
ENSSMAP00000027377	Pept_tRNA_hydro	PF01195.19	4.3e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000027732	-	711	-	ENSSMAP00000027394	236 (aa)	-	-
ENSSMAT00000027714	-	2386	-	ENSSMAP00000027377	290 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	54.301	ENSG00000187024	PTRH1	84	54.301	Homo_sapiens
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	76.500	ENSAPOG00000000947	PTRH1	69	76.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	76.500	ENSAPOG00000003014	-	69	76.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	76.500	ENSAPOG00000010719	ptrh1	69	76.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	78	51.351	ENSAMEG00000016791	PTRH1	84	51.351	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000016747	ptrh1	86	75.000	ENSACIG00000006734	ptrh1	85	75.000	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	77.000	ENSAOCG00000009725	ptrh1	69	77.000	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	77.000	ENSAPEG00000020993	ptrh1	69	77.000	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000016747	ptrh1	86	81.773	ENSATEG00000010003	ptrh1	72	81.773	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	56.452	ENSANAG00000025547	PTRH1	84	56.452	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	79.000	ENSACLG00000025462	ptrh1	78	79.000	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000016747	ptrh1	87	65.049	ENSAMXG00000034117	ptrh1	73	65.049	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	57	55.224	ENSBTAG00000012736	PTRH1	64	43.850	Bos_taurus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	73	56.395	ENSCJAG00000019841	PTRH1	63	56.034	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	76	52.151	ENSCAFG00000020123	PTRH1	80	53.757	Canis_familiaris
ENSSMAG00000016747	ptrh1	76	52.432	ENSCAFG00020015776	PTRH1	77	54.070	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	55.615	ENSCHIG00000008188	PTRH1	84	55.615	Capra_hircus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	57	57.778	ENSCAPG00000015926	PTRH1	94	57.778	Cavia_aperea
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	54.545	ENSCPOG00000023968	PTRH1	85	54.545	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	54.301	ENSCCAG00000023134	PTRH1	84	54.301	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.763	ENSCATG00000042852	PTRH1	84	53.763	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	55.914	ENSCLAG00000011155	PTRH1	85	55.914	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.763	ENSCSAG00000013748	PTRH1	79	53.763	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	74	50.857	ENSCPBG00000025207	PTRH1	95	51.786	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.763	ENSCANG00000039856	PTRH1	84	53.763	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	56.150	ENSCGRG00001013108	Ptrh1	88	56.150	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	56.150	ENSCGRG00000016553	Ptrh1	99	56.150	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000016747	ptrh1	88	71.429	ENSCSEG00000010332	ptrh1	75	71.429	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000016747	ptrh1	86	75.000	ENSCVAG00000010701	ptrh1	73	77.451	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	97	59.565	ENSDARG00000098206	ptrh1	87	62.981	Danio_rerio
ENSSMAG00000016747	ptrh1	78	55.676	ENSDNOG00000024194	PTRH1	83	55.676	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	54.011	ENSDORG00000013321	Ptrh1	84	54.011	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	54.545	ENSEASG00005020466	PTRH1	84	54.545	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	54.545	ENSECAG00000007615	PTRH1	66	54.545	Equus_caballus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	84	68.812	ENSELUG00000015467	ptrh1	77	65.581	Esox_lucius
ENSSMAG00000016747	ptrh1	80	53.191	ENSFCAG00000001483	PTRH1	85	53.191	Felis_catus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	73	52.907	ENSFALG00000001352	PTRH1	81	52.907	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000016747	ptrh1	78	56.757	ENSFDAG00000020077	PTRH1	87	56.757	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000016747	ptrh1	80	79.255	ENSFHEG00000010590	ptrh1	75	76.847	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	51	64.754	ENSGMOG00000009801	PTRH1	100	62.937	Gadus_morhua
ENSSMAG00000016747	ptrh1	86	77.228	ENSGAFG00000016215	ptrh1	83	77.228	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000016747	ptrh1	70	83.030	ENSGACG00000014682	ptrh1	86	84.337	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	82	53.886	ENSGAGG00000022860	PTRH1	83	53.886	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.763	ENSGGOG00000011033	PTRH1	84	53.763	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	77.000	ENSHBUG00000020824	ptrh1	71	79.000	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000016747	ptrh1	78	55.676	ENSHGLG00000019147	PTRH1	88	55.676	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000016747	ptrh1	78	51.892	ENSHGLG00100003681	PTRH1	91	51.892	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000016747	ptrh1	74	74.857	ENSHCOG00000014772	ptrh1	71	71.505	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	66.000	ENSIPUG00000015364	ptrh1	75	66.000	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	67	59.236	ENSSTOG00000008942	PTRH1	84	55.135	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	55.615	ENSJJAG00000014338	Ptrh1	87	55.615	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	86	77.228	ENSKMAG00000003253	ptrh1	71	77.228	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	60	80.851	ENSLBEG00000028842	ptrh1	75	85.039	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000016747	ptrh1	83	56.345	ENSLACG00000016741	PTRH1	80	56.701	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000016747	ptrh1	73	52.601	ENSLAFG00000021934	PTRH1	84	52.601	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.763	ENSMFAG00000001700	PTRH1	84	53.763	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.763	ENSMMUG00000016424	PTRH1	84	53.763	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.763	ENSMNEG00000033061	PTRH1	79	53.763	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000016747	ptrh1	91	70.259	ENSMAMG00000017386	ptrh1	74	79.126	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	78.000	ENSMZEG00005020001	ptrh1	78	79.000	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	55.080	ENSMAUG00000006266	Ptrh1	88	55.080	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	78	52.973	ENSMICG00000005611	PTRH1	79	55.814	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	56.150	ENSMOCG00000013992	Ptrh1	88	56.150	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000016747	ptrh1	87	76.168	ENSMMOG00000014747	ptrh1	75	78.037	Mola_mola
ENSSMAG00000016747	ptrh1	80	51.323	ENSMODG00000005503	PTRH1	85	51.323	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000016747	ptrh1	66	75.641	ENSMALG00000005392	ptrh1	89	75.641	Monopterus_albus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	55.080	MGP_CAROLIEiJ_G0023450	Ptrh1	88	55.080	Mus_caroli
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	55.080	ENSMUSG00000053746	Ptrh1	88	55.080	Mus_musculus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	55.080	MGP_PahariEiJ_G0024907	Ptrh1	88	55.080	Mus_pahari
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	54.545	MGP_SPRETEiJ_G0024367	Ptrh1	88	54.545	Mus_spretus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	78	51.872	ENSMPUG00000013790	PTRH1	83	51.872	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000016747	ptrh1	88	47.556	ENSMLUG00000013454	PTRH1	86	50.505	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	54.545	ENSNGAG00000014008	Ptrh1	88	54.545	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	77.000	ENSNBRG00000015590	ptrh1	71	79.000	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.763	ENSNLEG00000017468	PTRH1	84	53.763	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000016747	ptrh1	78	55.676	ENSODEG00000004012	PTRH1	85	55.676	Octodon_degus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	77.000	ENSONIG00000013912	ptrh1	76	78.500	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	81	52.604	ENSOANG00000011891	PTRH1	85	52.604	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	54.839	ENSOCUG00000006894	PTRH1	77	54.839	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	81	54.211	ENSOGAG00000008094	PTRH1	87	54.211	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	50.000	ENSOARG00000011808	PTRH1	85	50.000	Ovis_aries
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	54.301	ENSPPAG00000041782	PTRH1	84	54.301	Pan_paniscus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	80	53.191	ENSPPRG00000007889	PTRH1	85	53.191	Panthera_pardus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	52	53.659	ENSPTIG00000021082	-	91	53.659	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	54.301	ENSPTRG00000021394	PTRH1	84	54.301	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	46.561	ENSPANG00000031755	PTRH1	83	46.561	Papio_anubis
ENSSMAG00000016747	ptrh1	84	63.819	ENSPKIG00000005449	ptrh1	64	63.819	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	49.744	ENSPSIG00000013828	PTRH1	71	49.744	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000016747	ptrh1	70	68.263	ENSPMGG00000002148	ptrh1	75	59.242	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	67	60.127	ENSPEMG00000014360	Ptrh1	87	56.757	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000016747	ptrh1	88	77.778	ENSPFOG00000003715	ptrh1	76	77.778	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000016747	ptrh1	86	78.713	ENSPLAG00000023354	ptrh1	80	77.295	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000016747	ptrh1	88	77.778	ENSPMEG00000000447	ptrh1	76	77.778	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000016747	ptrh1	88	76.329	ENSPREG00000012612	ptrh1	76	76.329	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	51.075	ENSPPYG00000019628	PTRH1	78	51.075	Pongo_abelii
ENSSMAG00000016747	ptrh1	73	56.395	ENSPCAG00000007016	PTRH1	80	56.395	Procavia_capensis
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.476	ENSPCOG00000014541	PTRH1	83	53.476	Propithecus_coquereli
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	56.150	ENSPVAG00000000954	PTRH1	84	56.150	Pteropus_vampyrus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	76.500	ENSPNYG00000007789	ptrh1	71	78.500	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	67.662	ENSPNAG00000029930	ptrh1	78	64.953	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	55.615	ENSRNOG00000049034	Ptrh1	88	55.615	Rattus_norvegicus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.763	ENSRBIG00000027290	PTRH1	84	53.763	Rhinopithecus_bieti
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.763	ENSRROG00000028799	PTRH1	79	53.763	Rhinopithecus_roxellana
ENSSMAG00000016747	ptrh1	69	32.948	YHR189W	PTH1	89	32.948	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	53.763	ENSSBOG00000026699	PTRH1	79	53.763	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSMAG00000016747	ptrh1	75	52.128	ENSSHAG00000018238	PTRH1	86	53.672	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000016747	ptrh1	75	67.045	ENSSFOG00015007053	ptrh1	84	67.251	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	86	73.892	ENSSDUG00000013471	ptrh1	87	84.049	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000016747	ptrh1	70	81.325	ENSSLDG00000024662	ptrh1	88	76.098	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000016747	ptrh1	80	51.064	ENSSPUG00000000040	PTRH1	82	51.064	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	85	78.000	ENSSPAG00000003298	ptrh1	88	80.682	Stegastes_partitus
ENSSMAG00000016747	ptrh1	79	55.376	ENSSSCG00000005615	PTRH1	84	55.376	Sus_scrofa
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