EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000017171 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6669 bases
Position: chr18:12079123-12085791
Accession: ZDB-GENE-040426-1074
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000028133	eRF1_2	PF03464.15	1.3e-31	1	1
ENSSMAP00000028133	eRF1_3	PF03465.15	1.2e-25	1	1
ENSSMAP00000028133	eRF1_1	PF03463.15	5.3e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000028484	-	2443	-	ENSSMAP00000028133	385 (aa)	-	A0A2U9CMA9

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.260	ENSG00000152684	PELO	100	80.260	Homo_sapiens
ENSSMAG00000017171	pelo	100	94.286	ENSAPOG00000023072	pelo	100	94.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000017171	pelo	64	94.737	ENSAPOG00000023700	-	90	94.737	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000017171	pelo	64	94.737	ENSAPOG00000000616	pelo	90	94.737	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.000	ENSAMEG00000007734	PELO	100	80.000	Ailuropoda_melanoleuca
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ENSSMAG00000017171	pelo	100	94.545	ENSAOCG00000023717	pelo	100	94.545	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000017171	pelo	100	94.545	ENSAPEG00000011235	pelo	100	94.545	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000017171	pelo	100	94.286	ENSATEG00000019550	pelo	100	94.286	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000017171	pelo	77	70.805	ENSAPLG00000013265	PELO	100	70.805	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000017171	pelo	98	80.053	ENSACAG00000004352	PELO	100	79.740	Anolis_carolinensis
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ENSSMAG00000017171	pelo	100	91.169	ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000017171	pelo	97	93.029	ENSAMXG00000020299	pelo	100	92.487	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	79.740	ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	Bos_taurus
ENSSMAG00000017171	pelo	98	60.106	WBGene00011280	pelo-1	99	60.106	Caenorhabditis_elegans
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.260	ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.260	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.260	ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.260	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000017171	pelo	100	79.481	ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	Capra_hircus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.260	ENSTSYG00000005203	PELO	100	80.260	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.260	ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.260	ENSCCAG00000035600	PELO	100	80.260	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.260	ENSCATG00000011829	PELO	100	80.260	Cercocebus_atys
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ENSSMAG00000017171	pelo	98	80.319	ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000017171	pelo	97	63.807	ENSCING00000001979	-	100	63.896	Ciona_intestinalis
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ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.260	ENSCANG00000023382	PELO	100	80.260	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000017171	pelo	97	80.965	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.779	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000017171	pelo	97	81.769	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.558	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000017171	pelo	100	93.506	ENSCSEG00000008807	pelo	100	93.506	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000017171	pelo	100	91.948	ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.948	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	89.351	ENSDARG00000055477	pelo	100	89.351	Danio_rerio
ENSSMAG00000017171	pelo	100	77.202	ENSDNOG00000036721	PELO	100	77.202	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.519	ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.519	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000017171	pelo	96	68.378	FBgn0011207	pelo	97	66.841	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000017171	pelo	71	77.778	ENSEBUG00000004955	pelo	99	77.778	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000017171	pelo	100	79.481	ENSEASG00005013348	PELO	100	79.481	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	91.688	ENSELUG00000023229	pelo	100	91.688	Esox_lucius
ENSSMAG00000017171	pelo	100	79.740	ENSFCAG00000032341	PELO	100	79.740	Felis_catus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.519	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.519	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000017171	pelo	74	81.690	ENSFDAG00000002076	PELO	88	81.690	Fukomys_damarensis
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ENSSMAG00000017171	pelo	98	91.777	ENSGMOG00000005849	pelo	100	91.429	Gadus_morhua
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ENSSMAG00000017171	pelo	100	94.805	ENSGACG00000007245	pelo	97	98.352	Gasterosteus_aculeatus
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ENSSMAG00000017171	pelo	96	91.644	ENSONIG00000011511	pelo	100	91.169	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.260	ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.260	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000017171	pelo	100	92.727	ENSORLG00000005827	pelo	100	92.727	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000017171	pelo	100	92.987	ENSORLG00020016456	pelo	100	92.987	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000017171	pelo	100	92.987	ENSORLG00015014447	pelo	100	93.056	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000017171	pelo	100	93.766	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.766	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.779	ENSOGAG00000027940	PELO	100	80.779	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000017171	pelo	100	79.740	ENSOARG00000008324	PELO	99	79.740	Ovis_aries
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