EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000017528 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rab1ab
Alias: fb53a02|rab1a|si:zc101n13.3|wu:fb53a02
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family b
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13854 bases
Position: chr15:744926-758779
Accession: ZDB-GENE-030616-564
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000028651	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-05	1	1
ENSSMAP00000028645	MMR_HSR1	PF01926.23	1.8e-05	1	1
ENSSMAP00000028635	MMR_HSR1	PF01926.23	1.8e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000028988	-	4191	-	ENSSMAP00000028635	203 (aa)	-	-
ENSSMAT00000029003	-	607	-	ENSSMAP00000028651	201 (aa)	-	-
ENSSMAT00000029000	-	4219	-	ENSSMAP00000028645	203 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000017528	rab1ab	90	45.355	ENSSMAG00000016183	rab25b	82	47.126
ENSSMAG00000017528	rab1ab	61	31.746	ENSSMAG00000017643	arl2	64	31.746
ENSSMAG00000017528	rab1ab	61	30.709	ENSSMAG00000014218	-	62	30.709
ENSSMAG00000017528	rab1ab	81	46.429	ENSSMAG00000002229	zgc:101559	71	46.429
ENSSMAG00000017528	rab1ab	58	30.081	ENSSMAG00000006125	-	63	30.081
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	35.922	ENSSMAG00000001414	-	88	35.922
ENSSMAG00000017528	rab1ab	58	30.252	ENSSMAG00000016399	arl4cb	61	30.252
ENSSMAG00000017528	rab1ab	97	33.500	ENSSMAG00000014984	rras	94	32.308
ENSSMAG00000017528	rab1ab	81	30.952	ENSSMAG00000014329	si:cabz01085950.1	82	30.952
ENSSMAG00000017528	rab1ab	83	34.302	ENSSMAG00000013303	rheb	88	34.146
ENSSMAG00000017528	rab1ab	96	46.667	ENSSMAG00000011814	rab18b	79	52.469
ENSSMAG00000017528	rab1ab	70	30.556	ENSSMAG00000005803	arl3	74	30.556
ENSSMAG00000017528	rab1ab	84	48.235	ENSSMAG00000012678	rab12	80	44.560
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	35.885	ENSSMAG00000017426	rab9a	93	36.364
ENSSMAG00000017528	rab1ab	97	37.629	ENSSMAG00000017205	-	93	37.629
ENSSMAG00000017528	rab1ab	80	51.852	ENSSMAG00000002969	rab18a	79	51.852
ENSSMAG00000017528	rab1ab	81	35.583	ENSSMAG00000004606	rabl2	71	35.583
ENSSMAG00000017528	rab1ab	66	32.609	ENSSMAG00000002487	-	77	32.374
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	71.495	ENSSMAG00000004416	-	81	83.815
ENSSMAG00000017528	rab1ab	77	38.365	ENSSMAG00000014078	RAB9A	79	38.365
ENSSMAG00000017528	rab1ab	87	41.573	ENSSMAG00000020311	rab42a	80	41.714
ENSSMAG00000017528	rab1ab	97	53.769	ENSSMAG00000002569	-	84	57.803
ENSSMAG00000017528	rab1ab	81	37.349	ENSSMAG00000013945	si:dkey-13a21.4	80	36.747
ENSSMAG00000017528	rab1ab	59	33.613	ENSSMAG00000015087	arl8a	61	33.613
ENSSMAG00000017528	rab1ab	97	38.776	ENSSMAG00000015774	rab41	92	38.776
ENSSMAG00000017528	rab1ab	83	52.381	ENSSMAG00000018613	-	76	53.012
ENSSMAG00000017528	rab1ab	98	40.777	ENSSMAG00000018454	-	96	40.777
ENSSMAG00000017528	rab1ab	97	45.641	ENSSMAG00000009229	rab5aa	91	45.641
ENSSMAG00000017528	rab1ab	58	30.081	ENSSMAG00000004541	-	63	30.081
ENSSMAG00000017528	rab1ab	81	38.554	ENSSMAG00000006709	rab9b	80	38.554
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.611	ENSSMAG00000021049	-	100	92.611
ENSSMAG00000017528	rab1ab	97	37.374	ENSSMAG00000000335	rab6bb	93	37.629
ENSSMAG00000017528	rab1ab	79	58.491	ENSSMAG00000011769	si:dkey-16l2.16	72	57.317
ENSSMAG00000017528	rab1ab	83	48.795	ENSSMAG00000019773	rab15	79	48.521
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	46.000	ENSSMAG00000002500	rab30	97	46.000
ENSSMAG00000017528	rab1ab	82	35.673	ENSSMAG00000019926	rab34b	73	35.673
ENSSMAG00000017528	rab1ab	98	43.750	ENSSMAG00000003166	rab14	96	42.233
ENSSMAG00000017528	rab1ab	97	35.160	ENSSMAG00000012178	-	90	35.160
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	45.755	ENSSMAG00000004922	rab11bb	96	45.283
ENSSMAG00000017528	rab1ab	82	35.329	ENSSMAG00000004806	si:ch73-116o1.2	80	35.329
ENSSMAG00000017528	rab1ab	97	40.513	ENSSMAG00000010140	rab22a	84	41.772
ENSSMAG00000017528	rab1ab	58	30.328	ENSSMAG00000013072	-	61	30.328
ENSSMAG00000017528	rab1ab	92	47.594	ENSSMAG00000001002	rab2a	99	45.238
ENSSMAG00000017528	rab1ab	87	45.251	ENSSMAG00000005651	-	78	47.273
ENSSMAG00000017528	rab1ab	79	38.037	ENSSMAG00000004343	rab34a	60	38.037
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.611	ENSSMAG00000009201	rab1ba	100	90.640
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	46.919	ENSSMAG00000004133	rab11a	96	47.115
ENSSMAG00000017528	rab1ab	61	30.233	ENSSMAG00000011361	arf5	66	30.328
ENSSMAG00000017528	rab1ab	80	41.566	ENSSMAG00000020045	rab36	62	41.566
ENSSMAG00000017528	rab1ab	60	35.200	ENSSMAG00000008394	arl4d	65	34.091
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	41.294	ENSSMAG00000009722	rab25a	96	41.584
ENSSMAG00000017528	rab1ab	91	32.787	ENSSMAG00000006341	rab23	98	31.527
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	47.115	ENSSMAG00000016206	rab11al	96	47.115
ENSSMAG00000017528	rab1ab	83	45.029	ENSSMAG00000001953	rab39bb	80	45.029
ENSSMAG00000017528	rab1ab	85	47.647	ENSSMAG00000007323	rab5c	89	44.615
ENSSMAG00000017528	rab1ab	85	44.253	ENSSMAG00000015955	rab33ba	77	43.316
ENSSMAG00000017528	rab1ab	98	52.020	ENSSMAG00000016376	-	85	56.805
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	56.098	ENSSMAG00000000660	rab35b	100	56.098
ENSSMAG00000017528	rab1ab	93	42.268	ENSSMAG00000013733	rab33a	71	42.268
ENSSMAG00000017528	rab1ab	92	33.333	ENSSMAG00000001964	rhebl1	88	34.146
ENSSMAG00000017528	rab1ab	82	36.970	ENSSMAG00000007370	kras	87	37.423
ENSSMAG00000017528	rab1ab	61	30.952	ENSSMAG00000017183	-	62	30.952
ENSSMAG00000017528	rab1ab	97	36.683	ENSSMAG00000011579	RAB7A	96	36.683
ENSSMAG00000017528	rab1ab	58	33.333	ENSSMAG00000015059	arl4aa	59	33.333
ENSSMAG00000017528	rab1ab	86	36.158	ENSSMAG00000008745	hrasb	86	37.576

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSG00000174903	RAB1B	100	90.640	Homo_sapiens
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	98.522	ENSAPOG00000007746	rab1ab	100	98.522	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	93.103	ENSAPOG00000012767	rab1ba	100	91.133	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSAMEG00000017135	RAB1B	100	90.640	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	92.424	ENSACIG00000014625	-	100	88.293	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	97.980	ENSACIG00000019049	rab1ab	99	95.545	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	98.522	ENSAOCG00000006385	rab1ab	100	98.522	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	93.103	ENSAOCG00000003965	rab1ba	100	91.133	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	93.103	ENSAPEG00000012105	rab1ba	100	91.133	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	98.522	ENSAPEG00000001358	rab1ab	100	98.522	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	92.424	ENSATEG00000015844	-	100	91.133	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	93.103	ENSATEG00000002479	rab1ba	100	91.133	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	99.507	ENSATEG00000008052	rab1ab	100	99.507	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	67	97.037	ENSACAG00000009125	RAB1B	96	97.037	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSANAG00000022585	RAB1B	100	90.640	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	98.522	ENSACLG00000007644	rab1ab	100	98.522	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	93.103	ENSACLG00000013668	rab1ba	100	91.133	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	95.074	ENSAMXG00000032564	rab1ab	100	95.074	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	92.424	ENSAMXG00000003547	rab1ba	89	90.000	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	98	91.327	ENSBTAG00000046485	RAB1B	66	89.796	Bos_taurus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSCJAG00000001599	-	100	90.640	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	91.133	ENSCJAG00000047933	-	100	89.655	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSCAFG00000012855	RAB1B	99	90.640	Canis_familiaris
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSCAFG00020015406	-	100	90.640	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	91.626	ENSCHIG00000015549	RAB1B	100	90.148	Capra_hircus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	91.960	ENSTSYG00000025638	RAB1B	99	88.780	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	91.919	ENSCAPG00000015495	RAB1B	98	90.404	Cavia_aperea
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSCPOG00000014868	RAB1B	100	90.640	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSCCAG00000021540	RAB1B	100	90.640	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSCATG00000002342	RAB1B	100	90.640	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSCLAG00000015776	RAB1B	100	90.640	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	91.960	ENSCSAG00000008145	RAB1B	88	90.452	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	69	99.286	ENSCSAG00000014775	-	97	99.286	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	90.640	ENSCPBG00000022446	RAB1B	100	89.163	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	88.177	ENSCING00000023081	-	99	88.177	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	88.177	ENSCSAVG00000009147	-	99	88.177	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSCANG00000042299	RAB1B	100	90.640	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSCGRG00001014956	Rab1b	100	90.640	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.118	ENSCGRG00000015564	Rab1b	100	90.640	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	92.424	ENSCSEG00000020977	-	98	91.542	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	91.626	ENSCSEG00000018732	rab1ba	100	89.655	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	91.133	ENSCVAG00000022799	-	100	91.133	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	97.980	ENSCVAG00000022585	-	100	95.610	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	90.148	ENSDARG00000056479	rab1bb	100	89.163	Danio_rerio
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	93.103	ENSDARG00000052263	rab1aa	100	91.133	Danio_rerio
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.611	ENSDARG00000058044	rab1ba	100	91.133	Danio_rerio
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	93.627	ENSDARG00000029663	rab1ab	100	93.627	Danio_rerio
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.611	ENSDORG00000002511	Rab1b	100	91.133	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	92.611	ENSEBUG00000015886	-	99	92.611	Eptatretus_burgeri
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ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	98.990	ENSTRUG00000023164	rab1ab	99	98.492	Takifugu_rubripes
ENSSMAG00000017528	rab1ab	78	96.835	ENSTNIG00000004511	-	98	96.835	Tetraodon_nigroviridis
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ENSSMAG00000017528	rab1ab	99	91.919	ENSVVUG00000027023	-	90	90.404	Vulpes_vulpes
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	95.074	ENSXETG00000014011	rab1a	100	95.074	Xenopus_tropicalis
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ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	98.030	ENSXCOG00000013842	rab1ab	100	98.030	Xiphophorus_couchianus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	91.626	ENSXMAG00000022299	rab1ba	100	89.655	Xiphophorus_maculatus
ENSSMAG00000017528	rab1ab	100	98.522	ENSXMAG00000005757	rab1ab	100	98.522	Xiphophorus_maculatus