EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000018046 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 25335 bases
Position: chr12:18790848-18816182
Accession: ZDB-GENE-070706-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000029671	Xpo1	PF08389.12	2.1e-22	1	1
ENSSMAP00000029554	Xpo1	PF08389.12	2.1e-22	1	1
ENSSMAP00000029611	Xpo1	PF08389.12	2.3e-22	1	1
ENSSMAP00000029528	Xpo1	PF08389.12	2.6e-22	1	1
ENSSMAP00000029554	IBN_N	PF03810.19	1.8e-10	1	1
ENSSMAP00000029671	IBN_N	PF03810.19	2.1e-10	1	1
ENSSMAP00000029528	IBN_N	PF03810.19	2.2e-10	1	1
ENSSMAP00000029611	IBN_N	PF03810.19	2.2e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000029891	-	5519	-	ENSSMAP00000029528	974 (aa)	-	-
ENSSMAT00000029975	-	5432	-	ENSSMAP00000029611	945 (aa)	-	-
ENSSMAT00000029918	-	5448	-	ENSSMAP00000029554	1075 (aa)	-	-
ENSSMAT00000030029	-	2775	-	ENSSMAP00000029671	924 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	68.094	ENSSMAG00000010469	si:ch73-182a11.2	99	67.695

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.952	ENSG00000117408	IPO13	99	81.303	Homo_sapiens
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	98.377	ENSAPOG00000003308	ipo13	100	98.543	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	70.433	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	70.062	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.844	ENSAMEG00000001123	IPO13	99	81.197	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	69.937	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	69.979	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	92.424	ENSACIG00000008146	ipo13	100	93.043	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	69.271	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	99	68.847	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	98.052	ENSAOCG00000004943	ipo13	100	98.231	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	98.052	ENSAPEG00000011282	ipo13	100	98.127	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	69.377	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	99	68.951	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	68.677	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	68.650	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	97.944	ENSATEG00000018367	ipo13	100	98.127	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	81.730	ENSAPLG00000001349	IPO13	98	82.203	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	81.385	ENSACAG00000014300	IPO13	99	82.278	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.952	ENSANAG00000034183	IPO13	99	81.551	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	97.619	ENSACLG00000011458	ipo13	100	98.156	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	69.675	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	69.615	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	63.961	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	64.105	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	91.342	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	91.372	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.195	ENSBTAG00000018887	IPO13	99	80.567	Bos_taurus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	81.061	ENSCJAG00000007453	IPO13	99	81.656	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.628	ENSCAFG00000004875	IPO13	99	80.987	Canis_familiaris
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.628	ENSCAFG00020017359	IPO13	99	80.987	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.303	ENSCHIG00000008341	IPO13	99	80.672	Capra_hircus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.952	ENSTSYG00000035980	IPO13	99	81.427	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000018046	ipo13	88	82.340	ENSCAPG00000001972	IPO13	96	82.752	Cavia_aperea
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	80.525	ENSCPOG00000012445	IPO13	98	81.144	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	81.061	ENSCCAG00000022035	IPO13	99	81.551	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.952	ENSCATG00000041276	IPO13	99	81.303	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.628	ENSCLAG00000002914	IPO13	99	80.987	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.952	ENSCSAG00000001190	IPO13	99	81.303	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	81.828	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	82.334	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	37.780	ENSCING00000001863	-	100	38.150	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	36.621	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.516	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.952	ENSCANG00000009091	IPO13	99	81.303	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	79.762	ENSCGRG00001021177	Ipo13	99	80.398	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	79.762	ENSCGRG00000012411	Ipo13	99	80.398	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	63.502	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	99	63.202	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	94.481	ENSCSEG00000007713	ipo13	100	94.485	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	96.861	ENSCVAG00000013039	ipo13	100	96.774	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000018046	ipo13	97	66.445	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	100	65.745	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	90.260	ENSDARG00000060618	ipo13	99	90.861	Danio_rerio
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	66.017	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	66.064	Danio_rerio
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.628	ENSDNOG00000016583	IPO13	99	80.987	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.844	ENSDORG00000005471	Ipo13	99	81.197	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	67.953	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.711	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.628	ENSEASG00005001738	IPO13	99	80.987	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.628	ENSECAG00000015508	IPO13	99	80.987	Equus_caballus
ENSSMAG00000018046	ipo13	68	85.979	ENSEEUG00000011681	IPO13	82	85.979	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	66.278	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	99	66.022	Esox_lucius
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	93.290	ENSELUG00000001498	ipo13	100	93.444	Esox_lucius
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.736	ENSFCAG00000006488	IPO13	99	81.092	Felis_catus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	81.502	ENSFALG00000005368	IPO13	100	82.007	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.519	ENSFDAG00000015599	IPO13	99	81.007	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	68.004	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	99	67.391	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	96.753	ENSFHEG00000023271	ipo13	100	96.774	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	60.338	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	99	60.480	Gadus_morhua
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	94.919	ENSGMOG00000015856	ipo13	99	94.813	Gadus_morhua
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	81.494	ENSGALG00000010087	IPO13	100	81.582	Gallus_gallus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	96.970	ENSGAFG00000006361	ipo13	100	97.086	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	67.793	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	99	67.328	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	95.027	ENSGACG00000014562	ipo13	100	94.824	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	69.524	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	99	69.095	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	81.730	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	82.511	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.952	ENSGGOG00000016375	IPO13	99	81.303	Gorilla_gorilla
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ENSSMAG00000018046	ipo13	99	68.809	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	99	68.388	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.195	ENSHGLG00000001822	IPO13	99	80.818	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.195	ENSHGLG00100015830	IPO13	99	80.818	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	92.316	ENSHCOG00000018408	ipo13	98	94.707	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	63.753	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	63.753	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	89.935	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	89.906	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	59.763	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	100	59.708	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.844	ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.197	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.628	ENSJJAG00000018591	Ipo13	99	81.237	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	97.425	ENSKMAG00000007869	ipo13	100	97.074	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	69.694	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	99	68.983	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	68.078	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	100	67.427	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	95.563	ENSLBEG00000007442	ipo13	100	95.145	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000018046	ipo13	75	31.844	ENSLACG00000002351	TNPO3	81	32.031	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	76.103	ENSLACG00000016657	IPO13	98	76.882	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	84.341	ENSLOCG00000010620	ipo13	99	84.792	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	78.970	ENSLAFG00000017144	IPO13	99	79.476	Loxodonta_africana
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ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.952	ENSMMUG00000015142	IPO13	99	81.303	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.952	ENSMNEG00000041971	IPO13	99	81.303	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	80.952	ENSMLEG00000044330	IPO13	99	81.303	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	97.403	ENSMAMG00000017290	ipo13	100	97.503	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	69.710	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	69.295	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000018046	ipo13	99	69.570	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	99	69.511	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	97.619	ENSMZEG00005019335	ipo13	100	97.815	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000018046	ipo13	100	79.978	ENSMGAG00000009898	IPO13	100	80.724	Meleagris_gallopavo
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