EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000018276 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP 38 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2466 bases
Position: chr1:19781678-19784143
Accession: ZDB-GENE-040718-258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000029810	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000030177	-	810	-	ENSSMAP00000029810	269 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	42.754	ENSG00000152464	RPP38	96	47.531	Homo_sapiens
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	65.234	ENSAPOG00000001240	rpp38	94	65.152	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.478	ENSAMEG00000018832	RPP38	94	43.478	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	70.817	ENSACIG00000011592	rpp38	96	72.075	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	65.314	ENSAOCG00000017293	rpp38	95	65.233	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	68.504	ENSAPEG00000002315	rpp38	95	68.321	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	75.676	ENSATEG00000000731	rpp38	97	75.676	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000018276	rpp38	88	43.548	ENSAPLG00000002054	RPP38	90	43.307	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	69.880	ENSACLG00000016958	rpp38	95	73.152	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	69.880	ENSACLG00000016962	rpp38	95	73.152	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000018276	rpp38	90	44.898	ENSAMXG00000025023	rpp38	92	45.136	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.000	ENSBTAG00000007702	RPP38	94	44.364	Bos_taurus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.074	ENSCAFG00000024373	RPP38	94	44.074	Canis_familiaris
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.074	ENSCAFG00020008008	RPP38	94	44.074	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.000	ENSCHIG00000012484	RPP38	94	45.000	Capra_hircus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	45.520	ENSCPOG00000003981	RPP38	94	45.520	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	45.357	ENSCLAG00000010194	RPP38	94	45.357	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	43.396	ENSCSAG00000019055	RPP38	94	43.636	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.223	ENSCHOG00000004335	RPP38	94	43.223	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	42.491	ENSCGRG00001001395	Rpp38	94	42.857	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	42.491	ENSCGRG00000017441	Rpp38	94	42.857	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	63.745	ENSCSEG00000001721	rpp38	96	64.093	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	61.069	ENSCVAG00000001676	rpp38	95	62.593	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	52.918	ENSDARG00000040350	rpp38	94	52.632	Danio_rerio
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	41.912	ENSDNOG00000040314	RPP38	94	42.599	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.985	ENSDORG00000009783	Rpp38	94	43.985	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.525	ENSETEG00000002839	RPP38	94	43.525	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.649	ENSEASG00005019783	RPP38	93	44.649	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	41.516	ENSEEUG00000014677	RPP38	94	42.807	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	48.582	ENSELUG00000010160	rpp38	96	48.797	Esox_lucius
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.161	ENSFCAG00000022449	RPP38	94	44.161	Felis_catus
ENSSMAG00000018276	rpp38	88	45.200	ENSFALG00000014804	RPP38	88	44.922	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.525	ENSFDAG00000018669	RPP38	94	43.525	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	61.710	ENSFHEG00000013741	rpp38	95	63.043	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000018276	rpp38	88	44.706	ENSGALG00000008794	RPP38	86	44.231	Gallus_gallus
ENSSMAG00000018276	rpp38	55	80.000	ENSGACG00000009258	rpp38	93	80.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	70.281	ENSHBUG00000010937	rpp38	95	73.152	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	46.154	ENSHGLG00000012144	RPP38	94	46.154	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000018276	rpp38	90	45.902	ENSIPUG00000022879	rpp38	94	45.914	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	42.909	ENSSTOG00000025699	RPP38	92	43.636	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.891	ENSJJAG00000007523	Rpp38	94	44.891	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	59.004	ENSKMAG00000003986	rpp38	92	59.851	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	69.057	ENSLBEG00000006853	rpp38	96	69.811	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000018276	rpp38	90	41.045	ENSLACG00000006502	RPP38	92	41.091	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000018276	rpp38	98	43.929	ENSLOCG00000018347	rpp38	97	45.357	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000018276	rpp38	94	42.545	ENSLAFG00000000509	RPP38	94	42.545	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	42.424	ENSMMUG00000007679	RPP38	94	42.701	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000018276	rpp38	94	74.118	ENSMAMG00000012774	rpp38	94	74.902	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	70.683	ENSMZEG00005003189	rpp38	95	73.541	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	69.880	ENSMZEG00005003200	rpp38	95	73.152	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000018276	rpp38	88	44.177	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	43.701	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.956	ENSMAUG00000003644	Rpp38	94	44.322	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	41.091	ENSMOCG00000007020	Rpp38	94	41.091	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000018276	rpp38	94	68.605	ENSMMOG00000003446	rpp38	95	68.605	Mola_mola
ENSSMAG00000018276	rpp38	93	40.377	ENSMODG00000024091	RPP38	95	40.000	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000018276	rpp38	96	69.118	ENSMALG00000002356	rpp38	97	69.118	Monopterus_albus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.444	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	43.682	Mus_caroli
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.333	ENSMUSG00000049950	Rpp38	94	42.446	Mus_musculus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.796	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	44.245	Mus_pahari
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.866	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	43.116	Mus_spretus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.369	ENSMPUG00000018523	RPP38	95	43.369	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000018276	rpp38	73	48.780	ENSMLUG00000002153	RPP38	94	42.391	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	45.161	ENSNGAG00000011066	Rpp38	94	45.520	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	70.400	ENSNBRG00000006994	rpp38	96	73.643	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	71.600	ENSONIG00000020467	rpp38	94	73.643	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000018276	rpp38	93	44.485	ENSOCUG00000022768	-	94	44.803	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000018276	rpp38	93	44.853	ENSOCUG00000024367	-	94	45.161	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	65.476	ENSORLG00000009219	rpp38	94	65.504	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	63.878	ENSORLG00020011503	rpp38	93	63.469	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	63.498	ENSORLG00015017702	rpp38	93	64.312	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000018276	rpp38	90	65.737	ENSOMEG00000005414	rpp38	97	64.945	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.273	ENSOGAG00000008059	RPP38	94	43.416	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.000	ENSOARG00000004534	RPP38	94	44.000	Ovis_aries
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.116	ENSPPAG00000041577	RPP38	86	43.116	Pan_paniscus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.161	ENSPPRG00000015329	RPP38	94	44.526	Panthera_pardus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.750	ENSPTIG00000007188	RPP38	94	44.161	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.116	ENSPTRG00000002318	RPP38	86	43.116	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000018276	rpp38	92	46.947	ENSPKIG00000025652	rpp38	92	46.992	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000018276	rpp38	96	40.357	ENSPSIG00000001527	RPP38	95	40.357	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.727	ENSPEMG00000008375	Rpp38	94	45.091	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.161	ENSPCIG00000009096	RPP38	90	44.161	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000018276	rpp38	74	59.903	ENSPFOG00000016823	rpp38	99	59.903	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000018276	rpp38	94	57.836	ENSPLAG00000007626	rpp38	95	58.209	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	52.157	ENSPMEG00000020392	rpp38	92	53.101	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000018276	rpp38	93	59.623	ENSPREG00000017744	rpp38	95	60.000	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.116	ENSPPYG00000002113	RPP38	94	43.116	Pongo_abelii
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	43.774	ENSPVAG00000007155	RPP38	94	44.000	Pteropus_vampyrus
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	70.281	ENSPNYG00000004293	rpp38	95	73.152	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000018276	rpp38	90	49.590	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	49.416	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	45.660	ENSRNOG00000038025	Rpp38	94	45.660	Rattus_norvegicus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	41.577	ENSSHAG00000015529	RPP38	95	41.971	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	74.400	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	75.385	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	74.206	ENSSLDG00000014355	rpp38	96	74.809	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000018276	rpp38	98	39.259	ENSSARG00000012099	RPP38	96	39.259	Sorex_araneus
ENSSMAG00000018276	rpp38	92	41.221	ENSSPUG00000008560	-	92	41.221	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	45.769	ENSSPUG00000018363	-	90	45.769	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	45.736	ENSSPUG00000005237	-	90	45.736	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000018276	rpp38	91	64.800	ENSSPAG00000020387	rpp38	94	64.729	Stegastes_partitus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	42.908	ENSSSCG00000027110	RPP38	94	42.908	Sus_scrofa
ENSSMAG00000018276	rpp38	88	44.314	ENSTGUG00000001366	RPP38	90	44.061	Taeniopygia_guttata
ENSSMAG00000018276	rpp38	94	63.258	ENSTNIG00000001334	rpp38	96	63.258	Tetraodon_nigroviridis
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.369	ENSTTRG00000004420	RPP38	94	43.369	Tursiops_truncatus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	45.818	ENSUAMG00000002618	RPP38	94	45.818	Ursus_americanus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.885	ENSUMAG00000012382	RPP38	94	44.245	Ursus_maritimus
ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.815	ENSVVUG00000005272	RPP38	94	44.815	Vulpes_vulpes
ENSSMAG00000018276	rpp38	93	41.199	ENSXETG00000003419	rpp38	97	41.304	Xenopus_tropicalis