EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000018824 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17668 bases
Position: chr9:1575237-1592904
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000030722	RRM_1	PF00076.22	4.5e-28	1	2
ENSSMAP00000030722	RRM_1	PF00076.22	4.5e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000031100	MSI1-201	918	-	ENSSMAP00000030722	305 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000018824	MSI1	52	37.736	ENSSMAG00000010246	-	85	38.202
ENSSMAG00000018824	MSI1	52	45.912	ENSSMAG00000003760	hnrnpaba	91	45.333
ENSSMAG00000018824	MSI1	56	38.323	ENSSMAG00000015218	hnrnpa3	63	35.227
ENSSMAG00000018824	MSI1	96	33.013	ENSSMAG00000021047	dazap1	84	33.013
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	72.785	ENSSMAG00000018484	msi2a	100	72.785
ENSSMAG00000018824	MSI1	51	35.484	ENSSMAG00000016401	tardbp	55	34.868
ENSSMAG00000018824	MSI1	52	45.806	ENSSMAG00000009686	hnrnpd	71	45.783
ENSSMAG00000018824	MSI1	59	37.640	ENSSMAG00000004641	hnrnpa1a	72	37.019
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	85.878	ENSSMAG00000009156	-	71	85.878
ENSSMAG00000018824	MSI1	52	35.443	ENSSMAG00000010279	-	91	35.443

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.763	ENSG00000135097	MSI1	99	87.931	Homo_sapiens
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	91.973	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	87.025	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	92.722	ENSAPOG00000023458	-	94	92.722	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	69.061	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	69.061	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000018824	MSI1	94	92.708	ENSACIG00000017754	-	78	89.865	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	91.973	ENSAOCG00000009031	-	95	91.973	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	87.025	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	87.025	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	87.025	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	87.025	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	92.722	ENSAPEG00000006857	-	79	92.722	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	85.938	ENSATEG00000023779	-	90	85.938	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	98.990	ENSATEG00000017059	MSI1	100	90.419	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	82.569	ENSACAG00000002762	MSI1	99	82.569	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000018824	MSI1	92	72.848	ENSANAG00000027901	-	100	72.848	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000018824	MSI1	99	81.081	ENSANAG00000027151	MSI1	98	81.763	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	92.722	ENSACLG00000000117	-	100	92.722	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	88.000	ENSACLG00000011230	MSI1	94	87.975	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	93.603	ENSAMXG00000038960	msi1	75	93.603	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	86.774	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	86.774	Bos_taurus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	86.774	ENSCJAG00000008578	MSI1	98	81.763	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.459	ENSCAFG00000010283	MSI1	98	81.459	Canis_familiaris
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	82.637	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	82.637	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.024	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	81.024	Capra_hircus
ENSSMAG00000018824	MSI1	99	80.838	ENSTSYG00000033949	MSI1	97	80.838	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	73.482	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	73.482	Cavia_aperea
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.763	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	81.763	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.763	ENSCCAG00000035567	MSI1	98	81.763	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	84.013	ENSCATG00000030019	MSI1	98	84.013	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.763	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	81.763	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000018824	MSI1	70	90.566	ENSCSAG00000002265	MSI1	77	90.566	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	90.301	ENSCPBG00000011349	MSI1	98	84.906	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	82.012	ENSCANG00000040651	MSI1	100	82.012	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.763	ENSCGRG00001018883	Msi1	98	81.763	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	81.515	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	81.515	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	87.025	ENSCSEG00000005834	-	94	87.025	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	89.697	ENSCSEG00000008352	-	100	89.697	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	93.603	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	93.603	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	98.653	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	98.653	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000018824	MSI1	65	67.431	ENSCVAG00000017463	-	89	67.431	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	95.270	ENSDARG00000010710	msi1	99	95.270	Danio_rerio
ENSSMAG00000018824	MSI1	85	84.259	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	91	84.259	Danio_rerio
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	78.549	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	78.549	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	81.515	ENSDORG00000005610	Msi1	94	81.515	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	78.963	ENSETEG00000004756	MSI1	100	78.659	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	86.774	ENSEASG00005004736	MSI1	98	86.774	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	86.774	ENSECAG00000017526	MSI1	98	81.763	Equus_caballus
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	85.942	ENSELUG00000023280	-	100	86.452	Esox_lucius
ENSSMAG00000018824	MSI1	94	88.562	ENSELUG00000023219	MSI1	92	84.524	Esox_lucius
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	86.774	ENSFCAG00000011007	MSI1	98	81.763	Felis_catus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	85.667	ENSFALG00000007574	MSI1	100	85.667	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.707	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	81.707	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	87.578	ENSFHEG00000003560	-	100	87.578	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	94.684	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	92.405	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	89.557	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	89.241	Gadus_morhua
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	76.636	ENSGMOG00000017838	-	90	76.636	Gadus_morhua
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	84.733	ENSGALG00000007227	MSI1	96	76.106	Gallus_gallus
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	85.266	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	85.266	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	81.395	ENSGAFG00000005860	-	90	81.395	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	77.644	ENSGACG00000008674	-	100	73.407	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	88.485	ENSGACG00000012679	MSI1	100	88.485	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	90.301	ENSGAGG00000016037	MSI1	94	90.301	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	82.484	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	82.484	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	87.975	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	87.975	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	86.246	ENSHBUG00000011841	-	100	86.246	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.459	ENSHGLG00000012782	MSI1	98	81.459	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.707	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	81.707	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	90.236	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	90.236	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	96.633	ENSHCOG00000012067	-	89	96.633	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	91.803	ENSIPUG00000001976	msi1	100	91.803	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	82.637	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	82.637	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	74.194	ENSJJAG00000010643	-	94	74.194	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	83.025	ENSJJAG00000010463	Msi1	98	83.025	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	84.814	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	84.814	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	91.333	ENSKMAG00000019877	-	100	92.256	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	92.000	ENSLBEG00000001375	-	94	87.342	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	90.909	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	90.909	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	82.121	ENSLACG00000018287	MSI1	100	82.875	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	77.049	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	77.049	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.763	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	81.763	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.763	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	81.763	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	86.774	ENSMNEG00000040034	MSI1	98	86.774	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	82.012	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	82.012	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	91.919	ENSMAMG00000018426	-	95	91.919	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	85.387	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	85.387	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	91.212	ENSMZEG00005000340	-	100	91.212	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	87.975	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	87.975	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000018824	MSI1	67	93.491	ENSMGAG00000016518	-	100	93.491	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000018824	MSI1	70	90.566	ENSMAUG00000016820	Msi1	92	90.566	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	82.716	ENSMICG00000033181	MSI1	98	82.716	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.459	ENSMOCG00000002286	Msi1	98	81.459	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	90.236	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	90.236	Mola_mola
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	91.586	ENSMMOG00000012265	-	100	91.586	Mola_mola
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	57.229	ENSMODG00000003189	-	100	57.229	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	95.752	ENSMALG00000017889	MSI1	95	95.752	Monopterus_albus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	91.582	ENSMALG00000001426	-	100	91.582	Monopterus_albus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.459	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	99	89.015	Mus_caroli
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	84.277	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	89.015	Mus_musculus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	83.962	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	99	88.636	Mus_pahari
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.459	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	99	89.015	Mus_spretus
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	82.637	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	82.637	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	73.214	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	73.214	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000018824	MSI1	98	81.515	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	81.515	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000018824	MSI1	95	78.279	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	78.279	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000018824	MSI1	100	91.212	ENSNBRG00000000841	-	100	91.212	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	72.561	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	72.561	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000018824	MSI1	97	61.585	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	61.585	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000018824	MSI1	93	74.921	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	74.921	Ochotona_princeps
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