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Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000018908 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: aco1
Alias: IRP1|wu:fo75b03
Full Name: aconitase 1%2C soluble
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13404 bases
Position: chr4:29619346-29632749
Accession: ZDB-GENE-031118-76
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000030881	Aconitase	PF00330.20	1.3e-120	1	1
ENSSMAP00000030881	Aconitase_C	PF00694.19	3.3e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000031259	-	2505	-	ENSSMAP00000030881	834 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000018908	aco1	80	61.145	ENSSMAG00000005657	ireb2	75	61.377

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.284	ENSG00000122729	ACO1	75	83.284	Homo_sapiens
ENSSMAG00000018908	aco1	80	91.654	ENSAPOG00000008670	aco1	75	91.654	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.208	ENSAMEG00000003746	ACO1	75	83.308	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000018908	aco1	80	89.955	ENSACIG00000014377	aco1	75	90.015	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	91.754	ENSAOCG00000007699	aco1	75	91.803	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000018908	aco1	80	91.604	ENSAPEG00000014370	aco1	75	91.654	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000018908	aco1	80	91.754	ENSATEG00000000560	aco1	75	91.803	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000018908	aco1	81	81.009	ENSAPLG00000015490	ACO1	75	81.614	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000018908	aco1	76	81.476	ENSACAG00000001541	ACO1	74	81.591	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.661	ENSANAG00000003359	ACO1	75	82.661	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000018908	aco1	80	89.955	ENSACLG00000007755	aco1	75	90.015	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000018908	aco1	80	86.057	ENSAMXG00000002499	aco1	75	86.140	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.033	ENSBTAG00000000555	ACO1	75	83.134	Bos_taurus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.583	ENSCJAG00000007687	ACO1	75	82.687	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.635	ENSCAFG00000001786	ACO1	75	82.738	Canis_familiaris
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.883	ENSCAFG00020014553	ACO1	75	82.985	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.033	ENSCHIG00000007667	ACO1	75	83.134	Capra_hircus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.883	ENSTSYG00000004179	ACO1	75	82.985	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000018908	aco1	75	69.329	ENSCAPG00000007254	ACO1	71	69.329	Cavia_aperea
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.836	ENSCPOG00000003768	ACO1	75	82.836	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.033	ENSCCAG00000022465	ACO1	75	83.134	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.134	ENSCATG00000045333	ACO1	75	83.134	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.282	ENSCLAG00000002487	ACO1	75	82.388	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.985	ENSCSAG00000009824	ACO1	75	82.985	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	66.368	ENSCHOG00000008996	ACO1	75	66.368	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000018908	aco1	80	81.805	ENSCPBG00000008077	ACO1	75	81.913	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.985	ENSCANG00000014847	ACO1	75	82.985	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.483	ENSCGRG00001024337	Aco1	75	83.582	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.583	ENSCGRG00000004877	-	75	82.687	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000018908	aco1	80	86.357	ENSCSEG00000018262	aco1	75	86.438	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000018908	aco1	80	81.259	ENSCVAG00000020264	aco1	74	81.371	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	85.907	ENSDARG00000026376	aco1	75	85.991	Danio_rerio
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.333	ENSDNOG00000003951	ACO1	75	83.433	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	84.030	ENSDORG00000014246	Aco1	75	84.030	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000018908	aco1	65	68.732	ENSETEG00000012415	-	60	68.732	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000018908	aco1	80	62.462	ENSEBUG00000015441	aco1	69	62.462	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.883	ENSEASG00005004602	ACO1	75	82.985	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.733	ENSECAG00000014846	ACO1	75	82.836	Equus_caballus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	68.468	ENSEEUG00000015174	ACO1	75	68.657	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	85.907	ENSELUG00000016812	aco1	73	85.991	Esox_lucius
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.432	ENSFCAG00000001293	ACO1	75	82.537	Felis_catus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.105	ENSFALG00000001167	ACO1	75	82.212	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.883	ENSFDAG00000016058	ACO1	75	82.985	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000018908	aco1	80	89.805	ENSFHEG00000005619	aco1	75	89.866	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	87.820	ENSGMOG00000005514	aco1	75	87.892	Gadus_morhua
ENSSMAG00000018908	aco1	80	81.654	ENSGALG00000002162	ACO1	75	81.764	Gallus_gallus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	89.055	ENSGACG00000001637	aco1	75	89.121	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.105	ENSGAGG00000023315	ACO1	75	82.212	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.134	ENSGGOG00000016306	ACO1	75	83.134	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000018908	aco1	80	89.955	ENSHBUG00000008952	aco1	75	90.015	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.333	ENSHGLG00000018922	Aco1	75	83.433	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.333	ENSHGLG00100000149	Aco1	75	83.433	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000018908	aco1	80	86.807	ENSHCOG00000015881	aco1	75	86.885	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000018908	aco1	80	85.457	ENSIPUG00000020088	ACO1	75	85.544	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.910	ENSSTOG00000006942	ACO1	75	83.881	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.183	ENSJJAG00000013824	Aco1	75	83.284	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	89.955	ENSKMAG00000015759	aco1	75	90.015	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	90.269	ENSLBEG00000013866	aco1	75	90.327	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000018908	aco1	80	70.772	ENSLACG00000000936	ACO1	99	70.920	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.432	ENSLOCG00000011082	aco1	75	82.537	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.239	ENSLAFG00000013470	ACO1	75	82.239	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.284	ENSMFAG00000001702	ACO1	75	83.284	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.433	ENSMMUG00000008196	ACO1	75	83.433	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.284	ENSMNEG00000045040	ACO1	75	83.284	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.284	ENSMLEG00000005636	ACO1	75	83.284	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	93.253	ENSMAMG00000002915	aco1	75	93.294	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000018908	aco1	78	87.805	ENSMZEG00005012733	aco1	74	87.805	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000018908	aco1	80	62.150	ENSMGAG00000008851	ACO1	75	62.372	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.033	ENSMAUG00000021408	Aco1	75	83.134	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	81.682	ENSMICG00000006540	ACO1	75	81.791	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.483	ENSMOCG00000015393	Aco1	75	83.582	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000018908	aco1	80	91.004	ENSMMOG00000020282	aco1	75	91.058	Mola_mola
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.282	ENSMODG00000004463	ACO1	75	82.388	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000018908	aco1	80	91.754	ENSMALG00000019764	aco1	75	91.803	Monopterus_albus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.483	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	75	83.582	Mus_caroli
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.634	ENSMUSG00000028405	Aco1	75	83.731	Mus_musculus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.333	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	75	83.433	Mus_pahari
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.634	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	75	83.731	Mus_spretus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.333	ENSMPUG00000004340	ACO1	75	83.433	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000018908	aco1	80	80.631	ENSMLUG00000003029	ACO1	75	80.746	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.033	ENSNGAG00000005703	Aco1	75	83.134	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000018908	aco1	81	74.594	ENSNBRG00000008973	aco1	78	74.594	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.985	ENSNLEG00000003409	ACO1	75	82.985	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000018908	aco1	68	84.211	ENSMEUG00000014756	ACO1	65	84.672	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000018908	aco1	80	78.209	ENSOPRG00000016791	ACO1	75	78.209	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000018908	aco1	80	80.030	ENSODEG00000001240	-	75	80.149	Octodon_degus
ENSSMAG00000018908	aco1	84	78.429	ENSODEG00000015432	-	81	78.429	Octodon_degus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	90.255	ENSONIG00000019869	aco1	75	90.313	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.333	ENSOANG00000012132	ACO1	93	83.433	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	84.203	ENSOCUG00000015960	ACO1	75	84.203	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	90.255	ENSORLG00000020656	aco1	75	90.313	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000018908	aco1	80	89.955	ENSORLG00020010991	aco1	75	90.015	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000018908	aco1	80	89.955	ENSORLG00015011785	aco1	75	90.015	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000018908	aco1	80	88.253	ENSOMEG00000000660	aco1	75	88.323	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.985	ENSOGAG00000010522	ACO1	75	82.985	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.033	ENSOARG00000014707	ACO1	74	83.134	Ovis_aries
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.284	ENSPPAG00000033498	ACO1	75	83.284	Pan_paniscus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.432	ENSPPRG00000009875	ACO1	75	82.537	Panthera_pardus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.282	ENSPTIG00000016606	ACO1	74	82.388	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.284	ENSPTRG00000020843	ACO1	75	83.284	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.284	ENSPANG00000025270	ACO1	75	83.284	Papio_anubis
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.733	ENSPKIG00000023168	aco1	75	82.712	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.406	ENSPSIG00000008030	ACO1	75	82.511	Pelodiscus_sinensis
ENSSMAG00000018908	aco1	80	89.205	ENSPMGG00000020708	aco1	75	89.270	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.483	ENSPEMG00000018464	Aco1	75	83.582	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000018908	aco1	80	81.627	ENSPCIG00000029321	ACO1	81	81.737	Phascolarctos_cinereus
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ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.309	ENSPVAG00000002372	ACO1	77	82.309	Pteropus_vampyrus
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