EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000019912 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11282 bases
Position: chr21:7058276-7069557
Accession: ZDB-GENE-041014-307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000032486	IBN_N	PF03810.19	8e-14	1	1
ENSSMAP00000032508	IBN_N	PF03810.19	8e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000032912	-	4857	-	ENSSMAP00000032508	1089 (aa)	-	A0A2U9CW55
ENSSMAT00000032888	-	4920	-	ENSSMAP00000032486	1089 (aa)	-	A0A2U9CW55

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.805	ENSG00000196497	IPO4	99	44.485	Homo_sapiens
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	81.910	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	81.910	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.199	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	44.015	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	81.210	ENSACIG00000004246	ipo4	100	81.210	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	85.348	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	85.348	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	85.623	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	85.623	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000019912	ipo4	92	88.534	ENSATEG00000017082	ipo4	99	88.856	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000019912	ipo4	84	46.328	ENSACAG00000003973	-	97	45.940	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.620	ENSANAG00000037973	IPO4	99	44.393	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	80.992	ENSACLG00000019742	ipo4	100	81.267	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	71.625	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	71.442	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.291	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.107	Bos_taurus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.083	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	44.761	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.539	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	45.212	Canis_familiaris
ENSSMAG00000019912	ipo4	98	45.042	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.022	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.610	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	44.475	Capra_hircus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.517	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	44.107	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.936	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	44.659	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.898	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	44.761	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.083	ENSCATG00000040395	IPO4	99	44.761	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.120	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.936	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000019912	ipo4	90	45.740	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	42.259	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000019912	ipo4	92	36.531	ENSCING00000008639	-	99	36.249	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000019912	ipo4	92	36.961	ENSCSAVG00000011482	-	98	37.132	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.991	ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.669	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	43.606	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	43.698	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	43.606	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	43.698	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	81.485	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	81.027	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	74.931	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	75.023	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	76.125	ENSDARG00000041493	ipo4	100	76.400	Danio_rerio
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.120	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	44.936	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.796	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	44.475	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000019912	ipo4	97	30.876	FBgn0042178	CG32165	96	30.762	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000019912	ipo4	97	31.273	FBgn0042177	CG32164	96	31.105	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	43.853	ENSETEG00000018381	IPO4	99	43.578	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000019912	ipo4	90	46.559	ENSEASG00005011954	IPO4	96	46.255	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.304	ENSECAG00000009909	IPO4	99	45.028	Equus_caballus
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	75.619	ENSELUG00000020628	ipo4	100	75.228	Esox_lucius
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.304	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	44.936	Felis_catus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	41.005	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	40.731	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000019912	ipo4	89	82.585	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	81.208	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	80.000	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	79.490	Gadus_morhua
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	80.109	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	80.421	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	82.920	ENSGACG00000002276	ipo4	99	82.828	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.805	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	44.485	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	81.726	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	82.002	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.751	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	44.567	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.475	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	44.291	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	79.747	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	79.457	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	74.656	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	74.564	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.488	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	45.120	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.940	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	44.618	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	81.760	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	81.760	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	84.848	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	84.848	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	50.846	ENSLACG00000001428	IPO4	100	50.846	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000019912	ipo4	79	69.133	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	68.112	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.078	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	44.659	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.083	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	44.761	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.083	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	44.761	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.176	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	44.853	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.083	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	44.761	Mandrillus_leucophaeus
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ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.659	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	44.475	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.167	ENSMICG00000001719	IPO4	99	44.843	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.145	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	44.066	Microtus_ochrogaster
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ENSSMAG00000019912	ipo4	99	42.818	ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.726	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	82.951	ENSMALG00000001587	ipo4	100	83.043	Monopterus_albus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	43.606	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	45.823	Mus_caroli
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ENSSMAG00000019912	ipo4	99	43.370	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	45.668	Mus_pahari
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	43.606	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	45.577	Mus_spretus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.672	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	45.488	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.291	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	44.107	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.567	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	44.199	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	85.321	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	85.308	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.221	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	45.037	Ochotona_princeps
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ENSSMAG00000019912	ipo4	100	85.583	ENSONIG00000014574	ipo4	100	85.399	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.628	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	44.444	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	82.222	ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.325	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	82.222	ENSORLG00020004286	ipo4	100	79.541	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	82.222	ENSORLG00015021856	ipo4	100	79.541	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	78.108	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	77.555	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.331	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	44.015	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000019912	ipo4	98	44.030	ENSOARG00000019188	IPO4	99	43.843	Ovis_aries
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.249	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	44.485	Pan_paniscus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.488	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	45.120	Panthera_pardus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.396	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	45.028	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.620	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	44.393	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.176	ENSPANG00000026278	IPO4	99	44.853	Papio_anubis
ENSSMAG00000019912	ipo4	100	68.161	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	68.618	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	70.101	ENSPKIG00000007683	-	99	69.825	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	73.901	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	73.273	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	43.146	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	43.238	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000019912	ipo4	93	46.033	ENSPCIG00000010718	IPO4	96	46.131	Phascolarctos_cinereus
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ENSSMAG00000019912	ipo4	100	80.091	ENSPREG00000017605	ipo4	100	80.403	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.805	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	44.577	Pongo_abelii
ENSSMAG00000019912	ipo4	99	46.004	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.856	Procavia_capensis
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ENSSMAG00000019912	ipo4	99	45.138	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	45.229	Sarcophilus_harrisii
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