EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000020185 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: SKI2 homolog%2C superkiller viralicidic activity 2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13349 bases
Position: chr22:3714471-3727819
Accession: ZDB-GENE-010430-5
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000032996	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3.2e-27	1	1
ENSSMAP00000033025	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3.2e-27	1	1
ENSSMAP00000033060	rRNA_proc-arch	PF13234.6	9.7e-18	1	1
ENSSMAP00000033044	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.3e-12	1	1
ENSSMAP00000032996	DEAD	PF00270.29	2.9e-16	1	1
ENSSMAP00000033025	DEAD	PF00270.29	3e-16	1	1
ENSSMAP00000033060	DEAD	PF00270.29	3.3e-16	1	1
ENSSMAP00000033044	DEAD	PF00270.29	3.8e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000033456	-	4029	-	ENSSMAP00000033044	1315 (aa)	-	-
ENSSMAT00000033408	-	5135	-	ENSSMAP00000032996	1235 (aa)	-	-
ENSSMAT00000033472	-	3540	-	ENSSMAP00000033060	1179 (aa)	-	-
ENSSMAT00000033437	-	4755	-	ENSSMAP00000033025	1246 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSMAG00000020185's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSMAG00000020185's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000020185	skiv2l	80	35.265	ENSSMAG00000007572	mtrex	94	35.079

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.995	ENSG00000204351	SKIV2L	99	60.974	Homo_sapiens
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	90.128	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	90.128	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.594	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.654	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	87.368	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	87.368	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	90.610	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	90.610	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	90.445	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	90.369	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	91.172	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	91.172	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	62.648	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	62.934	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.427	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	61.213	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	89.636	ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.567	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	81.695	ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.775	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.594	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	60.734	Bos_taurus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	96	40.511	WBGene00008502	skih-2	99	40.398	Caenorhabditis_elegans
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.347	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.155	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.514	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	60.734	Canis_familiaris
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.514	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	60.734	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.594	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	60.734	Capra_hircus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.273	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	60.495	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.452	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	60.499	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.156	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	61.133	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.786	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	60.671	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.835	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.800	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.236	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	60.974	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	90	59.825	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	99	59.763	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000020185	skiv2l	94	50.085	ENSCING00000005576	-	99	50.298	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.946	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	60.175	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.415	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	60.929	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	87.955	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	87.955	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	88.259	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	89.452	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	83.480	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	83.240	Danio_rerio
ENSSMAG00000020185	skiv2l	92	64.767	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	93	65.019	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	94	44.833	FBgn0039117	tst	97	44.737	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000020185	skiv2l	69	69.048	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	69.048	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000020185	skiv2l	91	55.774	ENSEBUG00000013680	-	98	55.119	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000020185	skiv2l	93	61.880	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	62.308	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	94	60.593	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	60.819	Equus_caballus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	51	74.308	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	56	74.308	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	85.703	ENSELUG00000000181	skiv2l	100	85.463	Esox_lucius
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.915	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	60.894	Felis_catus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	59.503	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.697	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	88.583	ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	88.523	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	82.616	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	82.616	Gadus_morhua
ENSSMAG00000020185	skiv2l	77	57.143	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.907	Gallus_gallus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	88.988	ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	88.925	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	89.129	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	89.185	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.075	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	61.053	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	89.798	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	89.727	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.897	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	60.956	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	59.215	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	59.283	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	81.974	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	81.974	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	81.360	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	81.707	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	61.120	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.053	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	57	63.265	ENSLACG00000002986	-	60	63.265	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.026	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.845	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.107	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	60.911	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.107	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	60.942	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.107	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.894	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.786	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	60.671	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	91.011	ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	91.011	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	89.717	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	89.647	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000020185	skiv2l	61	69.444	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	85	69.444	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.111	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.929	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.674	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	61.005	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	59.566	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.360	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	85.587	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	85.587	Mola_mola
ENSSMAG00000020185	skiv2l	95	66.149	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.293	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	83.814	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.814	Monopterus_albus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.285	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	60.960	Mus_caroli
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.013	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	61.040	Mus_musculus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.254	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	61.280	Mus_pahari
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.013	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	61.040	Mus_spretus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.161	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	60.575	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.674	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	60.176	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	86.235	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	86.235	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.467	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.319	Nomascus_leucogenys
ENSSMAG00000020185	skiv2l	67	78.330	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	70	72.222	Notamacropus_eugenii
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.835	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.814	Ochotona_princeps
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.915	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	60.814	Octodon_degus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	89.960	ENSONIG00000013500	skiv2l	100	89.888	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.156	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	61.133	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	88.061	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	88.061	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	87.901	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	87.901	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	87.981	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	87.981	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	87.773	ENSOMEG00000008531	skiv2l	100	87.721	Oryzias_melastigma
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.849	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	60.510	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	57.143	ENSOARG00000002411	-	99	57.299	Ovis_aries
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.415	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	60.348	Pan_paniscus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.915	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	61.213	Panthera_pardus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.514	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.814	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.995	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	60.974	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	59.936	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	59.778	Papio_anubis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	78.600	ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.600	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	85.251	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	85.266	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.691	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	60.689	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	60.814	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	60.974	Phascolarctos_cinereus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	88.502	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	88.443	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	88.340	ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	88.283	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	88.664	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	88.604	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	82.508	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	82.915	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.594	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.575	Pongo_abelii
ENSSMAG00000020185	skiv2l	77	65.306	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	76	65.306	Procavia_capensis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.754	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	61.085	Propithecus_coquereli
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.995	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	60.734	Pteropus_vampyrus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	95	89.333	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	89.333	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	84.010	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	83.734	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.254	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	60.880	Rattus_norvegicus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	59.761	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	100	58.716	Rhinopithecus_bieti
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.946	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	60.831	Rhinopithecus_roxellana
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	38.817	YLR398C	-	96	38.702	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.427	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.213	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	95	65.839	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.588	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	81.006	ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.006	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	91.822	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	91.814	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	84.304	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	84.304	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	60.171	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	60.234	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	95	91.275	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	91.102	Stegastes_partitus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	61.053	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.133	Sus_scrofa
ENSSMAG00000020185	skiv2l	71	85.561	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	69.711	Takifugu_rubripes
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	83.693	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	83.693	Tetraodon_nigroviridis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	94	63.067	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.067	Tupaia_belangeri
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	56.742	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.903	Tursiops_truncatus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.754	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.814	Ursus_americanus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	93	61.880	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	61.966	Ursus_maritimus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.514	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	60.734	Vulpes_vulpes
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	58.824	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.725	Xenopus_tropicalis
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	87.287	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	87.287	Xiphophorus_couchianus
ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	88.340	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	88.202	Xiphophorus_maculatus