EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000020514 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 44136 bases
Position: chr3:5632711-5676846
Accession: ZDB-GENE-060929-688
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000033530	Wyosine_form	PF08608.12	1.2e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000033955	-	5678	-	ENSSMAP00000033530	745 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.432	ENSG00000198874	TYW1	98	66.850	Homo_sapiens
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	57.300	ENSG00000277149	TYW1B	98	58.897	Homo_sapiens
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	82.933	ENSAPOG00000014391	tyw1	98	85.598	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	81.755	ENSACIG00000007325	tyw1	100	81.969	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	83.755	ENSAOCG00000016792	tyw1	98	86.024	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	83.888	ENSAPEG00000015939	tyw1	98	86.160	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000020514	tyw1	90	84.435	ENSATEG00000006856	tyw1	92	85.307	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.612	ENSANAG00000037051	-	98	65.612	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	82.933	ENSACLG00000018688	tyw1	98	83.604	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	74.548	ENSAMXG00000004157	tyw1	98	75.939	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	67.080	ENSBTAG00000008446	TYW1	98	66.804	Bos_taurus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.253	ENSCJAG00000004295	-	98	65.663	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	67.220	ENSCAFG00000010867	-	98	67.729	Canis_familiaris
ENSSMAG00000020514	tyw1	92	63.411	ENSCAFG00020005367	-	98	63.942	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.942	ENSCHIG00000019510	-	98	66.942	Capra_hircus
ENSSMAG00000020514	tyw1	86	65.649	ENSTSYG00000008236	-	98	65.649	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000020514	tyw1	85	63.183	ENSCAPG00000013569	-	100	64.174	Cavia_aperea
ENSSMAG00000020514	tyw1	95	64.560	ENSCPOG00000011182	-	99	64.529	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.071	ENSCCAG00000026643	-	98	66.437	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.158	ENSCATG00000043677	-	98	66.896	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	63.661	ENSCLAG00000006321	-	99	64.595	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000020514	tyw1	94	65.333	ENSCSAG00000018274	-	98	67.057	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	65.796	ENSCPBG00000014896	-	97	66.937	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000020514	tyw1	79	58.814	ENSCING00000004125	-	97	59.492	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000020514	tyw1	80	52.912	ENSCSAVG00000005712	-	100	56.549	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.021	ENSCANG00000033209	-	98	66.437	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000020514	tyw1	69	75.510	ENSCGRG00001003679	Tyw1	91	74.292	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000020514	tyw1	99	80.645	ENSCSEG00000005810	tyw1	96	82.520	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000020514	tyw1	90	79.142	ENSCVAG00000001054	tyw1	94	80.271	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	71.638	ENSDARG00000062987	tyw1	95	75.623	Danio_rerio
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.897	ENSDNOG00000024165	-	98	66.897	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000020514	tyw1	83	62.400	ENSDORG00000014772	Tyw1	91	62.720	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000020514	tyw1	51	48.819	ENSETEG00000009904	-	84	48.819	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000020514	tyw1	57	71.759	ENSEBUG00000004494	tyw1	91	71.759	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.162	ENSEASG00005008818	-	99	66.942	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	61.846	ENSECAG00000023164	-	99	62.121	Equus_caballus
ENSSMAG00000020514	tyw1	60	80.208	ENSEEUG00000005950	-	60	80.208	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000020514	tyw1	99	74.565	ENSELUG00000008449	tyw1	98	73.445	Esox_lucius
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.620	ENSFCAG00000014262	-	98	66.620	Felis_catus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	63.049	ENSFALG00000013810	-	99	63.549	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	63.624	ENSFDAG00000013270	-	98	64.917	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000020514	tyw1	81	81.107	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	81.107	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000020514	tyw1	97	64.324	ENSGALG00000001110	-	99	65.000	Gallus_gallus
ENSSMAG00000020514	tyw1	97	80.518	ENSGACG00000012692	tyw1	99	80.518	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.940	ENSGAGG00000022393	-	98	67.215	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000020514	tyw1	86	57.470	ENSGGOG00000001473	TYW1	98	59.174	Gorilla_gorilla
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	82.667	ENSHBUG00000002640	tyw1	98	83.333	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000020514	tyw1	86	67.033	ENSHGLG00000012093	-	100	67.033	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	64.414	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	64.876	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	66.801	ENSHCOG00000019949	tyw1	97	68.100	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000020514	tyw1	99	71.867	ENSIPUG00000016330	tyw1	96	74.616	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	64.601	ENSSTOG00000004067	-	90	64.876	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000020514	tyw1	95	64.714	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	65.055	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	80.933	ENSKMAG00000018599	tyw1	98	81.769	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	63.399	ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.075	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	72.192	ENSLOCG00000004035	tyw1	95	72.192	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.432	ENSMFAG00000035457	-	98	67.170	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.432	ENSMMUG00000030374	-	98	67.170	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.295	ENSMNEG00000041992	-	98	67.033	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.295	ENSMLEG00000039741	-	98	67.033	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000020514	tyw1	98	84.898	ENSMAMG00000016089	tyw1	97	84.939	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000020514	tyw1	91	84.897	ENSMZEG00005024386	tyw1	99	84.897	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	64.649	ENSMGAG00000002176	-	98	65.337	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.207	ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.158	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.850	ENSMICG00000014374	-	99	66.850	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.110	ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	65.928	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000020514	tyw1	97	78.177	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	79.006	Mola_mola
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.797	ENSMODG00000025697	-	98	66.849	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	84.533	ENSMALG00000010238	tyw1	98	85.442	Monopterus_albus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.742	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	99	65.742	Mus_caroli
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.881	ENSMUSG00000056310	Tyw1	99	65.881	Mus_musculus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.877	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	66.203	Mus_pahari
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.603	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	99	65.603	Mus_spretus
ENSSMAG00000020514	tyw1	88	70.687	ENSMPUG00000016191	-	95	70.687	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	64.022	ENSMLUG00000013582	-	99	64.569	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.694	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	65.833	Nannospalax_galili
ENSSMAG00000020514	tyw1	91	81.525	ENSNBRG00000016996	tyw1	98	81.525	Neolamprologus_brichardi
ENSSMAG00000020514	tyw1	99	63.984	ENSNLEG00000013210	-	97	65.887	Nomascus_leucogenys
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ENSSMAG00000020514	tyw1	96	58.978	ENSODEG00000014729	-	98	59.034	Octodon_degus
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	81.467	ENSONIG00000005872	tyw1	98	82.385	Oreochromis_niloticus
ENSSMAG00000020514	tyw1	95	66.759	ENSOCUG00000003173	-	98	66.621	Oryctolagus_cuniculus
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	78.552	ENSORLG00000001393	tyw1	97	79.726	Oryzias_latipes
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	78.284	ENSORLG00020019361	tyw1	98	79.452	Oryzias_latipes_hni
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	78.342	ENSORLG00015008095	tyw1	97	79.645	Oryzias_latipes_hsok
ENSSMAG00000020514	tyw1	90	70.458	ENSOGAG00000016555	-	99	66.894	Otolemur_garnettii
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.895	ENSOARG00000010673	-	99	66.895	Ovis_aries
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.946	ENSPPRG00000004945	-	98	66.946	Panthera_pardus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.946	ENSPTIG00000019545	-	98	66.946	Panthera_tigris_altaica
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	60.465	ENSPTRG00000023076	TYW1B	97	62.055	Pan_troglodytes
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.295	ENSPANG00000019053	-	98	67.033	Papio_anubis
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	70.629	ENSPKIG00000006545	tyw1	96	70.474	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSMAG00000020514	tyw1	94	79.007	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	78.865	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	67.355	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.036	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	79.467	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	80.575	Poecilia_formosa
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	79.067	ENSPLAG00000000838	tyw1	98	80.163	Poecilia_latipinna
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	79.333	ENSPMEG00000019437	tyw1	98	80.299	Poecilia_mexicana
ENSSMAG00000020514	tyw1	98	77.080	ENSPREG00000018773	tyw1	99	77.080	Poecilia_reticulata
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.158	ENSPPYG00000017514	TYW1	98	66.575	Pongo_abelii
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	52.812	ENSPCOG00000015294	-	98	52.812	Propithecus_coquereli
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	82.800	ENSPNYG00000022381	tyw1	98	83.469	Pundamilia_nyererei
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	73.853	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	76.006	Pygocentrus_nattereri
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.019	ENSRNOG00000024352	Tyw1	98	66.297	Rattus_norvegicus
ENSSMAG00000020514	tyw1	99	63.553	ENSRBIG00000039619	-	98	66.575	Rhinopithecus_bieti
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.158	ENSRROG00000039780	-	98	66.575	Rhinopithecus_roxellana
ENSSMAG00000020514	tyw1	91	39.972	YPL207W	-	76	39.518	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.152	ENSSBOG00000025873	-	98	65.702	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSMAG00000020514	tyw1	97	65.265	ENSSHAG00000010346	-	99	66.667	Sarcophilus_harrisii
ENSSMAG00000020514	tyw1	99	69.478	ENSSFOG00015001054	tyw1	97	72.247	Scleropages_formosus
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	89.257	ENSSDUG00000001552	tyw1	98	90.270	Seriola_dumerili
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	89.125	ENSSLDG00000003554	tyw1	98	90.135	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSMAG00000020514	tyw1	97	64.850	ENSSPUG00000002715	-	100	65.807	Sphenodon_punctatus
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.981	ENSSSCG00000007733	-	99	66.345	Sus_scrofa
ENSSMAG00000020514	tyw1	88	64.978	ENSTGUG00000003428	-	100	65.923	Taeniopygia_guttata
ENSSMAG00000020514	tyw1	100	80.882	ENSTRUG00000016107	tyw1	95	82.240	Takifugu_rubripes
ENSSMAG00000020514	tyw1	88	83.784	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	83.784	Tetraodon_nigroviridis
ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.943	ENSUMAG00000015343	-	98	67.220	Ursus_maritimus
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