EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSMAG00000021007 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo1a
Alias: im:7151655
Full Name: exportin 1 (CRM1 homolog%2C yeast) a
Gene Type: protein_coding
Species: Scophthalmus_maximus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11681 bases
Position: chr8:532506-544186
Accession: ZDB-GENE-050309-201
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSMAP00000034338	CRM1_C	PF08767.11	1.3e-131	1	1
ENSSMAP00000034338	Xpo1	PF08389.12	1.2e-41	1	1
ENSSMAP00000034338	IBN_N	PF03810.19	3e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSMAT00000034778	-	4509	-	ENSSMAP00000034338	1066 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.344	ENSSMAG00000015718	-	100	92.344

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.850	ENSG00000082898	XPO1	100	90.850	Homo_sapiens
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.344	ENSAPOG00000004984	-	100	92.344	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	96.364	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	96.364	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.325	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	91.325	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	93.617	ENSACIG00000010818	-	100	93.617	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	98.075	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	98.075	Amphilophus_citrinellus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	98.687	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	98.687	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.437	ENSAOCG00000010121	-	100	92.437	Amphiprion_ocellaris
ENSSMAG00000021007	xpo1a	91	98.861	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	98.861	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.437	ENSAPEG00000007038	-	100	92.437	Amphiprion_percula
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.437	ENSATEG00000008816	-	100	92.437	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	98.218	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	98.218	Anabas_testudineus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.503	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	91.503	Anas_platyrhynchos
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.503	ENSACAG00000002501	XPO1	100	91.503	Anolis_carolinensis
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.850	ENSANAG00000020802	XPO1	100	90.850	Aotus_nancymaae
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.344	ENSACLG00000015192	-	100	92.344	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	98.075	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	98.075	Astatotilapia_calliptera
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	93.538	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.538	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.717	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	92.717	Astyanax_mexicanus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.410	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	91.410	Bos_taurus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	98	52.354	WBGene00002078	xpo-1	98	52.354	Caenorhabditis_elegans
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.850	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	90.850	Callithrix_jacchus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.410	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	91.410	Canis_familiaris
ENSSMAG00000021007	xpo1a	93	91.784	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	91.784	Canis_lupus_dingo
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.410	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	91.410	Capra_hircus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.410	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	91.410	Carlito_syrichta
ENSSMAG00000021007	xpo1a	53	87.943	ENSCAPG00000006454	-	100	87.943	Cavia_aperea
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.009	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	90.009	Cavia_porcellus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	73.655	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	73.840	Cebus_capucinus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	89.106	ENSCATG00000032674	XPO1	100	91.702	Cercocebus_atys
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.223	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	91.223	Chinchilla_lanigera
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.850	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	90.850	Chlorocebus_sabaeus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	83	92.866	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	92.866	Choloepus_hoffmanni
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.503	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	91.503	Chrysemys_picta_bellii
ENSSMAG00000021007	xpo1a	99	79.981	ENSCING00000024562	-	99	79.981	Ciona_intestinalis
ENSSMAG00000021007	xpo1a	99	78.297	ENSCSAVG00000005965	-	99	78.297	Ciona_savignyi
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	86.835	ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.135	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.850	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	90.850	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.850	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	90.850	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	92.447	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.447	Cynoglossus_semilaevis
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	96.717	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	96.717	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.063	ENSCVAG00000016788	-	100	92.063	Cyprinodon_variegatus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	93.744	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.046	Danio_rerio
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.810	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	92.810	Danio_rerio
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.503	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	91.503	Dasypus_novemcinctus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	91	88.690	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	88.690	Dipodomys_ordii
ENSSMAG00000021007	xpo1a	99	68.862	FBgn0020497	emb	99	68.862	Drosophila_melanogaster
ENSSMAG00000021007	xpo1a	94	90.590	ENSETEG00000018045	XPO1	94	90.590	Echinops_telfairi
ENSSMAG00000021007	xpo1a	90	77.720	ENSEBUG00000012580	-	100	85.825	Eptatretus_burgeri
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.410	ENSEASG00005007223	XPO1	100	91.410	Equus_asinus_asinus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.410	ENSECAG00000024920	XPO1	100	91.958	Equus_caballus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	92	91.667	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	Erinaceus_europaeus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	95.745	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.745	Esox_lucius
ENSSMAG00000021007	xpo1a	87	90.471	ENSELUG00000014306	-	99	90.471	Esox_lucius
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.410	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	91.410	Felis_catus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.317	ENSFALG00000010989	XPO1	100	91.317	Ficedula_albicollis
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	89.823	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	89.823	Fukomys_damarensis
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	96.998	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	96.998	Fundulus_heteroclitus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	94.747	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	94.747	Gadus_morhua
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	86.835	ENSGMOG00000019063	-	100	86.835	Gadus_morhua
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.503	ENSGALG00000029476	XPO1	100	91.503	Gallus_gallus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	97.540	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	97.540	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000021007	xpo1a	91	92.894	ENSGAFG00000003355	-	98	92.894	Gambusia_affinis
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.250	ENSGACG00000002743	-	100	92.250	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	98.499	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	98.499	Gasterosteus_aculeatus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.410	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	91.410	Gopherus_agassizii
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.850	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	90.850	Gorilla_gorilla
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ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	98.030	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	98.030	Haplochromis_burtoni
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.130	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	91.130	Heterocephalus_glaber_female
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.130	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	91.130	Heterocephalus_glaber_male
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	92.553	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	92.553	Hippocampus_comes
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.904	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	92.904	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	93.838	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.838	Ictalurus_punctatus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.223	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.223	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.223	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	91.223	Jaculus_jaculus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	97.186	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	97.186	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.157	ENSKMAG00000016218	-	100	92.157	Kryptolebias_marmoratus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	95.314	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	95.314	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.437	ENSLBEG00000005740	-	100	92.437	Labrus_bergylta
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	71.336	ENSLACG00000018213	XPO1	100	71.336	Latimeria_chalumnae
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.717	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	92.717	Lepisosteus_oculatus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.130	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	91.130	Loxodonta_africana
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.850	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	90.850	Macaca_fascicularis
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.850	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	90.850	Macaca_mulatta
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.850	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	90.850	Macaca_nemestrina
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	89.116	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	89.116	Mandrillus_leucophaeus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	98.124	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	98.124	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.437	ENSMAMG00000010568	-	100	92.437	Mastacembelus_armatus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.344	ENSMZEG00005018158	-	98	93.100	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	98.030	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	98.030	Maylandia_zebra
ENSSMAG00000021007	xpo1a	68	91.460	ENSMGAG00000001496	-	100	91.460	Meleagris_gallopavo
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.850	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	90.850	Mesocricetus_auratus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.410	ENSMICG00000027770	XPO1	100	91.410	Microcebus_murinus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.756	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	90.756	Microtus_ochrogaster
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	98.289	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	98.289	Mola_mola
ENSSMAG00000021007	xpo1a	87	93.597	ENSMMOG00000008001	-	99	93.597	Mola_mola
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.383	ENSMODG00000002831	XPO1	100	90.383	Monodelphis_domestica
ENSSMAG00000021007	xpo1a	88	96.387	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	96.387	Monopterus_albus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	92.250	ENSMALG00000007085	-	100	92.250	Monopterus_albus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.663	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	90.663	Mus_caroli
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ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	90.663	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	90.663	Mus_spretus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.410	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	91.410	Mustela_putorius_furo
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.317	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	91.317	Myotis_lucifugus
ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.317	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	91.317	Nannospalax_galili
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