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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000000258 (Gene tree)
Gene ID: 103353285
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 26364 bases
Position: chrKK580137.1:812134-838497
Accession: 103353285
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000000354	IBN_N	PF03810.19	1.5e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000000363	-	6286	XM_008276175	ENSSPAP00000000354	890 (aa)	XP_008274397	UPI000496B524

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	86.712	ENSSPAG00000008512	tnpo2	99	86.712
ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	85.489	ENSSPAG00000008511	-	99	85.489

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSG00000083312	TNPO1	100	94.819	Homo_sapiens
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	99.888	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	99.888	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	92.984	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	93.096	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000000258	tnpo1	87	98.579	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.579	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	99.775	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	99.775	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	99.775	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	99.775	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	99.213	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	99.213	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	89.853	ENSAPLG00000009619	-	97	90.826	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.157	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.157	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	83.820	ENSANAG00000025351	-	99	83.820	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	58.869	ENSANAG00000027118	-	99	61.086	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.483	ENSANAG00000022453	-	99	93.483	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	96.966	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.966	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	95.067	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.619	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.045	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	94.045	Bos_taurus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.596	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.596	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	96	93.932	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.932	Canis_familiaris
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	91.573	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.573	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.933	Capra_hircus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	90.395	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.749	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.483	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.483	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.933	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.483	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.483	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.933	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	94	82.241	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.241	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.382	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.382	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	76.655	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.094	Ciona_savignyi
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.933	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.820	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.820	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000000258	tnpo1	96	94.035	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	94.035	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	96.966	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.966	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	97.978	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.978	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	95.062	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.613	Danio_rerio
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	88.242	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	88.242	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	93	94.217	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.210	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	58.850	FBgn0035693	CG8219	99	58.286	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000000258	tnpo1	86	95.506	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000000258	tnpo1	94	85.476	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.476	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.933	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.933	Equus_caballus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	89.107	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.889	Esox_lucius
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.933	Felis_catus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.270	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.270	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.596	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.596	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	98.092	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.092	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.169	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.169	Gadus_morhua
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.483	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.483	Gallus_gallus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	97.646	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.646	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	96.966	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.966	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.270	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.270	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.933	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	78.700	ENSGGOG00000022535	-	98	78.700	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	98.764	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.764	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.483	ENSHGLG00000000970	-	99	93.483	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000000258	tnpo1	96	93.575	ENSHGLG00100017090	-	99	93.575	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000000258	tnpo1	97	73.256	ENSHGLG00100000963	-	99	72.558	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.045	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	94.045	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	97.978	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.978	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	91	94.698	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.698	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000000258	tnpo1	96	87.442	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	95.281	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	95.281	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	97	93.303	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	93.303	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.933	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.820	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.905	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.933	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.933	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	99.213	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	99.213	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	98.315	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.315	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.820	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	90.225	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	90.225	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.820	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.820	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000000258	tnpo1	87	97.552	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.552	Mola_mola
ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	94.681	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.681	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	98.202	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	98.202	Monopterus_albus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.820	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	94.052	Mus_caroli
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.820	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	94.052	Mus_musculus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	94.176	Mus_pahari
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.596	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.933	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000000258	tnpo1	96	93.597	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.597	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.933	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000000258	tnpo1	87	98.320	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.320	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.933	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000000258	tnpo1	90	88.753	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.730	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.258	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	93.258	Octodon_degus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	97.991	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.991	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	92	94.634	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.634	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	96	87.850	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.850	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	87	97.406	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.406	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	97.632	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.632	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	97.971	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.971	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	97.745	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.745	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.933	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.045	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	94.045	Ovis_aries
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.933	Pan_paniscus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.933	Panthera_pardus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.933	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000000258	tnpo1	94	82.597	ENSPTRG00000047731	-	100	82.597	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.933	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.933	Papio_anubis
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	91.573	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.573	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.270	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.270	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.725	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.501	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	96	94.035	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	94.035	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.944	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.944	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	97.872	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	97.872	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	97.872	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	97.872	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	98.315	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.315	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	98.094	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	98.094	Poecilia_reticulata
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ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.933	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.933	Propithecus_coquereli
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