EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000000539 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nrde2
Alias: c14orf102
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9362 bases
Position: chrKK580107.1:352427-361788
Accession: 103372318
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000000873	NRDE-2	PF08424.10	1.6e-99	1	1
ENSSPAP00000000900	NRDE-2	PF08424.10	2.4e-99	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000000885	-	2610	-	ENSSPAP00000000873	869 (aa)	-	-
ENSSPAT00000000912	-	3168	XM_008301929	ENSSPAP00000000900	1055 (aa)	XP_008300151	-

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000000539's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000000539's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	47.489	ENSG00000119720	NRDE2	100	67.647	Homo_sapiens
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	80.963	ENSAPOG00000009202	nrde2	94	81.570	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	46.703	ENSAMEG00000001807	NRDE2	87	48.362	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	79.204	ENSACIG00000014783	nrde2	96	79.531	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	83.512	ENSAOCG00000015576	nrde2	94	83.245	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	83.677	ENSAPEG00000001711	nrde2	94	83.408	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000000539	nrde2	100	76.077	ENSATEG00000010247	nrde2	95	75.440	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	49.726	ENSAPLG00000015870	NRDE2	89	49.807	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.247	ENSACAG00000014571	NRDE2	87	47.394	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	45.495	ENSANAG00000025313	NRDE2	87	46.866	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	77.297	ENSACLG00000025154	nrde2	95	75.221	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000000539	nrde2	93	71.111	ENSAMXG00000034642	nrde2	92	48.685	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	49.164	ENSBTAG00000005427	NRDE2	86	52.770	Bos_taurus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.253	ENSCJAG00000017711	NRDE2	87	49.377	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	45.643	ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	45.798	Canis_familiaris
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.764	ENSCAFG00020016346	NRDE2	89	47.650	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	48.543	ENSCHIG00000005876	NRDE2	87	50.147	Capra_hircus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	48.189	ENSTSYG00000000161	NRDE2	87	49.280	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	48.018	ENSCAPG00000012039	NRDE2	88	49.566	Cavia_aperea
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.907	ENSCPOG00000002428	NRDE2	87	49.470	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.845	ENSCCAG00000024917	NRDE2	89	48.563	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.207	ENSCLAG00000015185	NRDE2	87	48.799	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.075	ENSCSAG00000011451	NRDE2	87	49.324	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000000539	nrde2	66	62.162	ENSCHOG00000006165	NRDE2	63	62.162	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.401	ENSCPBG00000008537	NRDE2	87	48.774	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	47.707	ENSCANG00000029067	NRDE2	87	49.089	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.769	ENSCGRG00001015658	Nrde2	87	48.997	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	48.022	ENSCGRG00000005062	Nrde2	87	49.422	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000000539	nrde2	97	70.759	ENSCSEG00000000089	nrde2	98	70.177	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	74.162	ENSCVAG00000023105	nrde2	92	72.803	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	56.407	ENSDARG00000074726	nrde2	91	55.483	Danio_rerio
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.432	ENSDNOG00000024057	NRDE2	87	48.081	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	47.072	ENSDORG00000003197	Nrde2	98	48.704	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000000539	nrde2	65	54.054	ENSETEG00000000198	NRDE2	60	45.299	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	40.615	ENSEBUG00000014552	nrde2	87	40.487	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	48.796	ENSEASG00005020675	NRDE2	87	49.520	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.855	ENSECAG00000003862	NRDE2	87	49.424	Equus_caballus
ENSSPAG00000000539	nrde2	59	60.150	ENSEEUG00000004026	-	61	60.150	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	58.450	ENSELUG00000005973	nrde2	91	58.720	Esox_lucius
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.855	ENSFCAG00000011312	NRDE2	87	49.275	Felis_catus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	49.286	ENSFALG00000012260	NRDE2	87	49.372	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.525	ENSFDAG00000021350	NRDE2	87	48.701	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	74.838	ENSFHEG00000021385	nrde2	94	74.067	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000000539	nrde2	81	71.577	ENSGMOG00000015815	nrde2	92	70.791	Gadus_morhua
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	49.069	ENSGALG00000010677	NRDE2	88	49.225	Gallus_gallus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	74.807	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	76.575	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	75.763	ENSGACG00000012619	nrde2	94	75.404	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.675	ENSGAGG00000003252	NRDE2	89	49.012	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	47.162	ENSGGOG00000008835	NRDE2	88	48.418	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	77.297	ENSHBUG00000016736	nrde2	95	75.266	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	48.128	ENSHGLG00000006731	NRDE2	88	49.084	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	48.128	ENSHGLG00100017736	NRDE2	88	49.084	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	69.670	ENSHCOG00000009559	nrde2	97	66.135	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	52.169	ENSIPUG00000016129	nrde2	91	51.382	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	48.451	ENSSTOG00000001678	NRDE2	87	49.661	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	49.392	ENSJJAG00000000907	Nrde2	87	50.145	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000000539	nrde2	100	74.648	ENSKMAG00000008647	nrde2	95	74.296	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	76.797	ENSLBEG00000021428	nrde2	99	76.251	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000000539	nrde2	89	50.487	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.582	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	56.410	ENSLOCG00000009037	nrde2	90	55.241	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	46.455	ENSLAFG00000004966	NRDE2	89	48.259	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	47.489	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	67.157	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000000539	nrde2	100	75.832	ENSMAMG00000013452	nrde2	95	75.657	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	77.081	ENSMZEG00005008319	nrde2	95	75.044	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.906	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	48.345	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.802	ENSMAUG00000018578	Nrde2	87	49.374	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	48.957	ENSMICG00000016741	NRDE2	88	49.667	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	46.830	ENSMOCG00000014472	Nrde2	93	45.701	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000000539	nrde2	95	72.254	ENSMMOG00000004703	nrde2	94	71.676	Mola_mola
ENSSPAG00000000539	nrde2	92	48.865	ENSMODG00000002711	NRDE2	85	48.397	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	77.058	ENSMALG00000021869	nrde2	98	76.676	Monopterus_albus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.525	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	49.423	Mus_caroli
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.687	ENSMUSG00000021179	Nrde2	86	49.663	Mus_musculus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.359	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	87	49.566	Mus_pahari
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.306	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	90	62.712	Mus_spretus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.689	ENSMPUG00000008135	NRDE2	87	48.824	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	46.968	ENSMLUG00000007484	NRDE2	89	48.534	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.071	ENSNGAG00000002993	Nrde2	88	49.232	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	79.734	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	79.284	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000000539	nrde2	96	47.404	ENSNLEG00000017032	NRDE2	87	48.104	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000000539	nrde2	93	48.000	ENSMEUG00000011097	NRDE2	74	47.600	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000000539	nrde2	64	61.111	ENSOPRG00000001375	-	60	63.366	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	46.645	ENSODEG00000012422	NRDE2	89	47.830	Octodon_degus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	79.621	ENSONIG00000019512	nrde2	95	77.195	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.788	ENSOCUG00000010083	NRDE2	87	48.400	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	72.253	ENSORLG00000017730	nrde2	99	71.012	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	71.762	ENSORLG00020015965	nrde2	95	70.455	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	71.656	ENSORLG00015012437	nrde2	99	70.367	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	72.524	ENSOMEG00000010890	nrde2	94	71.378	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	49.007	ENSOGAG00000006624	NRDE2	88	50.192	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	45.819	ENSOARG00000003475	NRDE2	88	47.337	Ovis_aries
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	47.598	ENSPPAG00000034133	NRDE2	96	49.782	Pan_paniscus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.328	ENSPPRG00000006422	NRDE2	87	49.040	Panthera_pardus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.380	ENSPTIG00000009989	NRDE2	87	49.040	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	47.598	ENSPTRG00000023399	NRDE2	88	48.897	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	52.805	ENSPKIG00000009331	nrde2	91	51.970	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.953	ENSPSIG00000005588	NRDE2	87	49.758	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	67.550	ENSPMGG00000024089	nrde2	93	66.571	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	47.702	ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	49.373	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	48.726	ENSPCIG00000018567	NRDE2	94	49.904	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	74.254	ENSPFOG00000013217	nrde2	94	73.889	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000000539	nrde2	100	73.643	ENSPLAG00000022350	nrde2	94	73.286	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	73.191	ENSPMEG00000000778	nrde2	94	72.935	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000000539	nrde2	100	73.527	ENSPREG00000009066	nrde2	94	73.175	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.152	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	48.778	Pongo_abelii
ENSSPAG00000000539	nrde2	76	70.455	ENSPCAG00000016399	NRDE2	69	70.769	Procavia_capensis
ENSSPAG00000000539	nrde2	93	49.410	ENSPCOG00000024684	NRDE2	87	48.140	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000000539	nrde2	96	45.017	ENSPVAG00000010023	NRDE2	87	45.482	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	78.831	ENSPNYG00000022833	nrde2	96	81.748	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	54.956	ENSPNAG00000015807	nrde2	97	55.182	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000000539	nrde2	88	48.771	ENSRNOG00000004004	Nrde2	86	48.220	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.035	ENSSBOG00000024346	NRDE2	87	49.377	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.947	ENSSHAG00000016736	NRDE2	85	48.940	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000000539	nrde2	100	54.965	ENSSFOG00015011794	nrde2	92	55.679	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	74.074	ENSSMAG00000011671	nrde2	92	74.077	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000000539	nrde2	100	78.030	ENSSDUG00000017948	nrde2	95	77.768	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	81.748	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	82.267	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.957	ENSSPUG00000006348	NRDE2	97	49.320	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	48.295	ENSSSCG00000002434	NRDE2	87	49.087	Sus_scrofa
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	49.890	ENSTGUG00000012462	-	89	49.319	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	69.401	ENSTRUG00000002798	nrde2	98	70.614	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000000539	nrde2	91	58.644	ENSTBEG00000011834	NRDE2	82	52.913	Tupaia_belangeri
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.588	ENSTTRG00000013583	NRDE2	88	48.620	Tursiops_truncatus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	46.851	ENSUAMG00000004159	NRDE2	92	48.356	Ursus_americanus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.851	ENSUMAG00000006393	NRDE2	90	49.258	Ursus_maritimus
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	47.546	ENSVVUG00000018202	NRDE2	88	47.606	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000000539	nrde2	98	46.659	ENSXETG00000015708	nrde2	89	47.030	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000000539	nrde2	99	73.208	ENSXCOG00000013298	nrde2	99	72.928	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000000539	nrde2	100	74.012	ENSXMAG00000009320	nrde2	95	73.661	Xiphophorus_maculatus