EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000000997 (Gene tree)
Gene ID: 103362728
Gene Symbol: ptrhd1
Alias: si:dkey-34f16.5
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2867 bases
Position: chrKK580668.1:256738-259604
Accession: 103362728
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000001299	PTH2	PF01981.16	2.6e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000001323	-	2097	XM_008289175	ENSSPAP00000001299	126 (aa)	XP_008287397	UPI0004978A05

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000000997's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000000997's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSG00000184924	PTRHD1	90	58.268	Homo_sapiens
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	97.619	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	100	97.619	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	54.331	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.331	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	96.825	ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	96.825	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	97.619	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	100	97.619	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	97.619	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	100	97.619	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	95.238	ENSATEG00000019199	ptrhd1	100	95.238	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSANAG00000019089	PTRHD1	90	58.268	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	97.619	ENSACLG00000000814	ptrhd1	100	97.619	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	77.165	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	77.165	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	61.417	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	90	61.417	Bos_taurus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	99	48.800	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	48.800	Caenorhabditis_elegans
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	56.693	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	90	56.693	Canis_familiaris
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	61.417	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	90	61.417	Capra_hircus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	90	58.268	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	90	58.268	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	90	58.268	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.730	ENSCATG00000033690	PTRHD1	90	58.730	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	87	58.268	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	90	58.268	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	47.619	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	91	47.619	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	90	58.268	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	91	60.870	ENSCING00000019647	-	97	60.870	Ciona_intestinalis
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSCANG00000034444	PTRHD1	90	58.268	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	60	57.480	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	90	57.480	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	92.126	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	100	92.126	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	92.857	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	100	92.857	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	80.159	ENSDARG00000016122	ptrhd1	100	80.159	Danio_rerio
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	98	56.000	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	83	56.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	56.693	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	91	56.693	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	93	62.393	FBgn0038446	CG14903	98	62.393	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	53	57.353	ENSETEG00000001615	-	81	57.353	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	96	47.934	ENSETEG00000009379	-	90	47.934	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	91	60.870	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.870	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	98	41.600	ENSEASG00005001302	-	88	41.600	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSECAG00000017730	PTRHD1	90	58.268	Equus_caballus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	99	41.270	ENSECAG00000005314	-	87	41.270	Equus_caballus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	98	58.400	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	89	58.400	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	82.540	ENSELUG00000003837	ptrhd1	100	82.540	Esox_lucius
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	55.906	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	90	55.906	Felis_catus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	59.843	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	90	59.843	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	92.063	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	100	92.063	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	91	56.522	ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	Gallus_gallus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	90.476	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	100	90.476	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	99	92.800	ENSGACG00000006743	ptrhd1	98	92.800	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	60.630	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	100	60.630	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	100	57.480	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	96.825	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	100	96.825	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	62.205	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	90	62.205	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	61.417	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	90	61.417	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	60.630	ENSHGLG00100004341	-	92	60.630	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	92.913	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	100	92.913	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	93	76.068	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	98	76.068	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	90	58.268	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	91	58.268	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	89	89.286	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	89.286	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	94.444	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	100	94.444	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	91	71.304	ENSLACG00000018052	PTRHD1	100	67.460	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	82.031	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	100	82.031	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	98	56.800	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	89	56.800	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	90	57.480	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	90	57.480	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	90	57.480	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.143	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	90	57.143	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	90.476	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	100	90.476	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	97.619	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	100	97.619	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	90	57.480	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	98	58.400	ENSMICG00000001578	PTRHD1	89	58.400	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	56.693	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.693	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	91.270	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	100	91.270	Mola_mola
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	95	56.198	ENSMODG00000015895	PTRHD1	89	56.198	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	91.270	ENSMALG00000003471	ptrhd1	100	91.270	Monopterus_albus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	56.693	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	90	56.693	Mus_caroli
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	56.693	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	Mus_musculus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	56.693	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	90	56.693	Mus_spretus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	55.906	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	90	55.906	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	98	54.400	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	89	54.400	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	55.906	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	90	55.906	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	97.619	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	100	97.619	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	90	57.480	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	56.693	ENSODEG00000007805	PTRHD1	87	56.693	Octodon_degus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	96.825	ENSONIG00000015722	ptrhd1	93	96.825	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	90	57.480	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	92	82.906	ENSORLG00000028768	ptrhd1	99	82.906	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	92	82.906	ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.906	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	92	82.906	ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.906	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	79.528	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	100	79.528	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	98	53.600	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	89	53.600	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	61.417	ENSOARG00000018052	PTRHD1	90	61.417	Ovis_aries
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	90	58.268	Pan_paniscus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	55.906	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	90	55.906	Panthera_pardus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	55.906	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	90	55.906	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	90	58.268	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	59.055	ENSPANG00000006781	PTRHD1	90	59.055	Papio_anubis
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	73.810	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	86	73.810	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	92	90.517	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	100	88.889	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	84	69.811	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	93	68.376	Petromyzon_marinus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	91	58.621	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	92	58.621	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	88.889	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	89	88.889	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	88.889	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	88.889	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	89.683	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	100	89.683	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	89.683	ENSPREG00000017624	ptrhd1	100	89.683	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	90	58.268	Pongo_abelii
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	98	57.600	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	89	57.600	Procavia_capensis
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	98	57.600	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	89	57.600	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	90	58.268	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	97.619	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	100	97.619	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	78.740	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	100	78.740	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	98	58.400	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	89	58.400	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	90	58.268	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	ENSRROG00000029627	PTRHD1	90	58.268	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	90	57.480	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	91	57.759	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	75	57.759	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	96	75.207	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	75.207	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	92	93.103	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	100	89.764	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	94.444	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	85	94.444	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	94.444	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	100	94.444	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	91	61.207	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	95	59.843	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	97	48.361	ENSSSCG00000040441	-	92	48.361	Sus_scrofa
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	91	58.621	ENSTGUG00000015169	-	85	58.621	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	87.302	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	100	87.302	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	88.095	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	88.095	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	56.693	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	90	56.693	Tursiops_truncatus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	55.118	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	90	55.118	Ursus_americanus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	91	57.480	Vicugna_pacos
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	88	64.865	ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	90.476	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	100	90.476	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	90.476	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	100	90.476	Xiphophorus_maculatus