EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000001320 (Gene tree)
Gene ID: 103366611
Gene Symbol: eefsec
Alias: zgc:123265
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14227 bases
Position: chrKK581027.1:154994-169220
Accession: 103366611
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000001740	GTP_EFTU	PF00009.27	5.4e-30	1	1
ENSSPAP00000001746	GTP_EFTU	PF00009.27	1.8e-29	1	1
ENSSPAP00000001740	MMR_HSR1	PF01926.23	7.3e-07	1	1
ENSSPAP00000001746	MMR_HSR1	PF01926.23	1.9e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000001778	-	2979	XM_008294380	ENSSPAP00000001746	583 (aa)	XP_008292602	UPI000494FC2C
ENSSPAT00000001772	-	1089	-	ENSSPAP00000001740	362 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000001320's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000001320's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	65.125	ENSG00000132394	EEFSEC	99	61.755	Homo_sapiens
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	96.569	ENSAPOG00000015931	eefsec	100	96.569	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000001320	eefsec	80	60.083	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	88	61.726	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	94.780	ENSACIG00000022407	eefsec	99	96.443	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	97.256	ENSAOCG00000008603	eefsec	100	97.256	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	97.427	ENSAPEG00000017090	eefsec	100	97.427	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	92.481	ENSATEG00000002753	eefsec	100	91.453	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000001320	eefsec	73	67.048	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.048	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.057	ENSANAG00000032691	EEFSEC	99	61.093	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	95.868	ENSACLG00000024565	eefsec	100	96.538	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	82.470	ENSAMXG00000002260	eefsec	98	74.826	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	70.196	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	99	70.866	Bos_taurus
ENSSPAG00000001320	eefsec	81	45.098	WBGene00008133	efsc-1	92	32.000	Caenorhabditis_elegans
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.057	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.596	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	63.860	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	80	61.184	Canis_familiaris
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	63.860	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	99	61.184	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	68.627	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	99	62.353	Capra_hircus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.769	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.336	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000001320	eefsec	83	56.574	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	98	55.888	Cavia_aperea
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.544	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	99	72.015	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.057	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	99	60.762	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.769	ENSCATG00000019414	EEFSEC	99	61.818	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	65.809	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	99	71.269	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.413	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	99	61.424	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	70.166	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	88	66.723	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	65.414	ENSCSAVG00000002208	-	100	59.060	Ciona_savignyi
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.057	ENSCANG00000031492	EEFSEC	99	61.424	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.421	ENSCGRG00001018089	Eefsec	99	61.849	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000001320	eefsec	98	66.045	ENSCGRG00000010063	Eefsec	98	71.591	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	91.729	ENSCSEG00000003008	eefsec	99	91.760	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	90.940	ENSCVAG00000005381	eefsec	100	90.598	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	84.462	ENSDARG00000004696	eefsec	99	76.298	Danio_rerio
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.065	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	99	62.914	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000001320	eefsec	75	66.667	ENSDORG00000000264	Eefsec	85	71.429	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000001320	eefsec	98	47.203	FBgn0034627	eEFSec	95	50.000	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000001320	eefsec	91	63.571	ENSETEG00000007406	EEFSEC	99	55.426	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000001320	eefsec	71	74.490	ENSEBUG00000015029	eefsec	93	52.354	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.286	ENSEASG00005006786	EEFSEC	99	61.692	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.286	ENSECAG00000016565	EEFSEC	99	61.857	Equus_caballus
ENSSPAG00000001320	eefsec	98	80.517	ENSELUG00000016632	eefsec	98	80.556	Esox_lucius
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.311	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	99	62.541	Felis_catus
ENSSPAG00000001320	eefsec	83	66.061	ENSFALG00000007901	EEFSEC	99	66.061	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000001320	eefsec	83	61.155	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	88	71.875	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	90.769	ENSFHEG00000007155	eefsec	100	89.402	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	76.976	ENSGMOG00000007705	eefsec	99	78.351	Gadus_morhua
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	71.053	ENSGALG00000038684	EEFSEC	99	67.802	Gallus_gallus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	90.226	ENSGAFG00000021692	eefsec	100	87.500	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	90.909	ENSGACG00000000793	eefsec	99	91.478	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000001320	eefsec	83	84.615	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	98	66.385	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000001320	eefsec	86	62.333	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	98	61.686	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	96.838	ENSHBUG00000008917	eefsec	100	93.162	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.421	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	99	68.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000001320	eefsec	98	66.421	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	94	61.993	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	86.466	ENSHCOG00000004193	eefsec	99	83.390	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	79.545	ENSIPUG00000017291	eefsec	99	74.699	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000001320	eefsec	83	61.400	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	88	71.875	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000001320	eefsec	74	71.161	ENSJJAG00000020703	-	99	71.161	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	94.071	ENSKMAG00000019907	eefsec	100	91.111	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	94.071	ENSLBEG00000017908	eefsec	100	90.598	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000001320	eefsec	77	79.651	ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	69.703	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	76.923	ENSLOCG00000014535	eefsec	100	75.897	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	63.004	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	99	60.504	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.769	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	99	61.589	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000001320	eefsec	81	59.879	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	98	67.788	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.769	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	99	61.424	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000001320	eefsec	83	60.827	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	93	60.158	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	93.113	ENSMAMG00000023964	eefsec	100	92.287	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	95.868	ENSMZEG00005009380	eefsec	100	96.538	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000001320	eefsec	66	64.322	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	100	64.322	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000001320	eefsec	83	75.926	ENSMAUG00000011197	Eefsec	99	71.536	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.052	ENSMOCG00000017748	Eefsec	99	71.536	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	89.779	ENSMMOG00000021820	eefsec	99	91.353	Mola_mola
ENSSPAG00000001320	eefsec	84	74.545	ENSMODG00000008034	EEFSEC	81	65.306	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000001320	eefsec	98	91.729	ENSMALG00000016211	eefsec	99	91.274	Monopterus_albus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.058	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	99	71.481	Mus_caroli
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.058	ENSMUSG00000033216	Eefsec	99	71.481	Mus_musculus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.058	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	99	71.481	Mus_pahari
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.058	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	99	71.481	Mus_spretus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.057	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	95	62.023	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000001320	eefsec	83	60.079	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	99	59.010	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000001320	eefsec	74	71.536	ENSNGAG00000023278	-	99	71.536	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	95.592	ENSNBRG00000002387	eefsec	100	96.538	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.413	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	99	61.258	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000001320	eefsec	83	63.765	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	99	63.030	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	65.455	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	99	62.542	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	65.441	ENSODEG00000002928	EEFSEC	99	70.896	Octodon_degus
ENSSPAG00000001320	eefsec	81	93.711	ENSONIG00000019038	eefsec	100	93.501	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000001320	eefsec	81	64.008	ENSOANG00000009108	EEFSEC	99	63.395	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.182	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	99	62.876	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	89.256	ENSORLG00000001377	eefsec	99	91.051	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	88.981	ENSORLG00020000729	eefsec	99	91.051	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	87.692	ENSORLG00015001986	eefsec	100	85.983	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000001320	eefsec	83	83.573	ENSOMEG00000010071	eefsec	89	82.341	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000001320	eefsec	59	83.673	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	97	62.472	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000001320	eefsec	64	61.240	ENSOARG00000004600	EEFSEC	100	60.363	Ovis_aries
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.769	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	99	61.424	Pan_paniscus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	65.125	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	99	62.645	Panthera_pardus
ENSSPAG00000001320	eefsec	85	61.036	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	92	60.385	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.769	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	99	61.258	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.769	ENSPANG00000017041	EEFSEC	99	61.424	Papio_anubis
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	85.259	ENSPKIG00000005220	eefsec	97	82.197	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000001320	eefsec	83	80.769	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	98	68.105	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	88.496	ENSPMGG00000020300	eefsec	99	85.026	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.421	ENSPEMG00000013677	Eefsec	99	71.910	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000001320	eefsec	85	75.862	ENSPMAG00000006779	eefsec	98	67.542	Petromyzon_marinus
ENSSPAG00000001320	eefsec	81	62.653	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	99	62.118	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	90.226	ENSPFOG00000003748	eefsec	100	87.842	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	90.226	ENSPLAG00000018012	eefsec	99	88.083	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	90.226	ENSPMEG00000001202	eefsec	100	87.842	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	90.602	ENSPREG00000012235	eefsec	100	88.870	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.057	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	99	61.258	Pongo_abelii
ENSSPAG00000001320	eefsec	72	76.923	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	55.701	Procavia_capensis
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	67.969	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	99	61.667	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	67.181	ENSPVAG00000007070	EEFSEC	64	67.181	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	94.359	ENSPNYG00000005726	eefsec	100	96.154	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	78.788	ENSPNAG00000016724	eefsec	99	76.042	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	66.120	ENSRNOG00000012954	Eefsec	99	70.356	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.413	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	99	61.589	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000001320	eefsec	69	69.721	ENSRROG00000030260	-	88	66.667	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000001320	eefsec	81	59.677	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	99	58.990	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000001320	eefsec	81	63.673	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	99	62.322	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	83.730	ENSSFOG00015021109	eefsec	98	75.722	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	90.295	ENSSMAG00000001454	eefsec	99	90.988	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	92.662	ENSSDUG00000007924	eefsec	100	92.662	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000001320	eefsec	98	92.509	ENSSLDG00000024985	eefsec	99	92.509	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000001320	eefsec	52	73.469	ENSSARG00000003789	-	51	73.469	Sorex_araneus
ENSSPAG00000001320	eefsec	81	66.119	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	100	66.119	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	69.960	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	99	67.486	Sus_scrofa
ENSSPAG00000001320	eefsec	100	70.866	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	99	66.327	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	94.821	ENSTRUG00000010327	eefsec	99	87.671	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	92.430	ENSTNIG00000003225	eefsec	99	86.897	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	68.235	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	99	62.081	Tursiops_truncatus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	65.125	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	99	61.921	Ursus_americanus
ENSSPAG00000001320	eefsec	73	63.182	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	90	62.415	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000001320	eefsec	80	68.067	ENSXETG00000002066	eefsec	99	67.850	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	90.977	ENSXCOG00000019916	eefsec	99	88.448	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000001320	eefsec	99	91.353	ENSXMAG00000001839	eefsec	100	88.508	Xiphophorus_maculatus