EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000002528 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pusl1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16432 bases
Position: chrKK580199.1:85718-102149
Accession: 103354973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000003358	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.7e-22	1	2
ENSSPAP00000003358	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.7e-22	2	2
ENSSPAP00000003337	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.2e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000003416	-	756	XM_008278597	ENSSPAP00000003358	252 (aa)	XP_008276819	-
ENSSPAT00000003395	-	864	-	ENSSPAP00000003337	287 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000002528's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000002528's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.788	ENSG00000169972	PUSL1	97	41.463	Homo_sapiens
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	76.923	ENSAPOG00000016290	pusl1	92	76.923	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	43.750	ENSAMEG00000013752	PUSL1	93	42.466	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	72.593	ENSACIG00000015240	pusl1	100	72.593	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	76.190	ENSAOCG00000019419	pusl1	82	76.190	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	75.824	ENSAPEG00000005452	pusl1	91	75.824	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	70.438	ENSATEG00000024154	pusl1	92	70.438	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	48.175	ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	45.392	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000002528	pusl1	90	50.000	ENSACAG00000014111	PUSL1	94	50.000	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.154	ENSANAG00000037456	PUSL1	89	46.154	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	72.263	ENSACLG00000008675	pusl1	91	72.263	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	56.204	ENSAMXG00000044007	pusl1	92	56.204	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.520	ENSBTAG00000007619	PUSL1	97	45.392	Bos_taurus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.154	ENSCJAG00000010972	PUSL1	89	46.154	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	44.485	ENSCAFG00000019291	PUSL1	92	42.268	Canis_familiaris
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.221	ENSCAFG00020011568	PUSL1	91	43.299	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.788	ENSCHIG00000012615	PUSL1	97	44.828	Capra_hircus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.421	ENSCPOG00000005149	PUSL1	90	43.750	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.154	ENSCCAG00000027475	PUSL1	89	46.154	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.154	ENSCATG00000018260	PUSL1	89	46.154	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	44.322	ENSCLAG00000005232	PUSL1	92	41.497	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.788	ENSCSAG00000000680	PUSL1	92	43.345	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	53.137	ENSCPBG00000022621	PUSL1	96	50.342	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.788	ENSCANG00000034373	PUSL1	92	42.955	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	44.689	ENSCGRG00001012429	Pusl1	98	42.905	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	44.689	ENSCGRG00000006466	Pusl1	98	42.905	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	65.693	ENSCSEG00000005159	pusl1	92	65.693	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000002528	pusl1	86	57.080	ENSCVAG00000012923	pusl1	91	57.080	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	54.579	ENSDARG00000074565	pusl1	100	52.862	Danio_rerio
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	30.363	FBgn0083976	CG34140	99	30.938	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.520	ENSECAG00000006248	PUSL1	91	44.637	Equus_caballus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.909	ENSEEUG00000000837	PUSL1	92	46.909	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	58.303	ENSELUG00000015945	pusl1	92	58.303	Esox_lucius
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.588	ENSFCAG00000007617	PUSL1	91	44.718	Felis_catus
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	70.073	ENSFHEG00000006370	pusl1	92	70.073	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	67.153	ENSGMOG00000019388	pusl1	97	67.153	Gadus_morhua
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	48.175	ENSGALG00000001714	PUSL1	94	48.175	Gallus_gallus
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	68.613	ENSGAFG00000007546	pusl1	93	68.613	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	65.455	ENSGACG00000007848	pusl1	91	65.455	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	52.030	ENSGAGG00000004730	PUSL1	96	50.000	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000002528	pusl1	87	46.058	ENSGGOG00000005364	PUSL1	93	46.058	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	72.263	ENSHBUG00000001264	pusl1	91	72.263	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.620	ENSHGLG00000017570	PUSL1	88	45.620	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000002528	pusl1	89	46.185	ENSHGLG00100007641	PUSL1	82	46.185	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	71.483	ENSHCOG00000010077	pusl1	99	71.483	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	54.745	ENSIPUG00000023921	pusl1	94	54.745	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.520	ENSSTOG00000001783	PUSL1	84	46.520	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.886	ENSJJAG00000020471	Pusl1	93	45.614	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000002528	pusl1	96	61.364	ENSKMAG00000005154	pusl1	90	61.364	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	71.533	ENSLBEG00000013469	pusl1	94	71.533	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000002528	pusl1	67	54.335	ENSLACG00000018795	PUSL1	89	53.039	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	51.460	ENSLOCG00000002210	pusl1	96	48.973	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000002528	pusl1	89	47.177	ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	47.177	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.788	ENSMFAG00000046288	PUSL1	89	45.788	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	39.338	ENSMMUG00000016279	PUSL1	91	36.426	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.788	ENSMNEG00000037989	PUSL1	92	43.643	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	70.073	ENSMAMG00000016538	pusl1	90	70.073	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	72.263	ENSMZEG00005026990	pusl1	91	72.263	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	47.810	ENSMGAG00000003037	PUSL1	96	45.051	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	43.750	ENSMAUG00000019924	Pusl1	98	42.905	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	47.794	ENSMICG00000014171	PUSL1	95	46.367	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.788	ENSMOCG00000005602	Pusl1	98	43.919	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	70.696	ENSMMOG00000003269	pusl1	99	70.696	Mola_mola
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	68.978	ENSMALG00000021686	pusl1	90	68.978	Monopterus_albus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	44.727	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	98	42.568	Mus_caroli
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	44.727	ENSMUSG00000051557	Pusl1	98	41.892	Mus_musculus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.091	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	98	42.568	Mus_pahari
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.455	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	98	42.568	Mus_spretus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	44.526	ENSMPUG00000014313	PUSL1	92	43.836	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.182	ENSNGAG00000004647	Pusl1	85	44.257	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000002528	pusl1	91	65.299	ENSNBRG00000014762	pusl1	93	65.299	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000002528	pusl1	94	46.154	ENSNLEG00000000051	PUSL1	93	46.154	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.221	ENSMEUG00000011649	-	97	45.833	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	38.007	ENSMEUG00000005176	-	98	40.072	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	44.689	ENSODEG00000008247	PUSL1	89	43.599	Octodon_degus
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	72.628	ENSONIG00000019361	pusl1	91	72.628	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	66.423	ENSORLG00000016228	pusl1	93	66.423	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	66.058	ENSORLG00020013710	pusl1	93	66.058	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	65.693	ENSORLG00015008715	pusl1	96	65.693	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	66.058	ENSOMEG00000018897	pusl1	94	66.058	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.886	ENSOGAG00000031692	PUSL1	95	45.965	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000002528	pusl1	94	45.977	ENSOARG00000004905	PUSL1	97	45.977	Ovis_aries
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.520	ENSPPAG00000029283	PUSL1	92	44.330	Pan_paniscus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.221	ENSPPRG00000023329	PUSL1	91	44.366	Panthera_pardus
ENSSPAG00000002528	pusl1	94	43.636	ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	43.636	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.154	ENSPTRG00000000021	PUSL1	92	43.986	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.788	ENSPANG00000000591	PUSL1	89	45.788	Papio_anubis
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	52.727	ENSPKIG00000002447	pusl1	97	50.859	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000002528	pusl1	90	54.618	ENSPSIG00000002781	PUSL1	92	54.618	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	62.825	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	62.825	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.055	ENSPEMG00000013541	Pusl1	98	43.581	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	43.590	ENSPCIG00000007816	-	63	43.403	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	68.248	ENSPFOG00000015448	pusl1	91	68.248	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	68.248	ENSPLAG00000004348	pusl1	92	68.248	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	68.248	ENSPMEG00000000931	pusl1	96	66.792	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	66.423	ENSPREG00000002324	pusl1	92	66.423	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000002528	pusl1	88	43.580	ENSPPYG00000002014	PUSL1	88	43.580	Pongo_abelii
ENSSPAG00000002528	pusl1	65	50.000	ENSPCAG00000002272	PUSL1	73	46.927	Procavia_capensis
ENSSPAG00000002528	pusl1	70	53.623	ENSPVAG00000001016	PUSL1	64	53.623	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000002528	pusl1	84	72.532	ENSPNYG00000006588	pusl1	97	72.532	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	56.985	ENSPNAG00000024441	pusl1	94	56.985	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.055	ENSRNOG00000022354	Pusl1	98	42.568	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.421	ENSRBIG00000036842	PUSL1	92	42.955	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	45.421	ENSRROG00000030704	PUSL1	92	43.299	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000002528	pusl1	89	47.177	ENSSBOG00000032249	PUSL1	89	47.177	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000002528	pusl1	59	50.667	ENSSHAG00000004840	-	77	50.667	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	56.364	ENSSFOG00015008281	pusl1	94	53.559	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	67.399	ENSSMAG00000007187	pusl1	90	67.399	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	70.073	ENSSDUG00000000287	pusl1	95	62.718	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	69.708	ENSSLDG00000009605	pusl1	88	69.708	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000002528	pusl1	65	50.602	ENSSARG00000005323	-	96	46.561	Sorex_araneus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	46.545	ENSSSCG00000003338	PUSL1	92	44.966	Sus_scrofa
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	48.339	ENSTGUG00000003214	PUSL1	98	47.751	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	66.788	ENSTRUG00000010102	pusl1	92	66.788	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000002528	pusl1	63	60.894	ENSTNIG00000005789	pusl1	81	60.894	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPAG00000002528	pusl1	64	41.053	ENSTBEG00000005001	PUSL1	74	41.053	Tupaia_belangeri
ENSSPAG00000002528	pusl1	98	40.767	ENSTTRG00000017030	PUSL1	92	40.767	Tursiops_truncatus
ENSSPAG00000002528	pusl1	87	45.098	ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	45.098	Ursus_americanus
ENSSPAG00000002528	pusl1	87	45.490	ENSUMAG00000002084	PUSL1	81	45.490	Ursus_maritimus
ENSSPAG00000002528	pusl1	99	44.485	ENSVVUG00000004320	PUSL1	92	38.485	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000002528	pusl1	80	52.709	ENSXETG00000011145	pusl1	93	49.065	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	64.469	ENSXCOG00000017748	pusl1	99	64.483	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000002528	pusl1	100	69.343	ENSXMAG00000018846	pusl1	92	69.343	Xiphophorus_maculatus