EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000002553 (Gene tree)
Gene ID: 103357722
Gene Symbol: npm3
Alias: cb581|fb75f02|sb:cb581|wu:fb75f02|zgc:113084
Full Name: nucleophosmin/nucleoplasmin 3
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6483 bases
Position: chrKK580341.1:136506-142988
Accession: 103357722
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000003333	Nucleoplasmin	PF03066.15	2.2e-33	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000003391	-	4446	XM_008282392	ENSSPAP00000003333	162 (aa)	XP_008280614	UPI000496EE84

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000002553's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000002553's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000002553	npm3	81	40.299	ENSSPAG00000021660	npm1a	52	40.299

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSG00000107833	NPM3	83	49.660	Homo_sapiens
ENSSPAG00000002553	npm3	100	89.634	ENSAPOG00000013083	npm3	100	87.805	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSAMEG00000017639	-	64	50.877	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000002553	npm3	67	44.037	ENSAMEG00000019414	-	68	42.609	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000002553	npm3	86	88.489	ENSACIG00000022586	npm3	82	85.612	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000002553	npm3	100	91.358	ENSAOCG00000009376	npm3	100	91.358	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000002553	npm3	100	91.358	ENSAPEG00000015863	npm3	100	91.358	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000002553	npm3	100	82.822	ENSATEG00000022752	npm3	100	85.276	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000002553	npm3	65	51.887	ENSAPLG00000010935	NPM3	66	52.941	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000002553	npm3	76	49.593	ENSACAG00000011936	NPM3	98	45.963	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000002553	npm3	93	49.333	ENSANAG00000027082	-	83	50.000	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000002553	npm3	60	49.485	ENSANAG00000033290	-	63	45.714	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000002553	npm3	72	48.718	ENSANAG00000023070	-	72	49.558	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000002553	npm3	73	47.458	ENSANAG00000023832	-	54	48.246	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000002553	npm3	100	88.889	ENSACLG00000007854	npm3	100	88.889	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000002553	npm3	67	86.111	ENSAMXG00000039828	npm3	57	85.455	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000002553	npm3	100	45.562	ENSBTAG00000016335	NPM3	76	47.368	Bos_taurus
ENSSPAG00000002553	npm3	93	49.333	ENSCJAG00000017650	NPM3	63	51.786	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSCAFG00000009919	NPM3	56	50.877	Canis_familiaris
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSCAFG00020009185	NPM3	65	50.877	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000002553	npm3	100	45.562	ENSCHIG00000024055	-	76	47.368	Capra_hircus
ENSSPAG00000002553	npm3	92	32.215	ENSCHIG00000016052	-	66	36.283	Capra_hircus
ENSSPAG00000002553	npm3	56	35.556	ENSCAPG00000016606	NPM3	54	36.471	Cavia_aperea
ENSSPAG00000002553	npm3	94	48.684	ENSCPOG00000006301	NPM3	69	51.695	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000002553	npm3	93	49.333	ENSCCAG00000031043	-	83	50.000	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000002553	npm3	85	46.715	ENSCCAG00000029457	-	78	46.043	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSCATG00000013755	NPM3	83	49.660	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSCSAG00000005509	NPM3	83	49.660	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000002553	npm3	65	50.943	ENSCPBG00000003817	NPM3	67	50.943	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000002553	npm3	70	51.327	ENSCANG00000020300	NPM3	64	51.327	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000002553	npm3	70	51.754	ENSCGRG00001013345	Npm3	64	52.679	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000002553	npm3	63	54.902	ENSCGRG00000015351	Npm3	63	54.902	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000002553	npm3	100	76.331	ENSCSEG00000007944	npm3	100	79.290	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000002553	npm3	78	80.000	ENSCVAG00000003305	npm3	100	71.687	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000002553	npm3	99	69.753	ENSDARG00000103594	npm3	99	70.370	Danio_rerio
ENSSPAG00000002553	npm3	92	50.336	ENSDORG00000003491	Npm3	64	50.442	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000002553	npm3	92	45.638	ENSETEG00000006307	NPM3	63	49.558	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000002553	npm3	90	50.000	ENSEASG00005008834	NPM3	64	51.327	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000002553	npm3	90	50.000	ENSECAG00000007524	NPM3	64	51.327	Equus_caballus
ENSSPAG00000002553	npm3	77	84.000	ENSELUG00000021730	npm3	92	74.194	Esox_lucius
ENSSPAG00000002553	npm3	93	48.667	ENSFCAG00000007178	NPM3	65	50.000	Felis_catus
ENSSPAG00000002553	npm3	98	46.835	ENSFALG00000008586	NPM3	97	45.283	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000002553	npm3	65	50.943	ENSFDAG00000016537	NPM3	70	56.164	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000002553	npm3	83	82.836	ENSFHEG00000003983	npm3	100	75.926	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000002553	npm3	96	76.282	ENSGMOG00000004317	npm3	98	77.273	Gadus_morhua
ENSSPAG00000002553	npm3	64	52.885	ENSGALG00000032329	NPM3	70	52.885	Gallus_gallus
ENSSPAG00000002553	npm3	77	77.600	ENSGAFG00000009135	npm3	100	74.074	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000002553	npm3	98	74.545	ENSGACG00000007294	npm3	96	73.939	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000002553	npm3	85	47.445	ENSGAGG00000004081	NPM3	57	51.515	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSGGOG00000027500	NPM3	83	49.660	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000002553	npm3	100	85.185	ENSHBUG00000023704	npm3	100	83.951	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000002553	npm3	73	50.847	ENSHGLG00000019118	NPM3	68	51.754	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000002553	npm3	65	53.333	ENSHGLG00100010926	NPM3	79	54.455	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000002553	npm3	100	69.277	ENSHCOG00000019322	npm3	98	70.482	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000002553	npm3	99	70.807	ENSIPUG00000008204	npm3	99	70.807	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000002553	npm3	94	47.059	ENSSTOG00000022621	NPM3	66	50.427	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000002553	npm3	73	50.847	ENSJJAG00000018907	Npm3	64	51.754	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000002553	npm3	99	80.357	ENSKMAG00000020800	npm3	99	80.473	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000002553	npm3	100	83.333	ENSLBEG00000015651	npm3	100	83.333	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000002553	npm3	100	67.683	ENSLOCG00000000705	-	99	66.463	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000002553	npm3	91	48.980	ENSLAFG00000023022	NPM3	70	50.877	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSMFAG00000041878	NPM3	83	49.660	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000002553	npm3	87	51.064	ENSMMUG00000015774	NPM3	79	51.064	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSMNEG00000039999	NPM3	83	49.660	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSMLEG00000038129	NPM3	83	49.660	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000002553	npm3	99	83.851	ENSMAMG00000002698	npm3	99	83.851	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000002553	npm3	100	88.889	ENSMZEG00005003091	npm3	100	85.185	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000002553	npm3	70	50.877	ENSMAUG00000015218	Npm3	64	51.786	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000002553	npm3	95	48.701	ENSMICG00000044119	NPM3	64	50.877	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000002553	npm3	91	47.619	ENSMOCG00000013601	Npm3	65	50.893	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000002553	npm3	100	85.802	ENSMMOG00000010681	npm3	100	85.802	Mola_mola
ENSSPAG00000002553	npm3	91	45.946	ENSMODG00000011689	NPM3	64	52.679	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000002553	npm3	100	78.235	ENSMALG00000016787	npm3	100	75.882	Monopterus_albus
ENSSPAG00000002553	npm3	73	48.305	MGP_CAROLIEiJ_G0023020	Npm3	64	50.000	Mus_caroli
ENSSPAG00000002553	npm3	73	47.458	ENSMUSG00000056209	Npm3	64	49.107	Mus_musculus
ENSSPAG00000002553	npm3	73	48.305	MGP_PahariEiJ_G0014510	Npm3	64	50.000	Mus_pahari
ENSSPAG00000002553	npm3	73	48.305	MGP_SPRETEiJ_G0023941	Npm3	64	50.000	Mus_spretus
ENSSPAG00000002553	npm3	73	50.000	ENSMPUG00000016894	NPM3	64	50.877	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000002553	npm3	92	47.651	ENSMLUG00000004961	NPM3	64	50.442	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000002553	npm3	90	50.685	ENSNGAG00000022833	-	65	51.754	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000002553	npm3	70	49.123	ENSNGAG00000000155	-	70	49.123	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000002553	npm3	62	90.099	ENSNBRG00000009627	npm3	71	84.158	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000002553	npm3	91	47.619	ENSNLEG00000018637	-	63	49.107	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSNLEG00000029281	-	83	49.660	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000002553	npm3	61	43.434	ENSMEUG00000004931	-	91	46.067	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000002553	npm3	61	43.434	ENSMEUG00000002619	-	100	43.434	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000002553	npm3	65	54.717	ENSMEUG00000003465	-	83	53.913	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000002553	npm3	91	48.299	ENSOPRG00000009229	NPM3	64	50.877	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000002553	npm3	94	47.368	ENSODEG00000006704	NPM3	71	49.580	Octodon_degus
ENSSPAG00000002553	npm3	100	81.098	ENSONIG00000009513	npm3	99	83.537	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000002553	npm3	91	48.980	ENSOCUG00000016819	NPM3	64	50.877	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000002553	npm3	99	76.250	ENSORLG00000008492	npm3	100	74.375	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000002553	npm3	99	76.875	ENSORLG00020002450	npm3	100	75.000	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000002553	npm3	99	77.500	ENSORLG00015006856	npm3	100	75.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000002553	npm3	99	77.778	ENSOMEG00000002666	npm3	100	79.012	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000002553	npm3	96	48.387	ENSOGAG00000010001	NPM3	64	50.877	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000002553	npm3	100	45.562	ENSOARG00000016916	NPM3	65	50.877	Ovis_aries
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSPPAG00000040517	NPM3	83	49.660	Pan_paniscus
ENSSPAG00000002553	npm3	93	48.667	ENSPPRG00000012611	-	65	50.000	Panthera_pardus
ENSSPAG00000002553	npm3	93	48.667	ENSPTIG00000005390	NPM3	65	50.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSPTRG00000002875	NPM3	83	49.660	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSPANG00000021046	NPM3	83	49.660	Papio_anubis
ENSSPAG00000002553	npm3	98	53.165	ENSPKIG00000007609	npm3	65	62.810	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000002553	npm3	88	80.000	ENSPMGG00000020204	npm3	99	78.528	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000002553	npm3	90	48.630	ENSPEMG00000007731	Npm3	64	50.893	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000002553	npm3	78	80.315	ENSPFOG00000014692	npm3	100	77.301	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000002553	npm3	78	80.315	ENSPLAG00000009956	npm3	100	77.301	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000002553	npm3	68	83.036	ENSPMEG00000011795	npm3	98	76.871	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000002553	npm3	78	79.528	ENSPREG00000020765	npm3	100	76.074	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000002553	npm3	73	50.000	ENSPPYG00000002589	NPM3	55	50.877	Pongo_abelii
ENSSPAG00000002553	npm3	95	48.701	ENSPCOG00000014704	NPM3	64	50.877	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000002553	npm3	90	50.000	ENSPVAG00000004038	NPM3	64	51.327	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000002553	npm3	100	88.889	ENSPNYG00000009300	npm3	100	84.568	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000002553	npm3	99	72.050	ENSPNAG00000014779	npm3	99	72.050	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000002553	npm3	73	49.153	ENSRNOG00000017622	Npm3	65	50.893	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000002553	npm3	70	50.877	ENSRBIG00000039086	-	64	50.877	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000002553	npm3	73	48.739	ENSRBIG00000042048	-	70	48.739	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000002553	npm3	70	50.877	ENSRROG00000029912	NPM3	64	50.877	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000002553	npm3	73	50.000	ENSSBOG00000027661	NPM3	67	50.877	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000002553	npm3	91	48.649	ENSSHAG00000008567	NPM3	64	50.000	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000002553	npm3	99	66.460	ENSSFOG00015013651	npm3	99	66.460	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000002553	npm3	100	81.481	ENSSMAG00000003907	npm3	100	80.247	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000002553	npm3	100	83.951	ENSSDUG00000022843	npm3	100	83.951	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000002553	npm3	100	83.951	ENSSLDG00000002811	npm3	100	83.951	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000002553	npm3	87	49.655	ENSSPUG00000011875	NPM3	89	48.611	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000002553	npm3	94	47.368	ENSSSCG00000010568	NPM3	68	47.899	Sus_scrofa
ENSSPAG00000002553	npm3	64	52.885	ENSTGUG00000009948	NPM3	79	52.885	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000002553	npm3	100	80.864	ENSTRUG00000011661	npm3	100	79.012	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000002553	npm3	81	83.969	ENSTNIG00000016518	npm3	72	84.921	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPAG00000002553	npm3	91	50.340	ENSVPAG00000003120	NPM3	65	50.877	Vicugna_pacos
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.660	ENSVVUG00000000945	NPM3	56	50.877	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000002553	npm3	91	49.677	ENSXETG00000014472	npm3	65	54.955	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000002553	npm3	96	77.358	ENSXCOG00000012121	npm3	99	73.939	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000002553	npm3	96	77.358	ENSXMAG00000013473	npm3	99	73.939	Xiphophorus_maculatus