EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000005103 (Gene tree)
Gene ID: 103357237
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8667 bases
Position: chrKK580312.1:602068-610734
Accession: 103357237
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000006641	SRP54	PF00448.22	3.9e-48	1	1
ENSSPAP00000006676	SRP54	PF00448.22	4e-48	1	1
ENSSPAP00000006641	SRP54_N	PF02881.19	7.2e-10	1	1
ENSSPAP00000006676	SRP54_N	PF02881.19	7.5e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000006778	-	3414	XM_008281693	ENSSPAP00000006641	652 (aa)	XP_008279915	UPI000496A5CC
ENSSPAT00000006814	-	1926	-	ENSSPAP00000006676	641 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000005103's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000005103's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.830	ENSG00000182934	SRPRA	100	66.616	Homo_sapiens
ENSSPAG00000005103	srpra	100	96.166	ENSAPOG00000017588	srpra	100	96.166	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.781	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	66.818	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000005103	srpra	100	87.883	ENSACIG00000021588	srpra	100	88.804	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	96.012	ENSAOCG00000018884	srpra	100	96.012	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000005103	srpra	100	96.012	ENSAPEG00000022286	srpra	92	96.012	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000005103	srpra	100	90.812	ENSATEG00000023578	srpra	100	90.965	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000005103	srpra	94	70.569	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	70.244	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000005103	srpra	100	69.757	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	70.365	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.678	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	66.768	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000005103	srpra	100	90.337	ENSACLG00000000518	srpra	100	90.184	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000005103	srpra	87	86.423	ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.853	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.428	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	66.972	Bos_taurus
ENSSPAG00000005103	srpra	99	49.023	WBGene00009521	F38A1.8	99	48.421	Caenorhabditis_elegans
ENSSPAG00000005103	srpra	100	68.134	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	67.223	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	66.055	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	64.643	Canis_familiaris
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.737	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	66.313	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.890	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	66.972	Capra_hircus
ENSSPAG00000005103	srpra	81	79.614	ENSTSYG00000005187	SRPRA	94	86.984	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000005103	srpra	95	64.839	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	88.722	Cavia_aperea
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.732	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	88.722	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.737	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	66.565	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.884	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	67.071	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.678	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.768	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.732	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.920	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000005103	srpra	58	86.735	ENSCHOG00000010015	-	73	86.735	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000005103	srpra	100	69.970	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	66.038	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000005103	srpra	99	58.600	ENSCING00000008954	-	100	56.949	Ciona_intestinalis
ENSSPAG00000005103	srpra	99	59.271	ENSCSAVG00000005602	-	100	59.271	Ciona_savignyi
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.732	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	67.071	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.530	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	66.413	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.530	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.148	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000005103	srpra	100	87.939	ENSCSEG00000002374	srpra	100	87.176	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000005103	srpra	100	88.092	ENSCVAG00000019881	srpra	100	88.244	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	79.148	ENSDARG00000061124	srpra	100	79.148	Danio_rerio
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.625	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	66.667	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	68.085	ENSDORG00000016719	Srpr	100	67.275	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000005103	srpra	99	51.835	FBgn0010391	Gtp-bp	100	53.211	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000005103	srpra	100	66.515	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	66.061	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000005103	srpra	50	82.716	ENSEBUG00000002602	srpra	92	71.178	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000005103	srpra	100	68.397	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	67.481	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	68.397	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	67.481	Equus_caballus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	62.748	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	62.557	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	85.583	ENSELUG00000017643	srpra	100	86.043	Esox_lucius
ENSSPAG00000005103	srpra	80	61.887	ENSFCAG00000030894	-	99	61.278	Felis_catus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.629	ENSFCAG00000011274	-	100	67.121	Felis_catus
ENSSPAG00000005103	srpra	99	68.865	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.643	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.786	ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	89.394	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.127	ENSFHEG00000016959	srpra	100	89.433	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	82.110	ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.902	Gadus_morhua
ENSSPAG00000005103	srpra	100	70.579	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	69.924	Gallus_gallus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.571	ENSGAFG00000000453	srpra	100	87.883	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000005103	srpra	100	86.107	ENSGACG00000006550	srpra	100	85.583	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	69.382	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	70.348	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.830	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	66.616	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000005103	srpra	100	90.184	ENSHBUG00000000119	srpra	100	90.031	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.378	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	89.394	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.378	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	89.394	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000005103	srpra	100	87.023	ENSHCOG00000010749	srpra	99	89.503	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000005103	srpra	94	75.649	ENSIPUG00000000867	srpra	99	74.756	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.737	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	66.768	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.737	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	67.071	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	88.838	ENSKMAG00000002280	srpra	100	89.602	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	90.184	ENSLBEG00000009608	srpra	100	90.965	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000005103	srpra	100	70.739	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	71.386	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000005103	srpra	100	77.591	ENSLOCG00000002733	srpra	100	76.829	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.176	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	66.819	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.884	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	67.071	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.884	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	67.071	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.890	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	67.071	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.884	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	67.071	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.264	ENSMAMG00000000473	srpra	100	89.877	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	90.337	ENSMZEG00005013432	srpra	100	90.184	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000005103	srpra	94	70.473	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	69.771	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000005103	srpra	100	66.867	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	66.819	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	66.416	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	66.920	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.481	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	66.667	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000005103	srpra	100	81.069	ENSMMOG00000005019	srpra	100	80.213	Mola_mola
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.939	ENSMODG00000004576	-	100	67.123	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000005103	srpra	100	91.411	ENSMALG00000011343	srpra	100	91.411	Monopterus_albus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.890	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	90.152	Mus_caroli
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.580	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	89.394	Mus_musculus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.580	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	89.394	Mus_pahari
ENSSPAG00000005103	srpra	85	82.759	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	63.861	Mus_spretus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.982	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	66.768	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.534	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	66.413	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.584	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	66.464	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.877	ENSNBRG00000017311	srpra	100	89.724	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000005103	srpra	99	64.275	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.083	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000005103	srpra	94	66.829	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	65.964	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000005103	srpra	100	64.832	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.914	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.830	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	66.768	Octodon_degus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.877	ENSONIG00000005324	srpra	100	89.724	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	68.493	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	67.830	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	86.810	ENSORLG00000014676	srpra	94	97.264	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000005103	srpra	100	86.963	ENSORLG00020009240	srpra	100	86.503	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000005103	srpra	100	86.656	ENSORLG00015015405	srpra	100	86.196	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000005103	srpra	100	87.136	ENSOMEG00000005872	srpra	100	86.677	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.674	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	66.767	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000005103	srpra	100	64.939	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	64.526	Ovis_aries
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.830	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	66.616	Pan_paniscus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.629	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	67.121	Panthera_pardus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.477	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	66.970	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.830	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	66.616	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.884	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	67.071	Papio_anubis
ENSSPAG00000005103	srpra	100	76.524	ENSPKIG00000016106	srpra	100	76.677	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000005103	srpra	94	70.195	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	70.016	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000005103	srpra	100	85.605	ENSPMGG00000001393	srpra	100	84.992	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.378	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	66.667	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000005103	srpra	99	62.232	ENSPMAG00000009559	srpra	99	62.901	Petromyzon_marinus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.683	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	67.173	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.724	ENSPFOG00000003114	srpra	100	90.337	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.724	ENSPLAG00000007323	srpra	100	90.337	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.571	ENSPMEG00000015658	srpra	100	90.184	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000005103	srpra	100	90.337	ENSPREG00000004937	srpra	100	90.337	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000005103	srpra	89	85.526	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	85.526	Pongo_abelii
ENSSPAG00000005103	srpra	66	89.922	ENSPCAG00000003801	-	62	89.922	Procavia_capensis
ENSSPAG00000005103	srpra	100	66.416	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	66.616	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.378	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	66.819	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	90.337	ENSPNYG00000012371	srpra	100	90.184	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000005103	srpra	100	78.440	ENSPNAG00000013476	srpra	100	79.205	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.530	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	66.261	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.982	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	67.071	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.884	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	67.071	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000005103	srpra	51	41.860	YDR292C	-	52	42.249	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.527	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.616	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000005103	srpra	94	66.775	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.909	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000005103	srpra	100	73.561	ENSSFOG00015008837	srpra	100	75.039	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	78.746	ENSSMAG00000002783	srpra	96	89.071	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	91.590	ENSSDUG00000013920	srpra	92	91.590	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000005103	srpra	100	91.284	ENSSLDG00000008601	srpra	93	91.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000005103	srpra	82	82.927	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	Sorex_araneus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	68.341	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	67.841	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	68.189	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.223	Sus_scrofa
ENSSPAG00000005103	srpra	94	69.318	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	68.293	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000005103	srpra	100	87.423	ENSTRUG00000006856	srpra	93	95.556	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000005103	srpra	100	81.955	ENSTNIG00000010316	srpra	100	81.955	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPAG00000005103	srpra	100	68.134	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	67.781	Tursiops_truncatus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.830	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	66.768	Ursus_americanus
ENSSPAG00000005103	srpra	96	61.538	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	61.371	Ursus_maritimus
ENSSPAG00000005103	srpra	69	89.922	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	89.922	Vicugna_pacos
ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.737	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	66.616	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000005103	srpra	100	60.979	ENSXETG00000003920	srpra	100	61.538	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000005103	srpra	100	78.409	ENSXCOG00000001286	srpra	98	97.460	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.571	ENSXMAG00000028401	srpra	100	89.571	Xiphophorus_maculatus