EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000005946 (Gene tree)
Gene ID: 103362703
Gene Symbol: tardbp
Alias: wu:fb77f02|wu:fc52g10
Full Name: TAR DNA-binding protein 43-like
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4807 bases
Position: chrKK580085.1:110240-115046
Accession: 103362703
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000007777	RRM_1	PF00076.22	1.3e-28	1	2
ENSSPAP00000007777	RRM_1	PF00076.22	1.3e-28	2	2
ENSSPAP00000007789	RRM_1	PF00076.22	1.6e-28	1	2
ENSSPAP00000007789	RRM_1	PF00076.22	1.6e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000007939	-	1934	XM_008289143	ENSSPAP00000007789	402 (aa)	XP_008287365	UPI0004975BA4
ENSSPAT00000007926	-	756	-	ENSSPAP00000007777	251 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000005946	tardbp	80	40.288	ENSSPAG00000021014	hnrnpd	62	40.288
ENSSPAG00000005946	tardbp	63	34.395	ENSSPAG00000013787	hnrnpaba	53	34.395
ENSSPAG00000005946	tardbp	87	30.070	ENSSPAG00000013098	-	51	39.286
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	90.795	ENSSPAG00000009970	tardbpl	90	91.011
ENSSPAG00000005946	tardbp	57	34.146	ENSSPAG00000001196	-	75	32.990
ENSSPAG00000005946	tardbp	71	33.511	ENSSPAG00000005377	-	81	33.040
ENSSPAG00000005946	tardbp	57	34.146	ENSSPAG00000021157	-	75	32.990
ENSSPAG00000005946	tardbp	59	35.443	ENSSPAG00000017793	msi2a	61	34.783
ENSSPAG00000005946	tardbp	57	31.847	ENSSPAG00000018518	-	51	31.847
ENSSPAG00000005946	tardbp	53	33.548	ENSSPAG00000002402	dazap1	51	33.516

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	85.957	ENSG00000120948	TARDBP	99	86.364	Homo_sapiens
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	90.377	ENSAPOG00000012879	tardbpl	90	90.262	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	99.005	ENSAPOG00000002526	tardbp	100	99.005	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSAMEG00000009476	TARDBP	99	76.214	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	61.277	ENSAMEG00000008772	-	97	62.452	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.121	ENSACIG00000003327	tardbpl	100	76.238	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	99.254	ENSACIG00000009109	tardbp	100	99.254	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	99.254	ENSAOCG00000002631	tardbp	100	99.254	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	90.377	ENSAOCG00000020211	tardbpl	90	90.262	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	99.254	ENSAPEG00000002615	tardbp	100	99.254	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	90.377	ENSAPEG00000018093	tardbpl	90	90.262	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	99.254	ENSATEG00000024840	tardbp	100	99.254	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.958	ENSATEG00000017658	tardbpl	90	90.262	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSAPLG00000006001	TARDBP	99	76.942	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSANAG00000035249	-	97	87.218	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000005946	tardbp	81	75.610	ENSANAG00000027281	-	99	75.610	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.121	ENSACLG00000025494	tardbpl	90	89.513	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	99.254	ENSACLG00000013961	tardbp	100	99.254	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	88.115	ENSAMXG00000030795	tardbpl	100	80.000	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	90.574	ENSAMXG00000039549	tardbp	100	81.418	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.660	ENSBTAG00000003697	TARDBP	92	86.861	Bos_taurus
ENSSPAG00000005946	tardbp	92	37.828	WBGene00006514	tdp-1	68	37.589	Caenorhabditis_elegans
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSCJAG00000002381	TARDBP	97	87.218	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSCAFG00000016759	TARDBP	99	76.456	Canis_familiaris
ENSSPAG00000005946	tardbp	93	69.957	ENSCAFG00020013548	-	99	70.385	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSCAFG00020002258	-	93	84.859	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.660	ENSCHIG00000026090	TARDBP	92	86.861	Capra_hircus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSTSYG00000004077	TARDBP	93	84.507	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	86.809	ENSCAPG00000015189	TARDBP	93	84.507	Cavia_aperea
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	86.809	ENSCPOG00000011619	TARDBP	92	86.131	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	73.191	ENSCCAG00000010279	-	96	70.819	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSCCAG00000025859	-	93	84.507	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000005946	tardbp	88	71.622	ENSCCAG00000034419	-	95	71.784	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000005946	tardbp	85	74.648	ENSCATG00000029126	-	98	59.948	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	79.574	ENSCATG00000031367	TARDBP	99	71.845	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	86.809	ENSCLAG00000014547	TARDBP	93	84.507	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	85.532	ENSCSAG00000019136	-	99	75.243	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	85.957	ENSCSAG00000000785	-	99	75.485	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	73.191	ENSCHOG00000013276	-	96	72.385	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSCPBG00000022012	TARDBP	99	76.699	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000005946	tardbp	85	56.637	ENSCING00000000050	tardbp	62	55.596	Ciona_intestinalis
ENSSPAG00000005946	tardbp	85	55.947	ENSCSAVG00000008831	-	64	55.036	Ciona_savignyi
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	67.234	ENSCANG00000023420	-	91	56.250	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	85.957	ENSCANG00000030022	TARDBP	92	86.090	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	86.383	ENSCGRG00001010684	-	93	84.155	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	78.723	ENSCGRG00001015454	-	96	64.691	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	78.723	ENSCGRG00000002018	-	96	64.691	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	86.383	ENSCGRG00000007923	-	92	85.766	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	85.774	ENSCSEG00000005274	tardbpl	92	84.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	96.234	ENSCSEG00000021744	tardbp	100	90.796	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.540	ENSCVAG00000016647	tardbpl	90	89.888	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	96.517	ENSCVAG00000006178	tardbp	100	96.517	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.958	ENSDARG00000004452	tardbpl	90	90.262	Danio_rerio
ENSSPAG00000005946	tardbp	99	85.882	ENSDARG00000040031	tardbp	100	81.796	Danio_rerio
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSDNOG00000008531	TARDBP	92	86.496	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	85.106	ENSDORG00000007465	Tardbp	99	75.000	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000005946	tardbp	93	57.143	FBgn0025790	TBPH	86	55.517	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000005946	tardbp	93	53.556	FBgn0036496	CG7804	83	53.759	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000005946	tardbp	80	71.856	ENSETEG00000004358	TARDBP	100	74.328	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	77.406	ENSEBUG00000015638	tardbpl	84	56.957	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000005946	tardbp	65	58.537	ENSEBUG00000000353	-	72	52.734	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	58.943	ENSEBUG00000007562	-	88	58.943	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSEASG00005019017	TARDBP	94	87.234	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSECAG00000008338	TARDBP	92	86.496	Equus_caballus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSEEUG00000003755	TARDBP	99	76.456	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.958	ENSELUG00000013252	tardbpl	90	89.888	Esox_lucius
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	95.816	ENSELUG00000009090	tardbp	100	88.337	Esox_lucius
ENSSPAG00000005946	tardbp	73	77.622	ENSFCAG00000040067	-	73	78.313	Felis_catus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSFCAG00000000050	TARDBP	92	86.496	Felis_catus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSFALG00000007199	TARDBP	99	76.699	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	86.809	ENSFDAG00000004675	TARDBP	92	86.131	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	97.761	ENSFHEG00000019998	tardbp	100	97.761	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.958	ENSFHEG00000010145	tardbpl	90	90.262	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	89.356	ENSGMOG00000016367	tardbp	100	89.242	Gadus_morhua
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.540	ENSGMOG00000000526	tardbpl	90	89.591	Gadus_morhua
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	86.809	ENSGALG00000002906	TARDBP	99	76.699	Gallus_gallus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.540	ENSGAFG00000019234	tardbpl	100	76.238	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	97.512	ENSGAFG00000011052	tardbp	100	97.512	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	97.767	ENSGACG00000012164	tardbp	100	97.767	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	88.703	ENSGACG00000007124	tardbpl	90	88.764	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSGAGG00000009283	TARDBP	99	76.942	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	58.298	ENSGGOG00000042352	-	89	58.394	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000005946	tardbp	78	67.568	ENSGGOG00000028580	-	94	52.444	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000005946	tardbp	66	66.904	ENSGGOG00000015357	-	82	70.463	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.121	ENSHBUG00000020551	tardbpl	90	89.513	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	99.254	ENSHBUG00000002328	tardbp	100	99.254	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	86.383	ENSHGLG00000018967	TARDBP	93	84.155	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000005946	tardbp	52	75.385	ENSHGLG00000008540	-	100	74.627	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	86.383	ENSHGLG00100014781	TARDBP	93	84.155	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	77.447	ENSHGLG00100006769	-	99	69.704	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	88.703	ENSHCOG00000015858	tardbpl	98	85.315	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	90.864	ENSHCOG00000002224	tardbp	100	90.864	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	86.885	ENSIPUG00000004992	tardbp	90	87.500	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	91.736	ENSIPUG00000023818	TARDBP	100	83.292	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	78.298	ENSSTOG00000021089	-	99	71.359	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	86.383	ENSSTOG00000008406	-	92	85.766	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSJJAG00000014196	-	93	86.496	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.540	ENSKMAG00000015796	tardbpl	90	89.888	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	96.766	ENSKMAG00000005913	tardbp	87	96.766	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	88.703	ENSLBEG00000021801	tardbpl	90	88.848	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	97.022	ENSLBEG00000022827	tardbp	100	97.022	Labrus_bergylta
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ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSTBEG00000000263	TARDBP	99	75.795	Tupaia_belangeri
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSTTRG00000001312	TARDBP	99	76.399	Tursiops_truncatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSUAMG00000012355	TARDBP	99	76.699	Ursus_americanus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSUMAG00000023737	-	89	85.824	Ursus_maritimus
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	86.809	ENSVPAG00000009543	TARDBP	99	76.214	Vicugna_pacos
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.234	ENSVVUG00000027110	TARDBP	92	86.496	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000005946	tardbp	94	87.288	ENSXETG00000006317	tardbp	100	75.845	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	97.512	ENSXCOG00000013422	tardbp	100	97.512	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.540	ENSXCOG00000004686	tardbpl	100	76.733	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000005946	tardbp	100	97.512	ENSXMAG00000016713	tardbp	100	97.512	Xiphophorus_maculatus
ENSSPAG00000005946	tardbp	95	89.540	ENSXMAG00000011345	tardbpl	90	89.888	Xiphophorus_maculatus