EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000007811 (Gene tree)
Gene ID: 103363205
Gene Symbol: mrto4
Alias: fb71a02|wu:fb71a02|zgc:110388
Full Name: MRT4 homolog%2C ribosome maturation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5514 bases
Position: chrKK580085.1:1369925-1375438
Accession: 103363205
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000010272	Ribosomal_L10	PF00466.20	2.8e-20	1	1
ENSSPAP00000010261	Ribosomal_L10	PF00466.20	2.8e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000010452	-	1527	XM_008289860	ENSSPAP00000010272	239 (aa)	XP_008288082	UPI000495F687
ENSSPAT00000010441	-	723	-	ENSSPAP00000010261	240 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000007811's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000007811's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	77.169	ENSG00000053372	MRTO4	99	73.109	Homo_sapiens
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	94.690	ENSAPOG00000011387	mrto4	95	94.690	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000007811	mrto4	68	92.638	ENSAPOG00000013290	-	83	92.638	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000007811	mrto4	68	92.638	ENSAPOG00000013189	-	83	92.638	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	78.082	ENSAMEG00000003014	MRTO4	99	73.950	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000007811	mrto4	91	51.598	ENSAMEG00000014981	-	100	51.598	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	89.381	ENSACIG00000008213	mrto4	99	85.654	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000007811	mrto4	91	93.548	ENSAOCG00000006483	mrto4	91	89.912	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000007811	mrto4	97	93.133	ENSAPEG00000004866	mrto4	99	92.241	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	90.265	ENSATEG00000024976	mrto4	99	86.975	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000007811	mrto4	67	73.913	ENSAPLG00000013861	MRTO4	91	73.913	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.712	ENSANAG00000029674	MRTO4	99	72.996	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	90.708	ENSACLG00000016523	mrto4	97	88.793	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	80.617	ENSAMXG00000003899	mrto4	99	78.243	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	77.169	ENSBTAG00000011951	MRTO4	98	73.840	Bos_taurus
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	72.996	ENSCJAG00000006812	MRTO4	99	72.996	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	68.304	ENSCAFG00000000532	-	98	66.102	Canis_familiaris
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	76.339	ENSCAFG00000015189	-	98	73.729	Canis_familiaris
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	54.167	ENSCAFG00000009080	-	98	54.167	Canis_familiaris
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	76.339	ENSCAFG00020008173	MRTO4	98	73.729	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000007811	mrto4	89	56.132	ENSCHIG00000010639	-	91	56.132	Capra_hircus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	77.169	ENSCHIG00000014751	MRTO4	99	73.529	Capra_hircus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	75.342	ENSTSYG00000013413	MRTO4	99	72.269	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000007811	mrto4	83	72.864	ENSCAPG00000012648	MRTO4	93	70.283	Cavia_aperea
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	75.893	ENSCPOG00000033237	MRTO4	98	73.418	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.712	ENSCCAG00000036206	MRTO4	99	72.996	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000007811	mrto4	97	65.086	ENSCATG00000030492	-	100	65.086	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	74.449	ENSCLAG00000001997	MRTO4	99	72.689	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	74.886	ENSCSAG00000018596	-	99	71.008	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	77.315	ENSCSAG00000000876	-	99	72.269	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	79.452	ENSCPBG00000023562	MRTO4	99	75.104	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	56.303	ENSCSAVG00000011770	-	80	58.222	Ciona_savignyi
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.712	ENSCANG00000002395	-	99	72.689	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	70.776	ENSCANG00000005353	-	99	67.089	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	78.704	ENSCGRG00001005758	-	99	73.840	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	67.647	ENSCGRG00001001286	-	100	68.803	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	76.389	ENSCGRG00000010649	-	99	71.730	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	67.647	ENSCGRG00000001527	-	100	68.803	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	90.909	ENSCSEG00000021629	mrto4	98	86.920	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000007811	mrto4	98	87.179	ENSCVAG00000012249	mrto4	100	88.136	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	78.992	ENSDARG00000007130	mrto4	95	78.992	Danio_rerio
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	77.626	ENSDNOG00000010119	-	99	73.418	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000007811	mrto4	96	57.082	ENSDNOG00000045395	-	96	57.082	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000007811	mrto4	87	75.481	ENSDNOG00000030871	-	87	75.481	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	74.123	ENSDORG00000025382	Mrto4	99	71.730	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000007811	mrto4	100	72.385	ENSETEG00000001675	MRTO4	98	71.308	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	74.554	ENSEASG00005014967	MRTO4	98	72.574	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	75.446	ENSECAG00000012598	MRTO4	98	73.418	Equus_caballus
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	58.879	ENSEEUG00000013520	MRTO4	99	57.456	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000007811	mrto4	97	81.466	ENSELUG00000011152	mrto4	97	81.466	Esox_lucius
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	74.370	ENSFCAG00000008771	MRTO4	99	74.370	Felis_catus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	74.429	ENSFALG00000010619	MRTO4	100	71.548	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	74.890	ENSFDAG00000013300	MRTO4	99	73.950	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000007811	mrto4	91	90.367	ENSFHEG00000022920	mrto4	100	87.660	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000007811	mrto4	89	85.446	ENSGMOG00000001422	mrto4	100	83.913	Gadus_morhua
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	74.545	ENSGALG00000003991	MRTO4	99	72.103	Gallus_gallus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	90.909	ENSGAFG00000012570	mrto4	100	87.712	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	89.823	ENSGACG00000001672	mrto4	100	86.498	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000007811	mrto4	88	77.143	ENSGAGG00000012997	MRTO4	96	74.123	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000007811	mrto4	87	63.462	ENSGGOG00000042625	-	99	59.052	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000007811	mrto4	87	52.153	ENSGGOG00000036991	-	92	50.000	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	77.169	ENSGGOG00000000533	MRTO4	99	72.996	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	90.265	ENSHBUG00000009670	mrto4	97	88.362	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	74.449	ENSHGLG00000012157	MRTO4	99	73.109	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	74.449	ENSHGLG00100014484	MRTO4	99	73.109	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	82.278	ENSHCOG00000019894	mrto4	95	84.071	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	85.463	ENSIPUG00000002957	mrto4	99	82.353	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.256	ENSSTOG00000028112	MRTO4	99	72.152	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	75.926	ENSJJAG00000017998	Mrto4	100	70.417	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	88.496	ENSKMAG00000010148	mrto4	96	88.496	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000007811	mrto4	98	88.034	ENSLBEG00000025010	mrto4	100	88.511	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	78.539	ENSLACG00000019155	MRTO4	100	74.790	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000007811	mrto4	97	82.328	ENSLOCG00000004468	mrto4	96	80.169	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	77.626	ENSLAFG00000010416	MRTO4	99	73.950	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.712	ENSMFAG00000033225	-	99	72.689	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000007811	mrto4	93	58.482	ENSMMUG00000044851	-	99	55.696	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.712	ENSMMUG00000038335	MRTO4	99	72.689	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.712	ENSMNEG00000032783	-	99	72.689	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.712	ENSMLEG00000023273	-	99	72.689	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	89.823	ENSMAMG00000014839	mrto4	99	87.395	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	90.708	ENSMZEG00005013929	mrto4	97	88.793	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.256	ENSMGAG00000005361	MRTO4	97	74.026	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	78.704	ENSMAUG00000019627	-	99	73.840	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000007811	mrto4	86	68.293	ENSMICG00000033640	-	100	68.293	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	76.852	ENSMICG00000004019	MRTO4	100	71.667	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000007811	mrto4	71	75.740	ENSMOCG00000018413	Mrto4	98	70.526	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	87.168	ENSMMOG00000010735	mrto4	95	86.547	Mola_mola
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	78.082	ENSMODG00000015874	MRTO4	98	73.840	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	92.727	ENSMALG00000007769	mrto4	98	92.694	Monopterus_albus
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	79.167	MGP_CAROLIEiJ_G0026711	Mrto4	99	73.950	Mus_caroli
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	79.167	ENSMUSG00000028741	Mrto4	100	81.967	Mus_musculus
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	77.778	MGP_PahariEiJ_G0029042	Mrto4	99	72.996	Mus_pahari
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	79.167	MGP_SPRETEiJ_G0027691	Mrto4	99	73.950	Mus_spretus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	77.169	ENSMPUG00000016181	MRTO4	99	73.109	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	77.626	ENSMLUG00000001566	-	99	73.950	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	75.799	ENSMLUG00000025001	-	99	72.269	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	72.996	ENSNGAG00000011660	Mrto4	99	73.109	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	90.265	ENSNBRG00000021435	mrto4	97	88.362	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000007811	mrto4	82	60.396	ENSNLEG00000034965	-	95	67.429	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	68.354	ENSNLEG00000018006	-	100	67.089	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	68.950	ENSNLEG00000027896	-	99	65.546	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000007811	mrto4	69	79.878	ENSMEUG00000000027	MRTO4	100	79.878	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.712	ENSOPRG00000012746	MRTO4	99	73.840	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	70.089	ENSODEG00000014387	-	98	68.354	Octodon_degus
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	75.446	ENSODEG00000019157	-	98	73.418	Octodon_degus
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	75.893	ENSODEG00000015379	-	98	73.840	Octodon_degus
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	64.286	ENSODEG00000014016	-	86	62.288	Octodon_degus
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	70.982	ENSODEG00000011537	-	98	68.776	Octodon_degus
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	91.150	ENSONIG00000014318	mrto4	97	89.224	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000007811	mrto4	96	68.996	ENSOANG00000015345	MRTO4	90	72.430	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	72.152	ENSOCUG00000000274	MRTO4	98	72.152	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	91.364	ENSORLG00000027922	mrto4	99	87.815	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	91.364	ENSORLG00020019412	mrto4	99	87.395	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	91.364	ENSORLG00015015309	mrto4	99	87.815	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	92.273	ENSOMEG00000021110	mrto4	100	88.983	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.256	ENSOGAG00000010713	-	99	72.034	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000007811	mrto4	98	53.617	ENSOGAG00000027996	-	97	53.617	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	52.055	ENSPPAG00000039572	-	99	50.628	Pan_paniscus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	77.626	ENSPPAG00000043731	MRTO4	99	73.529	Pan_paniscus
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	73.109	ENSPPRG00000024765	MRTO4	99	73.109	Panthera_pardus
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	74.370	ENSPTIG00000016208	MRTO4	99	74.370	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	77.169	ENSPTRG00000000262	MRTO4	99	73.109	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	52.055	ENSPTRG00000046027	-	99	50.000	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	68.037	ENSPANG00000017838	-	99	64.706	Papio_anubis
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	70.776	ENSPANG00000011596	-	96	70.776	Papio_anubis
ENSSPAG00000007811	mrto4	89	86.385	ENSPKIG00000017917	mrto4	100	81.250	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000007811	mrto4	72	77.907	ENSPSIG00000015125	MRTO4	98	72.632	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	82.273	ENSPMGG00000013461	mrto4	99	80.252	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	73.059	ENSPEMG00000023720	-	99	68.465	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	78.704	ENSPEMG00000010459	-	99	73.529	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	76.712	ENSPCIG00000003652	MRTO4	98	72.727	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	92.273	ENSPFOG00000013266	mrto4	98	90.171	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	92.273	ENSPLAG00000016285	mrto4	98	90.171	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	91.818	ENSPMEG00000003539	mrto4	100	88.608	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	90.909	ENSPREG00000006249	mrto4	100	87.342	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	77.169	ENSPPYG00000001795	MRTO4	99	73.109	Pongo_abelii
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	69.406	ENSPCAG00000001458	MRTO4	100	66.387	Procavia_capensis
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	71.548	ENSPCOG00000014182	MRTO4	99	72.689	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	75.799	ENSPVAG00000005775	MRTO4	99	72.269	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	90.265	ENSPNYG00000018672	mrto4	97	88.362	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	81.858	ENSPNAG00000027733	mrto4	99	79.325	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000007811	mrto4	71	76.331	ENSRNOG00000017979	Mrto4	98	70.526	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	75.799	ENSRBIG00000036806	-	99	71.849	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000007811	mrto4	80	70.681	ENSRBIG00000036159	-	99	66.667	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000007811	mrto4	93	62.500	ENSRBIG00000013434	-	99	59.746	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	75.342	ENSRROG00000011593	-	95	71.429	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	75.799	ENSRROG00000042838	-	99	71.849	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	73.059	ENSRROG00000037374	-	99	69.328	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	71.967	ENSSBOG00000022924	MRTO4	98	72.766	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000007811	mrto4	93	73.661	ENSSHAG00000008423	MRTO4	97	72.807	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000007811	mrto4	93	85.202	ENSSFOG00015006887	mrto4	99	81.435	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	92.035	ENSSMAG00000014393	mrto4	100	88.703	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	92.478	ENSSDUG00000015362	mrto4	95	92.478	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	92.035	ENSSLDG00000015813	mrto4	95	92.035	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	72.803	ENSSARG00000012700	MRTO4	99	72.803	Sorex_araneus
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	78.390	ENSSPUG00000001110	MRTO4	99	78.723	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000007811	mrto4	90	77.315	ENSSSCG00000034814	MRTO4	100	71.784	Sus_scrofa
ENSSPAG00000007811	mrto4	76	75.691	ENSTGUG00000016935	MRTO4	98	75.691	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	88.496	ENSTRUG00000019838	mrto4	97	87.500	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000007811	mrto4	95	90.708	ENSTNIG00000014802	mrto4	99	87.712	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	75.799	ENSTTRG00000014203	MRTO4	99	72.269	Tursiops_truncatus
ENSSPAG00000007811	mrto4	88	77.143	ENSUAMG00000026191	MRTO4	92	72.926	Ursus_americanus
ENSSPAG00000007811	mrto4	99	73.950	ENSUMAG00000018964	MRTO4	99	73.840	Ursus_maritimus
ENSSPAG00000007811	mrto4	94	76.339	ENSVVUG00000029432	MRTO4	98	73.729	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000007811	mrto4	92	74.886	ENSXETG00000020828	mrto4	98	72.034	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000007811	mrto4	98	90.598	ENSXCOG00000013521	mrto4	100	90.598	Xiphophorus_couchianus