EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000008898 (Gene tree)
Gene ID: 103357820
Gene Symbol: srprb
Alias: wu:fk57h10|zgc:111820|zgc:92746
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6527 bases
Position: chrKK580346.1:293655-300181
Accession: 103357820
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000011732	MMR_HSR1	PF01926.23	4.9e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000011937	-	3818	XM_008282535	ENSSPAP00000011732	277 (aa)	XP_008280757	UPI00049762AD

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000008898's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000008898's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000008898	srprb	62	30.409	ENSSPAG00000011431	-	88	30.409
ENSSPAG00000008898	srprb	69	30.526	ENSSPAG00000007465	arf2b	96	30.526

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000008898	srprb	100	95.307	ENSAPOG00000021219	srprb	100	95.307	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000008898	srprb	97	90.672	ENSACIG00000014621	srprb	100	90.672	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000008898	srprb	100	94.946	ENSAOCG00000017265	srprb	100	94.946	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000008898	srprb	100	94.946	ENSAPEG00000024541	srprb	88	94.946	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000008898	srprb	100	87.365	ENSATEG00000014016	srprb	100	87.365	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000008898	srprb	100	91.007	ENSACLG00000016748	srprb	100	91.007	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000008898	srprb	97	71.642	ENSAMXG00000044118	srprb	100	71.642	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000008898	srprb	100	84.838	ENSCSEG00000017194	srprb	100	84.838	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000008898	srprb	95	88.973	ENSCVAG00000004221	srprb	99	88.973	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000008898	srprb	97	69.776	ENSDARG00000030949	srprb	100	69.776	Danio_rerio
ENSSPAG00000008898	srprb	100	79.061	ENSELUG00000009740	srprb	100	79.061	Esox_lucius
ENSSPAG00000008898	srprb	97	88.060	ENSFHEG00000006004	srprb	100	88.060	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000008898	srprb	98	81.550	ENSGMOG00000002081	srprb	99	81.550	Gadus_morhua
ENSSPAG00000008898	srprb	95	86.692	ENSGAFG00000012593	srprb	99	86.692	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000008898	srprb	98	88.235	ENSGACG00000009891	srprb	99	88.235	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000008898	srprb	100	91.007	ENSHBUG00000002145	srprb	100	91.007	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000008898	srprb	98	82.657	ENSHCOG00000007732	srprb	99	82.657	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000008898	srprb	91	70.238	ENSIPUG00000004177	srprb	94	70.238	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000008898	srprb	95	86.641	ENSKMAG00000020736	srprb	100	85.448	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000008898	srprb	100	86.643	ENSLBEG00000021483	srprb	100	86.643	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000008898	srprb	94	71.923	ENSLOCG00000009740	srprb	87	72.308	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000008898	srprb	100	89.531	ENSMAMG00000011876	srprb	100	89.531	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000008898	srprb	93	91.892	ENSMZEG00005016621	srprb	100	91.892	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000008898	srprb	97	87.778	ENSMMOG00000012550	srprb	99	87.778	Mola_mola
ENSSPAG00000008898	srprb	100	86.643	ENSMALG00000012595	srprb	100	86.643	Monopterus_albus
ENSSPAG00000008898	srprb	75	90.865	ENSNBRG00000004699	srprb	95	85.088	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000008898	srprb	100	90.614	ENSONIG00000003788	srprb	82	90.614	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000008898	srprb	98	82.657	ENSORLG00000006430	srprb	98	82.657	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000008898	srprb	100	81.588	ENSORLG00020003413	srprb	100	81.588	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000008898	srprb	100	81.588	ENSORLG00015000166	srprb	100	81.588	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000008898	srprb	100	81.949	ENSOMEG00000012735	srprb	100	81.949	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000008898	srprb	90	70.916	ENSPKIG00000013147	srprb	95	70.916	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000008898	srprb	100	80.866	ENSPMGG00000014061	srprb	100	80.866	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000008898	srprb	95	87.072	ENSPFOG00000011347	srprb	95	87.072	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000008898	srprb	93	88.372	ENSPLAG00000001156	srprb	100	88.372	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000008898	srprb	93	87.597	ENSPMEG00000012169	srprb	100	87.597	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000008898	srprb	93	87.209	ENSPREG00000001449	srprb	100	87.209	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000008898	srprb	100	91.007	ENSPNYG00000005911	srprb	100	91.007	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000008898	srprb	97	72.388	ENSPNAG00000009983	srprb	100	72.388	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000008898	srprb	91	74.803	ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.803	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000008898	srprb	100	88.809	ENSSMAG00000013202	srprb	100	88.809	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000008898	srprb	100	92.058	ENSSDUG00000018746	srprb	94	92.058	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000008898	srprb	100	91.697	ENSSLDG00000020560	srprb	100	91.697	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000008898	srprb	100	85.560	ENSTRUG00000022463	srprb	100	85.560	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000008898	srprb	94	81.609	ENSTNIG00000007725	srprb	99	81.609	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPAG00000008898	srprb	93	88.372	ENSXCOG00000012585	srprb	100	88.372	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000008898	srprb	93	87.984	ENSXMAG00000028725	srprb	100	87.984	Xiphophorus_maculatus