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Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000009569 (Gene tree)
Gene ID: 103358447
Gene Symbol: celf1
Alias: Bruno-like|brul|cb920|cugbp1
Full Name: CUGBP Elav-like family member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19556 bases
Position: chrKK580382.1:307615-327170
Accession: 103358447
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000012683	RRM_1	PF00076.22	3.8e-50	1	3
ENSSPAP00000012683	RRM_1	PF00076.22	3.8e-50	2	3
ENSSPAP00000012683	RRM_1	PF00076.22	3.8e-50	3	3
ENSSPAP00000012707	RRM_1	PF00076.22	4.9e-50	1	3
ENSSPAP00000012707	RRM_1	PF00076.22	4.9e-50	2	3
ENSSPAP00000012707	RRM_1	PF00076.22	4.9e-50	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000012898	-	1386	-	ENSSPAP00000012683	461 (aa)	-	-
ENSSPAT00000012922	-	1470	XM_008283425	ENSSPAP00000012707	489 (aa)	XP_008281647	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000009569	celf1	59	39.506	ENSSPAG00000018867	elavl4	69	39.506
ENSSPAG00000009569	celf1	65	32.558	ENSSPAG00000017137	pabpc1l	52	32.558
ENSSPAG00000009569	celf1	67	35.714	ENSSPAG00000019265	pabpc1b	60	34.091
ENSSPAG00000009569	celf1	100	69.980	ENSSPAG00000005647	-	95	67.400
ENSSPAG00000009569	celf1	93	36.264	ENSSPAG00000013543	elavl1a	93	36.264
ENSSPAG00000009569	celf1	53	37.662	ENSSPAG00000022418	rbms2b	53	34.653
ENSSPAG00000009569	celf1	96	71.849	ENSSPAG00000007458	-	97	71.158
ENSSPAG00000009569	celf1	100	44.135	ENSSPAG00000021838	celf5a	68	60.000
ENSSPAG00000009569	celf1	64	42.105	ENSSPAG00000000990	elavl3	81	42.105
ENSSPAG00000009569	celf1	60	35.577	ENSSPAG00000009252	pabpc4	59	35.238
ENSSPAG00000009569	celf1	98	45.552	ENSSPAG00000019028	celf3b	99	53.763
ENSSPAG00000009569	celf1	67	46.154	ENSSPAG00000011250	-	96	34.940
ENSSPAG00000009569	celf1	98	37.860	ENSSPAG00000018307	celf4	59	53.957
ENSSPAG00000009569	celf1	58	40.741	ENSSPAG00000002388	ELAVL2	71	40.741
ENSSPAG00000009569	celf1	98	44.222	ENSSPAG00000013689	si:dkey-205h23.2	73	63.846
ENSSPAG00000009569	celf1	53	36.364	ENSSPAG00000000639	rbms2a	50	36.364

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSG00000149187	CELF1	100	88.421	Homo_sapiens
ENSSPAG00000009569	celf1	100	99.182	ENSAPOG00000024000	celf1	100	99.182	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.396	ENSAMEG00000007596	CELF1	95	84.381	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000009569	celf1	100	90.798	ENSACIG00000023843	celf1	100	90.798	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	98.978	ENSAOCG00000001252	celf1	100	98.978	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000009569	celf1	100	99.182	ENSAPEG00000002340	celf1	97	99.182	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000009569	celf1	100	89.775	ENSATEG00000010871	celf1	100	87.321	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.725	ENSACAG00000002114	CELF1	95	83.707	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSANAG00000031770	CELF1	95	84.178	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000009569	celf1	100	95.501	ENSACLG00000010181	-	95	95.501	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000009569	celf1	100	90.220	ENSAMXG00000020576	celf1	93	90.020	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSBTAG00000002520	CELF1	100	84.178	Bos_taurus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSCJAG00000020133	CELF1	95	85.193	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSCAFG00000008452	CELF1	95	84.178	Canis_familiaris
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSCAFG00020025487	CELF1	100	81.124	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.801	ENSCHIG00000024582	CELF1	95	84.787	Capra_hircus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSTSYG00000003866	CELF1	100	84.178	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000009569	celf1	99	62.423	ENSCAPG00000006787	CELF1	94	62.628	Cavia_aperea
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.990	ENSCPOG00000036381	CELF1	100	84.990	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSCCAG00000033487	CELF1	100	84.178	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSCATG00000040143	CELF1	100	85.193	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSCLAG00000011791	CELF1	100	81.339	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.396	ENSCSAG00000005786	CELF1	95	84.381	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000009569	celf1	61	97.872	ENSCHOG00000004196	-	68	97.872	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.051	ENSCPBG00000022914	CELF1	100	83.838	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.381	ENSCANG00000032689	CELF1	100	83.976	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.787	ENSCGRG00001011274	Celf1	95	83.773	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.787	ENSCGRG00000015357	Celf1	95	83.773	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000009569	celf1	100	80.612	ENSCSEG00000008675	celf1	100	83.669	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000009569	celf1	100	91.617	ENSDARG00000005315	celf1	100	95.858	Danio_rerio
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSDNOG00000009523	CELF1	100	85.193	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	75.051	ENSDORG00000013721	Celf1	96	74.949	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000009569	celf1	73	90.698	ENSETEG00000004507	CELF1	83	90.698	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000009569	celf1	100	76.673	ENSEASG00005010831	CELF1	94	78.093	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000009569	celf1	98	89.610	ENSECAG00000007741	CELF1	100	82.961	Equus_caballus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	70.994	ENSEEUG00000009782	CELF1	100	70.183	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	92.600	ENSELUG00000023173	celf1	100	91.400	Esox_lucius
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSFCAG00000002535	CELF1	100	84.178	Felis_catus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.318	ENSFALG00000006402	CELF1	95	84.318	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSFDAG00000008517	CELF1	100	85.193	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000009569	celf1	100	92.261	ENSGMOG00000012783	celf1	98	91.650	Gadus_morhua
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.521	ENSGALG00000008097	CELF1	100	84.521	Gallus_gallus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	90.200	ENSGACG00000014226	celf1	94	89.800	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.051	ENSGAGG00000011562	CELF1	100	83.503	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSGGOG00000004106	CELF1	95	85.193	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000009569	celf1	100	95.501	ENSHBUG00000017881	celf1	95	95.501	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.990	ENSHGLG00000006909	-	100	84.990	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000009569	celf1	100	78.543	ENSHGLG00000019214	-	100	77.033	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.990	ENSHGLG00100013863	-	100	84.990	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000009569	celf1	100	80.567	ENSHGLG00100017423	-	100	78.455	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000009569	celf1	100	92.449	ENSHCOG00000000258	celf1	100	91.633	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000009569	celf1	100	90.818	ENSIPUG00000023708	celf1	100	90.419	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSSTOG00000000613	CELF1	100	85.193	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSJJAG00000020280	Celf1	95	84.178	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	95.297	ENSLBEG00000018296	celf1	100	91.051	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000009569	celf1	70	93.842	ENSLBEG00000002047	-	98	92.669	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000009569	celf1	69	74.640	ENSLACG00000018990	CELF1	85	74.063	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000009569	celf1	100	89.200	ENSLOCG00000005966	celf1	94	88.800	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.787	ENSLAFG00000003484	CELF1	95	83.773	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSMFAG00000003505	CELF1	100	85.193	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.381	ENSMMUG00000011657	CELF1	99	83.976	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSMNEG00000022558	CELF1	100	85.193	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSMLEG00000040834	CELF1	100	83.976	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	91.002	ENSMAMG00000010052	celf1	100	91.002	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	95.501	ENSMZEG00005018307	celf1	95	95.501	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.929	ENSMGAG00000010629	CELF1	96	84.725	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.787	ENSMAUG00000009468	Celf1	100	84.787	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSMICG00000045113	CELF1	95	85.193	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.990	ENSMOCG00000012633	Celf1	100	84.990	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000009569	celf1	100	93.252	ENSMMOG00000015460	celf1	95	92.843	Mola_mola
ENSSPAG00000009569	celf1	100	86.207	ENSMODG00000019913	CELF1	100	85.193	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.990	MGP_CAROLIEiJ_G0023949	Celf1	100	84.990	Mus_caroli
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.990	ENSMUSG00000005506	Celf1	100	84.990	Mus_musculus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.990	MGP_PahariEiJ_G0025385	Celf1	100	84.990	Mus_pahari
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.787	MGP_SPRETEiJ_G0024859	Celf1	100	83.773	Mus_spretus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSMPUG00000003960	CELF1	88	84.178	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.274	ENSMLUG00000016631	CELF1	95	84.274	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	81.947	ENSNGAG00000017390	Celf1	95	82.353	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000009569	celf1	99	62.020	ENSNBRG00000023547	-	85	60.569	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.381	ENSNLEG00000014638	CELF1	100	83.976	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000009569	celf1	100	86.815	ENSMEUG00000007763	CELF1	100	85.801	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.787	ENSOPRG00000003239	-	100	83.773	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSODEG00000015204	CELF1	95	84.178	Octodon_degus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	94.888	ENSONIG00000008300	celf1	95	93.265	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	86.613	ENSOANG00000007896	CELF1	94	86.613	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.598	ENSOCUG00000001311	CELF1	95	84.584	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	87.247	ENSOMEG00000002381	celf1	100	86.558	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000009569	celf1	100	84.879	ENSOGAG00000011600	CELF1	95	84.879	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.801	ENSOARG00000006924	CELF1	100	84.787	Ovis_aries
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSPPAG00000033870	CELF1	100	85.193	Pan_paniscus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSPPRG00000002376	CELF1	100	84.178	Panthera_pardus
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSPTIG00000003974	CELF1	100	84.178	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSPTRG00000052299	CELF1	100	85.193	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	ENSPANG00000021676	CELF1	95	85.193	Papio_anubis
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ENSSPAG00000009569	celf1	100	82.470	ENSXETG00000009044	celf1	100	80.876	Xenopus_tropicalis
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